EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000013000 (Gene tree)
Gene ID: 103141369
Gene Symbol: pop5
Alias: -
Full Name: POP5 homolog%2C ribonuclease P/MRP subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 13364 bases
Position: chrKI519692.1:1754125-1767488
Accession: ZDB-GENE-050320-123
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000023072	RNase_P_Rpp14	PF01900.19	3.5e-24	1	1
ENSPFOP00000013010	RNase_P_Rpp14	PF01900.19	4.5e-24	1	1
ENSPFOP00000027091	RNase_P_Rpp14	PF01900.19	2.6e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000013028	-	543	-	ENSPFOP00000013010	181 (aa)	-	A0A087Y4Q7
ENSPFOT00000022834	-	2211	-	ENSPFOP00000027091	108 (aa)	-	A0A096M6Q0
ENSPFOT00000030687	-	507	-	ENSPFOP00000023072	168 (aa)	-	A0A096LV81

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSG00000167272	POP5	91	57.333	Homo_sapiens
ENSPFOG00000013000	pop5	94	81.373	ENSAPOG00000023686	POP5	92	78.710	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000013000	pop5	99	52.941	ENSAMEG00000008503	POP5	84	57.534	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000013000	pop5	94	84.314	ENSACIG00000018362	pop5	93	81.935	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	78.431	ENSAOCG00000001930	pop5	92	78.710	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000013000	pop5	98	78.302	ENSAPEG00000006795	pop5	92	79.355	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000013000	pop5	95	80.583	ENSATEG00000016792	pop5	89	79.866	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000013000	pop5	57	60.000	ENSAPLG00000015761	POP5	87	60.000	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000013000	pop5	96	50.311	ENSACAG00000003091	POP5	92	50.980	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000013000	pop5	96	55.769	ENSANAG00000023744	POP5	87	56.944	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000013000	pop5	94	84.158	ENSACLG00000021131	-	88	82.550	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000013000	pop5	97	54.286	ENSAMXG00000038175	pop5	86	57.718	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	59.406	ENSBTAG00000005385	POP5	84	58.333	Bos_taurus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSCJAG00000001309	POP5	91	58.000	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSCAFG00000010389	POP5	84	58.333	Canis_familiaris
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSCAFG00020020663	POP5	84	58.333	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSCHIG00000016402	POP5	87	57.333	Capra_hircus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSTSYG00000027616	POP5	97	53.614	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000013000	pop5	67	50.862	ENSCAPG00000016873	POP5	96	53.153	Cavia_aperea
ENSPFOG00000013000	pop5	100	52.047	ENSCPOG00000012337	POP5	97	53.614	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSCCAG00000023154	POP5	87	56.944	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSCATG00000036825	POP5	91	57.333	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000013000	pop5	94	57.426	ENSCLAG00000007808	POP5	88	56.667	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSCSAG00000002246	POP5	91	57.333	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	42.574	ENSCHOG00000013969	POP5	86	46.309	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000013000	pop5	94	63.366	ENSCPBG00000011331	POP5	88	60.811	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000013000	pop5	94	57.426	ENSCANG00000028001	POP5	91	56.667	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	57.426	ENSCGRG00001017974	Pop5	88	55.405	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000013000	pop5	94	57.426	ENSCGRG00000010102	Pop5	88	55.405	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000013000	pop5	94	72.549	ENSCSEG00000011103	pop5	95	72.535	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000013000	pop5	94	72.549	ENSCSEG00000008332	-	89	71.333	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000013000	pop5	99	59.281	ENSCVAG00000009152	-	87	61.745	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000013000	pop5	96	51.887	ENSDARG00000053452	pop5	89	56.291	Danio_rerio
ENSPFOG00000013000	pop5	94	56.311	ENSDNOG00000012668	-	78	55.629	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	57.426	ENSDNOG00000045952	-	86	56.376	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSDORG00000029401	Pop5	88	57.333	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000013000	pop5	75	31.496	FBgn0036696	CG14057	84	31.496	Drosophila_melanogaster
ENSPFOG00000013000	pop5	94	53.465	ENSETEG00000009283	POP5	88	53.378	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000013000	pop5	96	38.509	ENSEBUG00000016369	pop5	93	40.000	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000013000	pop5	94	57.426	ENSEASG00005004714	POP5	97	53.293	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	57.426	ENSECAG00000010012	POP5	97	53.293	Equus_caballus
ENSPFOG00000013000	pop5	100	65.741	ENSELUG00000023394	pop5	94	66.667	Esox_lucius
ENSPFOG00000013000	pop5	94	58.416	ENSFCAG00000042614	POP5	84	58.333	Felis_catus
ENSPFOG00000013000	pop5	96	55.769	ENSFALG00000007537	POP5	92	57.962	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000013000	pop5	94	56.436	ENSFDAG00000009972	POP5	88	56.000	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000013000	pop5	99	83.234	ENSFHEG00000022341	pop5	93	85.161	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	60.784	ENSGMOG00000001073	pop5	99	67.176	Gadus_morhua
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ENSPFOG00000013000	pop5	94	80.392	ENSGACG00000012710	-	94	77.419	Gasterosteus_aculeatus
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ENSPFOG00000013000	pop5	100	53.254	ENSHGLG00100014284	POP5	92	54.839	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000013000	pop5	94	71.569	ENSHCOG00000011809	pop5	93	73.684	Hippocampus_comes
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ENSPFOG00000013000	pop5	94	60.194	ENSMLUG00000014657	POP5	90	58.553	Myotis_lucifugus
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ENSPFOG00000013000	pop5	92	84.848	ENSNBRG00000001020	-	99	73.134	Neolamprologus_brichardi
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ENSPFOG00000013000	pop5	94	56.436	ENSODEG00000006549	-	88	55.705	Octodon_degus
ENSPFOG00000013000	pop5	94	83.333	ENSONIG00000011172	pop5	88	82.550	Oreochromis_niloticus
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ENSPFOG00000013000	pop5	94	57.426	ENSOCUG00000006537	POP5	83	56.944	Oryctolagus_cuniculus
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