EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000008319 (Gene tree)
Gene ID: 103139561
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: RNA-binding protein Musashi homolog 1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 47938 bases
Position: chrKI519672.1:1665344-1713281
Accession: 103139561
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000008384	RRM_1	PF00076.22	9.5e-34	1	2
ENSPFOP00000008384	RRM_1	PF00076.22	9.5e-34	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000008396	-	4679	-	ENSPFOP00000008384	407 (aa)	XP_007554308	A0A087XRI1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000008319	-	50	40.741	ENSPFOG00000002387	dazap1	53	40.741
ENSPFOG00000008319	-	86	91.738	ENSPFOG00000013113	MSI1	100	91.738

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSG00000135097	MSI1	100	83.791	Homo_sapiens
ENSPFOG00000008319	-	86	98.286	ENSAPOG00000003191	MSI1	100	98.286	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000008319	-	86	91.738	ENSAPOG00000023458	-	100	91.738	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000008319	-	81	90.769	ENSAMEG00000013302	MSI1	83	90.769	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000008319	-	80	87.117	ENSACIG00000017754	-	72	97.044	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000008319	-	86	98.286	ENSAOCG00000003804	MSI1	100	98.286	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000008319	-	81	82.317	ENSAOCG00000009031	-	95	82.317	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000008319	-	86	98.286	ENSAPEG00000003245	MSI1	100	98.286	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000008319	-	86	91.738	ENSAPEG00000006857	-	84	91.738	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000008319	-	86	87.395	ENSATEG00000017059	MSI1	100	87.395	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000008319	-	86	90.113	ENSATEG00000023779	-	100	90.113	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.425	ENSACAG00000002762	MSI1	100	84.254	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000008319	-	71	83.681	ENSANAG00000027901	-	88	83.681	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSANAG00000027151	MSI1	100	83.791	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000008319	-	86	97.436	ENSACLG00000011230	MSI1	100	97.436	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000008319	-	86	92.000	ENSACLG00000000117	-	100	92.966	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000008319	-	81	89.028	ENSAMXG00000038960	msi1	76	89.028	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSBTAG00000009800	MSI1	100	85.924	Bos_taurus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSCJAG00000008578	MSI1	100	83.791	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.516	ENSCAFG00000010283	MSI1	100	83.516	Canis_familiaris
ENSPFOG00000008319	-	81	85.531	ENSCAFG00020020585	MSI1	100	85.531	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000008319	-	86	82.385	ENSCHIG00000024304	MSI1	100	82.385	Capra_hircus
ENSPFOG00000008319	-	81	85.321	ENSTSYG00000033949	MSI1	95	85.321	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000008319	-	81	85.348	ENSCAPG00000003919	MSI1	78	85.348	Cavia_aperea
ENSPFOG00000008319	-	81	85.965	ENSCPOG00000012361	MSI1	100	85.965	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSCCAG00000035567	MSI1	100	83.791	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSCATG00000030019	MSI1	100	83.791	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000008319	-	81	85.965	ENSCLAG00000011329	MSI1	100	85.965	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000008319	-	67	82.437	ENSCSAG00000002265	MSI1	96	82.437	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000008319	-	86	86.686	ENSCPBG00000011349	MSI1	100	86.686	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000008319	-	81	85.366	ENSCANG00000040651	MSI1	100	85.366	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSCGRG00001018883	Msi1	100	83.791	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000008319	-	81	85.410	ENSCGRG00000002191	Msi1	72	85.410	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000008319	-	86	97.714	ENSCSEG00000005834	-	100	97.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000008319	-	81	83.792	ENSCSEG00000011032	MSI1	100	83.792	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000008319	-	86	90.571	ENSCSEG00000008352	-	100	90.571	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000008319	-	86	92.286	ENSCVAG00000009100	MSI1	100	92.286	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000008319	-	65	80.645	ENSCVAG00000017463	-	89	80.645	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000008319	-	68	90.698	ENSDARG00000102015	CABZ01037298.1	91	90.698	Danio_rerio
ENSPFOG00000008319	-	81	84.762	ENSDARG00000010710	msi1	100	92.523	Danio_rerio
ENSPFOG00000008319	-	81	82.278	ENSDNOG00000005713	MSI1	91	82.278	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000008319	-	81	84.731	ENSDORG00000005610	Msi1	94	84.731	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000008319	-	81	82.317	ENSETEG00000004756	MSI1	100	82.317	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSEASG00005004736	MSI1	100	83.791	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSECAG00000017526	MSI1	100	83.791	Equus_caballus
ENSPFOG00000008319	-	81	85.673	ENSELUG00000023219	MSI1	92	85.673	Esox_lucius
ENSPFOG00000008319	-	81	87.156	ENSELUG00000023280	-	100	86.850	Esox_lucius
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSFCAG00000011007	MSI1	100	83.791	Felis_catus
ENSPFOG00000008319	-	81	88.667	ENSFALG00000007574	MSI1	100	88.667	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000008319	-	81	85.061	ENSFDAG00000019586	MSI1	100	85.061	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000008319	-	86	92.023	ENSFHEG00000022446	MSI1	100	92.023	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000008319	-	86	98.857	ENSFHEG00000003560	-	100	98.857	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000008319	-	86	90.286	ENSGMOG00000001006	MSI1	99	90.000	Gadus_morhua
ENSPFOG00000008319	-	86	85.634	ENSGMOG00000017838	-	100	85.634	Gadus_morhua
ENSPFOG00000008319	-	81	88.931	ENSGALG00000007227	MSI1	95	76.963	Gallus_gallus
ENSPFOG00000008319	-	81	98.780	ENSGAFG00000021522	MSI1	94	98.780	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000008319	-	86	69.972	ENSGAFG00000005860	-	100	69.972	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000008319	-	86	88.154	ENSGACG00000008674	-	100	88.154	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000008319	-	86	90.313	ENSGACG00000012679	MSI1	100	90.313	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000008319	-	86	86.402	ENSGAGG00000016037	MSI1	100	86.402	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000008319	-	81	85.350	ENSGGOG00000010328	MSI1	100	85.350	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000008319	-	86	97.436	ENSHBUG00000021921	MSI1	100	97.436	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000008319	-	86	92.000	ENSHBUG00000011841	-	100	92.000	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000008319	-	86	83.516	ENSHGLG00000012782	MSI1	100	83.516	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000008319	-	81	85.061	ENSHGLG00100016848	MSI1	100	85.061	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000008319	-	86	87.571	ENSHCOG00000012067	-	100	87.571	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000008319	-	77	95.860	ENSHCOG00000012019	MSI1	95	95.860	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000008319	-	86	87.749	ENSIPUG00000001976	msi1	100	87.749	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000008319	-	81	85.531	ENSSTOG00000009799	MSI1	100	85.531	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSJJAG00000010463	Msi1	100	83.791	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000008319	-	86	72.857	ENSJJAG00000010643	-	100	72.857	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000008319	-	81	92.966	ENSKMAG00000019877	-	100	92.966	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000008319	-	86	91.714	ENSKMAG00000011251	MSI1	100	91.714	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000008319	-	86	92.023	ENSLBEG00000008789	MSI1	100	92.023	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000008319	-	86	98.286	ENSLBEG00000001375	-	100	98.286	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000008319	-	81	82.558	ENSLACG00000018287	MSI1	100	82.558	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000008319	-	77	76.435	ENSLAFG00000009412	MSI1	100	76.435	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000008319	-	81	85.965	ENSMFAG00000001798	MSI1	100	85.965	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000008319	-	81	85.965	ENSMMUG00000031527	MSI1	96	85.057	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSMNEG00000040034	MSI1	100	83.791	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000008319	-	81	85.366	ENSMLEG00000003921	MSI1	100	85.366	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000008319	-	86	91.143	ENSMAMG00000002279	MSI1	100	91.143	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000008319	-	86	97.429	ENSMAMG00000018426	-	100	97.429	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000008319	-	86	92.000	ENSMZEG00005000340	-	100	92.000	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000008319	-	86	97.436	ENSMZEG00005026892	MSI1	100	97.436	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000008319	-	54	92.308	ENSMGAG00000016518	-	100	92.308	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000008319	-	59	88.843	ENSMAUG00000016820	Msi1	99	88.843	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.791	ENSMICG00000033181	MSI1	100	83.791	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.516	ENSMOCG00000002286	Msi1	100	83.516	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000008319	-	81	81.098	ENSMMOG00000010492	MSI1	96	81.098	Mola_mola
ENSPFOG00000008319	-	86	85.714	ENSMMOG00000012265	-	100	85.714	Mola_mola
ENSPFOG00000008319	-	77	59.036	ENSMODG00000003189	-	100	59.036	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000008319	-	81	96.942	ENSMALG00000001426	-	100	96.942	Monopterus_albus
ENSPFOG00000008319	-	86	92.000	ENSMALG00000017889	MSI1	100	92.000	Monopterus_albus
ENSPFOG00000008319	-	86	83.242	MGP_CAROLIEiJ_G0027626	Msi1	100	83.242	Mus_caroli
ENSPFOG00000008319	-	86	83.242	ENSMUSG00000054256	Msi1	99	87.963	Mus_musculus
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ENSPFOG00000008319	-	86	83.242	MGP_SPRETEiJ_G0028624	Msi1	100	83.242	Mus_spretus
ENSPFOG00000008319	-	81	85.531	ENSMPUG00000003168	MSI1	100	85.531	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000008319	-	81	76.488	ENSMLUG00000010313	MSI1	100	76.488	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000008319	-	81	85.410	ENSNGAG00000014508	Msi1	91	85.410	Nannospalax_galili
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ENSPFOG00000008319	-	77	75.610	ENSNLEG00000015636	MSI1	100	75.610	Nomascus_leucogenys
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ENSPFOG00000008319	-	86	94.231	ENSONIG00000019452	-	100	94.231	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000008319	-	81	85.852	ENSOCUG00000027716	MSI1	100	85.852	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000008319	-	86	91.453	ENSORLG00000019978	-	100	91.453	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000008319	-	86	98.286	ENSORLG00000029593	MSI1	100	98.286	Oryzias_latipes
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