EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000010422 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 20805 bases
Position: chrKI519702.1:1676997-1697801
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSPFOP00000010377	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-82	3	15
ENSPFOP00000010377	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-82	4	15
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ENSPFOP00000010377	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-82	7	15
ENSPFOP00000010377	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-82	8	15
ENSPFOP00000010377	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-82	9	15
ENSPFOP00000010377	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-82	10	15
ENSPFOP00000010377	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-82	11	15
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ENSPFOP00000010377	zf-C2H2	PF00096.26	9.8e-82	15	15
ENSPFOP00000010377	zf-met	PF12874.7	1.4e-15	1	2
ENSPFOP00000010377	zf-met	PF12874.7	1.4e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000010392	-	2187	-	ENSPFOP00000010377	514 (aa)	-	A0A087XX74

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000010422	-	97	47.312	ENSPFOG00000009491	-	58	47.312
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ENSPFOG00000010422	-	92	49.112	ENSPFOG00000018245	-	99	49.112
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ENSPFOG00000010422	-	94	47.880	ENSPFOG00000007938	-	88	47.880
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