EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000011347 (Gene tree)
Gene ID: 103136353
Gene Symbol: srprb
Alias: -
Full Name: SRP receptor subunit beta
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4479 bases
Position: chrKI519641.1:3011920-3016398
Accession: ZDB-GENE-040718-311
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000011347	MMR_HSR1	PF01926.23	5.8e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000011363	-	2648	-	ENSPFOP00000011347	276 (aa)	-	A0A087XZZ4

Gene Model

Click here to download ENSPFOG00000011347's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPFOG00000011347's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000011347	srprb	62	30.409	ENSPFOG00000012632	-	88	30.409
ENSPFOG00000011347	srprb	58	31.250	ENSPFOG00000013339	arf2b	83	31.250
ENSPFOG00000011347	srprb	62	30.994	ENSPFOG00000014787	-	88	30.994
ENSPFOG00000011347	srprb	68	30.319	ENSPFOG00000001778	arf3b	96	30.319

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000011347	srprb	95	87.833	ENSAPOG00000021219	srprb	95	87.833	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	86.742	ENSACIG00000014621	srprb	99	86.742	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000011347	srprb	95	86.692	ENSAOCG00000017265	srprb	95	86.692	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000011347	srprb	95	86.692	ENSAPEG00000024541	srprb	84	86.692	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000011347	srprb	96	85.985	ENSATEG00000014016	srprb	96	85.985	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	87.547	ENSACLG00000016748	srprb	96	87.547	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000011347	srprb	96	69.697	ENSAMXG00000044118	srprb	99	69.697	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	82.955	ENSCSEG00000017194	srprb	96	82.955	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000011347	srprb	96	90.909	ENSCVAG00000004221	srprb	99	90.909	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	67.803	ENSDARG00000030949	srprb	99	67.803	Danio_rerio
ENSPFOG00000011347	srprb	95	78.707	ENSELUG00000009740	srprb	93	81.028	Esox_lucius
ENSPFOG00000011347	srprb	96	92.045	ENSFHEG00000006004	srprb	99	92.045	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	82.197	ENSGMOG00000002081	srprb	97	82.197	Gadus_morhua
ENSPFOG00000011347	srprb	96	96.981	ENSGAFG00000012593	srprb	100	96.981	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000011347	srprb	96	85.606	ENSGACG00000009891	srprb	97	85.606	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	87.547	ENSHBUG00000002145	srprb	96	87.547	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000011347	srprb	96	82.197	ENSHCOG00000007732	srprb	98	82.197	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000011347	srprb	91	67.460	ENSIPUG00000004177	srprb	94	67.460	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	85.606	ENSKMAG00000020736	srprb	99	85.606	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	86.742	ENSLBEG00000021483	srprb	96	86.742	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000011347	srprb	99	67.391	ENSLOCG00000009740	srprb	92	65.942	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000011347	srprb	95	87.452	ENSMAMG00000011876	srprb	96	87.452	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000011347	srprb	93	87.259	ENSMZEG00005016621	srprb	100	87.259	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000011347	srprb	96	86.364	ENSMMOG00000012550	srprb	97	86.364	Mola_mola
ENSPFOG00000011347	srprb	95	85.551	ENSMALG00000012595	srprb	96	85.551	Monopterus_albus
ENSPFOG00000011347	srprb	71	87.179	ENSNBRG00000004699	srprb	91	80.930	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000011347	srprb	96	87.500	ENSONIG00000003788	srprb	79	87.500	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000011347	srprb	95	80.989	ENSORLG00000006430	srprb	96	80.989	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000011347	srprb	95	81.369	ENSORLG00020003413	srprb	96	81.369	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000011347	srprb	95	81.369	ENSORLG00015000166	srprb	96	81.369	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000011347	srprb	95	82.890	ENSOMEG00000012735	srprb	96	82.890	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000011347	srprb	91	70.916	ENSPKIG00000013147	srprb	95	70.916	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000011347	srprb	98	78.148	ENSPMGG00000014061	srprb	99	78.148	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000011347	srprb	93	98.837	ENSPLAG00000001156	srprb	100	98.837	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000011347	srprb	93	99.612	ENSPMEG00000012169	srprb	100	99.612	Poecilia_mexicana
ENSPFOG00000011347	srprb	93	97.674	ENSPREG00000001449	srprb	100	97.674	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000011347	srprb	96	87.547	ENSPNYG00000005911	srprb	96	87.547	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000011347	srprb	96	70.076	ENSPNAG00000009983	srprb	99	70.076	Pygocentrus_nattereri
ENSPFOG00000011347	srprb	92	74.409	ENSSFOG00015019355	srprb	95	74.409	Scleropages_formosus
ENSPFOG00000011347	srprb	95	85.551	ENSSMAG00000013202	srprb	96	85.551	Scophthalmus_maximus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	86.364	ENSSDUG00000018746	srprb	90	86.364	Seriola_dumerili
ENSPFOG00000011347	srprb	96	86.742	ENSSLDG00000020560	srprb	96	86.742	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPFOG00000011347	srprb	95	87.072	ENSSPAG00000008898	srprb	95	87.072	Stegastes_partitus
ENSPFOG00000011347	srprb	96	85.227	ENSTRUG00000022463	srprb	96	85.227	Takifugu_rubripes
ENSPFOG00000011347	srprb	95	81.679	ENSTNIG00000007725	srprb	100	81.679	Tetraodon_nigroviridis
ENSPFOG00000011347	srprb	93	97.287	ENSXCOG00000012585	srprb	100	97.287	Xiphophorus_couchianus
ENSPFOG00000011347	srprb	93	96.899	ENSXMAG00000028725	srprb	100	96.899	Xiphophorus_maculatus