EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000008763 (Gene tree)
Gene ID: 103145425
Gene Symbol: xpo6
Alias: -
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19335 bases
Position: chrKI519752.1:251471-270805
Accession: ZDB-GENE-030131-5912
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000030924	Xpo1	PF08389.12	1.2e-22	1	1
ENSPFOP00000008918	Xpo1	PF08389.12	6.6e-21	1	1
ENSPFOP00000008918	IBN_N	PF03810.19	1.5e-07	1	1
ENSPFOP00000030924	IBN_N	PF03810.19	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000008930	-	5908	-	ENSPFOP00000008918	1149 (aa)	-	A0A087XT15
ENSPFOT00000028193	-	5863	-	ENSPFOP00000030924	1134 (aa)	-	A0A096MHN3

Gene Model

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.935	ENSG00000169180	XPO6	100	94.118	Homo_sapiens
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	93.235	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	93.322	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.739	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	74.739	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	91.790	ENSACIG00000008055	xpo6	99	91.965	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	93.582	ENSAOCG00000001326	xpo6	100	93.669	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	93.495	ENSAPEG00000016304	xpo6	100	93.582	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.934	ENSATEG00000002273	xpo6	100	92.021	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	75.958	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	75.958	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	67.158	ENSACAG00000016883	XPO6	100	67.158	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.674	ENSANAG00000031761	XPO6	100	74.674	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	92.281	ENSACLG00000007048	xpo6	100	92.368	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	77.524	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	77.524	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.413	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	74.413	Bos_taurus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.848	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	74.848	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.913	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	74.913	Canis_familiaris
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.935	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	74.935	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.674	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	74.674	Capra_hircus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	72.140	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	72.140	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.674	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	74.674	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.674	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	74.674	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.022	ENSCATG00000034030	XPO6	100	75.022	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.652	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	74.652	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000008763	xpo6	91	73.770	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	73.770	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000008763	xpo6	82	82.353	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	82.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	44.464	ENSCING00000006884	-	100	44.463	Ciona_intestinalis
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	44.588	ENSCSAVG00000000850	-	99	44.674	Ciona_savignyi
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.848	ENSCANG00000041578	XPO6	100	74.848	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.761	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	74.761	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	90.807	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	90.893	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	96.084	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	96.084	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000008763	xpo6	97	77.195	ENSDARG00000041217	xpo6	99	77.195	Danio_rerio
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.848	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	74.848	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.761	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	74.761	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000008763	xpo6	83	74.131	ENSETEG00000018768	XPO6	85	74.131	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	58.925	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	58.977	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.109	ENSEASG00005017296	XPO6	100	75.109	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.109	ENSECAG00000008601	XPO6	100	75.109	Equus_caballus
ENSPFOG00000008763	xpo6	97	69.238	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	69.238	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	85.205	ENSELUG00000009159	xpo6	100	85.205	Esox_lucius
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.022	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	75.022	Felis_catus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	76.220	ENSFALG00000004441	XPO6	98	76.481	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.826	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	74.826	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	95.997	ENSFHEG00000021190	xpo6	100	95.997	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	76.066	ENSGALG00000035360	XPO6	100	76.066	Gallus_gallus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	98.085	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	98.085	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000008763	xpo6	95	75.390	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	75.390	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.848	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	74.848	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	92.368	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	92.454	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000008763	xpo6	86	71.296	ENSHGLG00000003865	-	97	69.507	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.196	ENSHGLG00000009679	-	100	75.196	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.109	ENSHGLG00100003673	-	99	75.109	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000008763	xpo6	94	63.133	ENSHGLG00100001081	-	99	63.133	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	90.017	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	90.017	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	76.496	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	77.201	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.587	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	74.587	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.064	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	74.064	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	94.778	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	94.778	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.761	ENSLBEG00000023039	xpo6	100	91.847	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.848	ENSLACG00000017930	XPO6	100	74.848	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000008763	xpo6	94	81.221	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.221	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.303	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	74.303	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.022	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	75.022	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.022	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	75.022	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.022	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	75.022	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.022	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	75.022	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	92.281	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	92.368	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	92.368	ENSMZEG00005010620	xpo6	100	92.454	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000008763	xpo6	97	75.268	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	75.268	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	66.492	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	66.230	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.848	ENSMICG00000001923	XPO6	100	74.848	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.674	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	74.674	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	89.991	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	89.991	Mola_mola
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.718	ENSMODG00000015516	XPO6	100	75.718	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	81.953	ENSMALG00000020612	xpo6	99	82.214	Monopterus_albus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.674	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	100	74.674	Mus_caroli
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.500	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	74.500	Mus_musculus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.587	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	74.587	Mus_pahari
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.326	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	74.326	Mus_spretus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.390	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	74.390	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.390	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	74.390	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.739	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	74.739	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	92.454	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	92.541	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.935	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	74.935	Nomascus_leucogenys
ENSPFOG00000008763	xpo6	87	74.390	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	74.390	Ochotona_princeps
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.935	ENSODEG00000012917	XPO6	100	74.935	Octodon_degus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	92.541	ENSONIG00000019366	xpo6	100	92.628	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.826	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	74.826	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.051	ENSORLG00000011231	xpo6	100	91.051	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.573	ENSORLG00020000386	xpo6	100	91.573	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.312	ENSORLG00015003636	xpo6	100	91.312	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	91.920	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	91.920	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	75.000	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	75.000	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.564	ENSOARG00000000960	XPO6	100	74.564	Ovis_aries
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.935	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	74.935	Pan_paniscus
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.802	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	74.802	Panthera_pardus
ENSPFOG00000008763	xpo6	97	74.054	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	74.054	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.935	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	74.935	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	75.022	ENSPANG00000017103	XPO6	100	75.022	Papio_anubis
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	80.052	ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.104	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	74.472	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	74.472	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	90.220	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	90.220	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.500	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	74.500	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPFOG00000008763	xpo6	99	67.565	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	67.565	Petromyzon_marinus
ENSPFOG00000008763	xpo6	97	75.179	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	75.000	Phascolarctos_cinereus
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	99.652	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	99.652	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000008763	xpo6	100	99.391	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	99.391	Poecilia_mexicana
ENSPFOG00000008763	xpo6	97	99.016	ENSPREG00000016421	xpo6	96	99.016	Poecilia_reticulata
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