EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000007871 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: htatsf1
Alias: -
Full Name: HIV Tat-specific factor 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18514 bases
Position: chrKI519613.1:1078742-1097255
Accession: 103139002
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000007900	RRM_1	PF00076.22	1.5e-14	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	64.286	ENSG00000102241	HTATSF1	100	58.943	Homo_sapiens
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	81.858	ENSAPOG00000009823	htatsf1	100	81.858	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	79.694	ENSACIG00000020459	htatsf1	100	82.159	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	80.828	ENSAOCG00000020994	htatsf1	100	81.481	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	81.579	ENSAPEG00000016432	htatsf1	100	82.456	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000007871	htatsf1	91	81.100	ENSATEG00000008903	htatsf1	94	81.100	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	88	62.619	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	63.571	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000007871	htatsf1	78	61.789	ENSACAG00000009346	HTATSF1	99	59.352	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	80.617	ENSACLG00000008096	htatsf1	100	81.498	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	69.783	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	70.282	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	86	63.547	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	50	64.039	Bos_taurus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	87	60.827	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	51	62.437	Bos_taurus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	86	63.547	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	50	64.039	Bos_taurus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	76	38.202	WBGene00022025	Y65B4A.1	77	37.326	Caenorhabditis_elegans
ENSPFOG00000007871	htatsf1	78	63.859	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	50	64.433	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	84	64.377	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	64.213	Canis_familiaris
ENSPFOG00000007871	htatsf1	87	63.260	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	51	64.286	Capra_hircus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	78	63.243	ENSCCAG00000025329	-	55	63.520	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	78	64.130	ENSCCAG00000022701	-	50	64.691	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	63.492	ENSCATG00000029963	HTATSF1	50	64.232	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000007871	htatsf1	89	60.900	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	53	61.374	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	63.492	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	50	64.232	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	61.707	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	98	61.623	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000007871	htatsf1	86	46.322	ENSCING00000005914	-	86	46.369	Ciona_intestinalis
ENSPFOG00000007871	htatsf1	86	40.257	ENSCSAVG00000000371	-	98	39.400	Ciona_savignyi
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	64.021	ENSCANG00000028495	HTATSF1	50	64.736	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	88.063	ENSCVAG00000014070	htatsf1	99	88.063	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	67.982	ENSDARG00000056649	htatsf1	100	68.202	Danio_rerio
ENSPFOG00000007871	htatsf1	81	45.789	FBgn0037081	barc	67	46.316	Drosophila_melanogaster
ENSPFOG00000007871	htatsf1	88	54.676	ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	54.676	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	62.741	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	65.096	Esox_lucius
ENSPFOG00000007871	htatsf1	84	63.613	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	63.452	Felis_catus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	61.039	ENSFALG00000003728	HTATSF1	99	60.823	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000007871	htatsf1	93	61.048	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	54	62.295	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	89.686	ENSFHEG00000020286	htatsf1	100	89.686	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	79	76.374	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	76.374	Gadus_morhua
ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	61.220	ENSGALG00000006410	HTATSF1	99	61.354	Gallus_gallus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	98	94.235	ENSGAFG00000003041	htatsf1	99	94.235	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	77.852	ENSGACG00000020459	htatsf1	100	77.852	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	64.286	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	50	64.987	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	80.837	ENSHBUG00000004392	htatsf1	100	81.718	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	70.721	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	71.622	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	65.116	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	66.808	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	64.267	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	53	63.636	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	85.078	ENSKMAG00000007622	htatsf1	100	85.078	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	77.533	ENSLBEG00000001154	htatsf1	100	78.242	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	61.333	ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.333	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	45.975	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	45.168	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000007871	htatsf1	85	63.819	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.307	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	63.492	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	50	64.232	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	63.492	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	50	64.232	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000007871	htatsf1	80	63.492	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	64.070	Macaca_nemestrina
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ENSPFOG00000007871	htatsf1	81	63.757	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	64.484	Mus_caroli
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ENSPFOG00000007871	htatsf1	97	77.212	ENSORLG00015002268	htatsf1	100	77.212	Oryzias_latipes_hsok
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