EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000005449 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30266 bases
Position: chrKI520314.1:20452-50717
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSPFOP00000005326	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-86	3	16
ENSPFOP00000005326	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-86	4	16
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ENSPFOP00000005326	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-86	6	16
ENSPFOP00000005326	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-86	7	16
ENSPFOP00000005326	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-86	8	16
ENSPFOP00000005326	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-86	9	16
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ENSPFOP00000005326	zf-C2H2	PF00096.26	3.8e-86	16	16
ENSPFOP00000005326	zf-met	PF12874.7	2.8e-40	1	8
ENSPFOP00000005326	zf-met	PF12874.7	2.8e-40	2	8
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ENSPFOP00000005326	zf-met	PF12874.7	2.8e-40	7	8
ENSPFOP00000005326	zf-met	PF12874.7	2.8e-40	8	8

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000005335	-	1656	-	ENSPFOP00000005326	552 (aa)	-	A0A087XHS3

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000005449	-	100	53.639	ENSPFOG00000020455	-	77	53.639
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ENSPFOG00000005449	-	99	38.976	ENSPFOG00000004805	znf668	88	42.857
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ENSPFOG00000005449	-	99	50.562	ENSPFOG00000024512	-	67	50.562
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