EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000007277 (Gene tree)
Gene ID: 103152355
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10514 bases
Position: chrKI519918.1:508164-518677
Accession: 103152355
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000007179	eRF1_2	PF03464.15	1.6e-34	1	1
ENSPFOP00000007179	eRF1_3	PF03465.15	1.4e-25	1	1
ENSPFOP00000007179	eRF1_1	PF03463.15	1e-52	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.299	ENSG00000152684	PELO	100	81.299	Homo_sapiens
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ENSPFOG00000007277	pelo	64	92.308	ENSAPOG00000023700	-	90	92.308	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	92.208	ENSAPOG00000023072	pelo	100	92.208	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.558	ENSAMEG00000007734	PELO	100	81.558	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000007277	pelo	97	89.008	ENSACIG00000014386	pelo	97	93.787	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	92.468	ENSAOCG00000023717	pelo	100	92.468	Amphiprion_ocellaris
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ENSPFOG00000007277	pelo	77	72.819	ENSAPLG00000013265	PELO	100	72.819	Anas_platyrhynchos
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ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.169	ENSACLG00000010305	pelo	100	91.169	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000007277	pelo	97	92.225	ENSAMXG00000020299	pelo	99	90.909	Astyanax_mexicanus
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ENSPFOG00000007277	pelo	99	61.155	WBGene00011280	pelo-1	100	61.155	Caenorhabditis_elegans
ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.299	ENSCJAG00000035190	PELO	100	81.299	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	ENSCAFG00020023234	PELO	100	81.818	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.039	ENSCHIG00000016410	PELO	99	81.039	Capra_hircus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	82.078	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.078	Carlito_syrichta
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ENSPFOG00000007277	pelo	100	82.078	ENSCHOG00000000523	PELO	100	82.078	Choloepus_hoffmanni
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ENSPFOG00000007277	pelo	97	82.038	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.078	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000007277	pelo	97	82.842	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	82.857	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000007277	pelo	100	91.688	ENSCSEG00000008807	pelo	100	91.688	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000007277	pelo	100	98.961	ENSCVAG00000016082	pelo	100	98.961	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	88.312	ENSDARG00000055477	pelo	100	88.312	Danio_rerio
ENSPFOG00000007277	pelo	100	78.497	ENSDNOG00000036721	PELO	100	78.497	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	83.377	ENSDORG00000016689	Pelo	100	83.377	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000007277	pelo	96	68.649	FBgn0011207	pelo	96	68.074	Drosophila_melanogaster
ENSPFOG00000007277	pelo	71	79.532	ENSEBUG00000004955	pelo	99	79.532	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	ENSEASG00005013348	PELO	100	81.818	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	90.390	ENSELUG00000023229	pelo	100	90.390	Esox_lucius
ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	ENSFCAG00000032341	PELO	100	81.818	Felis_catus
ENSPFOG00000007277	pelo	100	81.818	ENSFALG00000004559	PELO	100	81.818	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000007277	pelo	74	83.099	ENSFDAG00000002076	PELO	88	83.099	Fukomys_damarensis
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