EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000010018 (Gene tree)
Gene ID: 103147973
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: gastrula zinc finger protein XlCGF57.1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16663 bases
Position: chrKI519802.1:401316-417978
Accession: 103147973
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	1	16
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ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	3	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	4	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	5	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	6	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	7	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	8	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	9	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	10	16
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ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	12	16
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ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	14	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	15	16
ENSPFOP00000009999	zf-C2H2	PF00096.26	9.5e-93	16	16
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	1	9
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	2	9
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	3	9
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	4	9
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	5	9
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	6	9
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	7	9
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	8	9
ENSPFOP00000022429	zf-C2H2	PF00096.26	1e-54	9	9
ENSPFOP00000009999	zf-met	PF12874.7	1.2e-32	1	5
ENSPFOP00000009999	zf-met	PF12874.7	1.2e-32	2	5
ENSPFOP00000009999	zf-met	PF12874.7	1.2e-32	3	5
ENSPFOP00000009999	zf-met	PF12874.7	1.2e-32	4	5
ENSPFOP00000009999	zf-met	PF12874.7	1.2e-32	5	5
ENSPFOP00000022429	zf-met	PF12874.7	1.7e-16	1	2
ENSPFOP00000022429	zf-met	PF12874.7	1.7e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000010014	-	1824	-	ENSPFOP00000009999	608 (aa)	-	A0A087XW46
ENSPFOT00000022526	-	3610	-	ENSPFOP00000022429	637 (aa)	XP_016534348	A0A096LTD8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000010018	-	99	42.000	ENSPFOG00000019832	-	50	40.551
ENSPFOG00000010018	-	100	44.667	ENSPFOG00000009806	-	100	44.444
ENSPFOG00000010018	-	100	48.097	ENSPFOG00000022201	-	71	47.213
ENSPFOG00000010018	-	100	44.271	ENSPFOG00000022933	-	56	44.271
ENSPFOG00000010018	-	100	43.841	ENSPFOG00000004126	-	100	51.111
ENSPFOG00000010018	-	100	42.643	ENSPFOG00000023165	-	77	42.643
ENSPFOG00000010018	-	100	42.483	ENSPFOG00000009483	-	95	46.988
ENSPFOG00000010018	-	100	47.475	ENSPFOG00000024642	-	100	46.462
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ENSPFOG00000010018	-	95	40.486	ENSPFOG00000018782	-	58	41.071
ENSPFOG00000010018	-	100	44.062	ENSPFOG00000004377	-	69	42.021
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ENSPFOG00000010018	-	100	46.544	ENSPFOG00000022934	-	51	46.444
ENSPFOG00000010018	-	99	32.413	ENSPFOG00000020182	ZNF319	97	32.067
ENSPFOG00000010018	-	99	47.292	ENSPFOG00000024469	-	85	46.996
ENSPFOG00000010018	-	100	42.643	ENSPFOG00000013455	-	95	42.135
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ENSPFOG00000010018	-	100	45.200	ENSPFOG00000024635	-	70	45.175
ENSPFOG00000010018	-	100	43.011	ENSPFOG00000020691	-	86	42.564
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