EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000013217 (Gene tree)
Gene ID: 103154537
Gene Symbol: nrde2
Alias: -
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10814 bases
Position: chrKI519618.1:3511540-3522353
Accession: ZDB-GENE-111117-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000013284	NRDE-2	PF08424.10	1.4e-101	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000013302	-	5346	-	ENSPFOP00000013284	1170 (aa)	-	A0A087Y5I1

Gene Model

Click here to download ENSPFOG00000013217's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPFOG00000013217's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.591	ENSG00000119720	NRDE2	100	66.184	Homo_sapiens
ENSPFOG00000013217	nrde2	100	73.213	ENSAPOG00000009202	nrde2	100	73.541	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	42.645	ENSAMEG00000001807	NRDE2	100	43.460	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000013217	nrde2	97	71.737	ENSACIG00000014783	nrde2	100	71.997	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000013217	nrde2	100	73.597	ENSAOCG00000015576	nrde2	99	73.762	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000013217	nrde2	100	73.671	ENSAPEG00000001711	nrde2	100	74.169	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	72.388	ENSATEG00000010247	nrde2	99	72.637	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000013217	nrde2	98	45.372	ENSAPLG00000015870	NRDE2	99	46.348	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.277	ENSACAG00000014571	NRDE2	100	43.947	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	43.261	ENSANAG00000025313	NRDE2	100	43.600	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	71.559	ENSACLG00000025154	nrde2	100	72.056	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000013217	nrde2	84	72.093	ENSAMXG00000034642	nrde2	87	72.093	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.492	ENSBTAG00000005427	NRDE2	100	46.065	Bos_taurus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.598	ENSCJAG00000017711	NRDE2	100	45.613	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	41.995	ENSCAFG00000017515	NRDE2	89	44.101	Canis_familiaris
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.325	ENSCAFG00020016346	NRDE2	100	44.050	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.029	ENSCHIG00000005876	NRDE2	100	45.809	Capra_hircus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.175	ENSTSYG00000000161	NRDE2	88	46.717	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000013217	nrde2	97	43.845	ENSCAPG00000012039	NRDE2	89	47.004	Cavia_aperea
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.816	ENSCPOG00000002428	NRDE2	100	44.793	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.955	ENSCCAG00000024917	NRDE2	100	45.844	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.370	ENSCLAG00000015185	NRDE2	100	44.683	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.757	ENSCSAG00000011451	NRDE2	100	46.167	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000013217	nrde2	73	45.288	ENSCHOG00000006165	NRDE2	75	45.404	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.610	ENSCPBG00000008537	NRDE2	98	44.691	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.629	ENSCANG00000029067	NRDE2	100	45.724	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	43.927	ENSCGRG00001015658	Nrde2	100	44.188	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	43.880	ENSCGRG00000005062	Nrde2	87	46.754	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000013217	nrde2	96	64.131	ENSCSEG00000000089	nrde2	100	64.225	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	80.936	ENSCVAG00000023105	nrde2	100	80.100	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	52.544	ENSDARG00000074726	nrde2	100	52.544	Danio_rerio
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.628	ENSDNOG00000024057	NRDE2	100	44.389	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000013217	nrde2	78	45.793	ENSDORG00000003197	Nrde2	98	46.097	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000013217	nrde2	62	50.000	ENSETEG00000000198	NRDE2	64	50.000	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	38.662	ENSEBUG00000014552	nrde2	99	38.499	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	46.262	ENSEASG00005020675	NRDE2	100	46.116	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	46.230	ENSECAG00000003862	NRDE2	100	46.116	Equus_caballus
ENSPFOG00000013217	nrde2	67	59.259	ENSEEUG00000004026	-	69	59.259	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	57.689	ENSELUG00000005973	nrde2	100	57.606	Esox_lucius
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.771	ENSFCAG00000011312	NRDE2	100	44.509	Felis_catus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	46.084	ENSFALG00000012260	NRDE2	99	46.046	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.279	ENSFDAG00000021350	NRDE2	100	44.913	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000013217	nrde2	100	83.430	ENSFHEG00000021385	nrde2	100	83.347	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000013217	nrde2	62	70.782	ENSGMOG00000015815	nrde2	92	70.061	Gadus_morhua
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	46.550	ENSGALG00000010677	NRDE2	99	45.968	Gallus_gallus
ENSPFOG00000013217	nrde2	94	84.960	ENSGAFG00000019546	nrde2	99	89.107	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	70.257	ENSGACG00000012619	nrde2	100	70.257	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.979	ENSGAGG00000003252	NRDE2	100	45.140	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.507	ENSGGOG00000008835	NRDE2	100	45.970	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	71.725	ENSHBUG00000016736	nrde2	100	72.222	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.303	ENSHGLG00000006731	NRDE2	100	45.665	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.722	ENSHGLG00100017736	NRDE2	90	47.320	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000013217	nrde2	91	64.208	ENSHCOG00000009559	nrde2	97	63.919	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	50.210	ENSIPUG00000016129	nrde2	100	50.000	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.612	ENSSTOG00000001678	NRDE2	100	44.711	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.842	ENSJJAG00000000907	Nrde2	87	47.932	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	74.526	ENSKMAG00000008647	nrde2	100	74.444	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000013217	nrde2	94	71.646	ENSLBEG00000021428	nrde2	96	71.283	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000013217	nrde2	69	50.119	ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.000	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	53.601	ENSLOCG00000009037	nrde2	99	53.434	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	97	45.051	ENSLAFG00000004966	NRDE2	91	46.580	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000013217	nrde2	78	47.761	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	65.700	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000013217	nrde2	100	71.042	ENSMAMG00000013452	nrde2	100	70.960	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	71.476	ENSMZEG00005008319	nrde2	100	72.222	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000013217	nrde2	85	46.460	ENSMGAG00000013052	NRDE2	99	46.259	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	43.740	ENSMAUG00000018578	Nrde2	87	46.943	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.636	ENSMICG00000016741	NRDE2	100	45.785	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	43.428	ENSMOCG00000014472	Nrde2	87	45.591	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000013217	nrde2	73	67.008	ENSMMOG00000004703	nrde2	93	67.235	Mola_mola
ENSPFOG00000013217	nrde2	94	43.139	ENSMODG00000002711	NRDE2	85	46.317	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000013217	nrde2	90	69.209	ENSMALG00000021869	nrde2	99	69.504	Monopterus_albus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.175	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	88	46.922	Mus_caroli
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.129	ENSMUSG00000021179	Nrde2	87	47.136	Mus_musculus
ENSPFOG00000013217	nrde2	87	46.908	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	88	47.251	Mus_pahari
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.954	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	82	58.824	Mus_spretus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.416	ENSMPUG00000008135	NRDE2	100	44.640	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.444	ENSMLUG00000007484	NRDE2	100	44.572	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.937	ENSNGAG00000002993	Nrde2	100	44.490	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000013217	nrde2	91	69.369	ENSNBRG00000010184	nrde2	99	71.495	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.234	ENSNLEG00000017032	NRDE2	96	44.851	Nomascus_leucogenys
ENSPFOG00000013217	nrde2	77	40.968	ENSMEUG00000011097	NRDE2	78	40.968	Notamacropus_eugenii
ENSPFOG00000013217	nrde2	61	58.947	ENSOPRG00000001375	-	61	61.321	Ochotona_princeps
ENSPFOG00000013217	nrde2	97	43.739	ENSODEG00000012422	NRDE2	90	46.211	Octodon_degus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	72.704	ENSONIG00000019512	nrde2	100	72.704	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.992	ENSOCUG00000010083	NRDE2	88	47.136	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000013217	nrde2	95	65.271	ENSORLG00000017730	nrde2	99	65.039	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	67.766	ENSORLG00020015965	nrde2	100	67.519	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	68.673	ENSORLG00015012437	nrde2	100	68.261	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	71.109	ENSOMEG00000010890	nrde2	100	71.275	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.681	ENSOGAG00000006624	NRDE2	100	45.620	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000013217	nrde2	96	43.186	ENSOARG00000003475	NRDE2	100	43.819	Ovis_aries
ENSPFOG00000013217	nrde2	97	45.486	ENSPPAG00000034133	NRDE2	98	48.632	Pan_paniscus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.771	ENSPPRG00000006422	NRDE2	100	45.079	Panthera_pardus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.853	ENSPTIG00000009989	NRDE2	100	44.996	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.507	ENSPTRG00000023399	NRDE2	100	45.970	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	50.375	ENSPKIG00000009331	nrde2	100	50.791	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.868	ENSPSIG00000005588	NRDE2	100	44.426	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000013217	nrde2	97	60.463	ENSPMGG00000024089	nrde2	100	60.377	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.573	ENSPEMG00000023707	Nrde2	94	46.998	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPFOG00000013217	nrde2	54	43.485	ENSPMAG00000003270	-	99	44.053	Petromyzon_marinus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.137	ENSPCIG00000018567	NRDE2	100	45.799	Phascolarctos_cinereus
ENSPFOG00000013217	nrde2	100	96.598	ENSPLAG00000022350	nrde2	100	96.598	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000013217	nrde2	100	96.349	ENSPMEG00000000778	nrde2	100	96.349	Poecilia_mexicana
ENSPFOG00000013217	nrde2	100	94.357	ENSPREG00000009066	nrde2	100	94.357	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000013217	nrde2	84	46.916	ENSPPYG00000006245	NRDE2	100	47.253	Pongo_abelii
ENSPFOG00000013217	nrde2	71	69.231	ENSPCAG00000016399	NRDE2	70	69.231	Procavia_capensis
ENSPFOG00000013217	nrde2	94	44.917	ENSPCOG00000024684	NRDE2	100	44.367	Propithecus_coquereli
ENSPFOG00000013217	nrde2	96	42.123	ENSPVAG00000010023	NRDE2	100	41.631	Pteropus_vampyrus
ENSPFOG00000013217	nrde2	98	69.722	ENSPNYG00000022833	nrde2	99	70.479	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000013217	nrde2	91	53.656	ENSPNAG00000015807	nrde2	95	53.585	Pygocentrus_nattereri
ENSPFOG00000013217	nrde2	90	43.704	ENSRNOG00000004004	Nrde2	100	43.756	Rattus_norvegicus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.948	ENSSBOG00000024346	NRDE2	100	45.747	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.462	ENSSHAG00000016736	NRDE2	97	45.470	Sarcophilus_harrisii
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	50.867	ENSSFOG00015011794	nrde2	100	51.336	Scleropages_formosus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	69.836	ENSSMAG00000011671	nrde2	99	69.061	Scophthalmus_maximus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	73.086	ENSSDUG00000017948	nrde2	99	73.086	Seriola_dumerili
ENSPFOG00000013217	nrde2	91	73.234	ENSSLDG00000023798	nrde2	99	77.042	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPFOG00000013217	nrde2	91	46.764	ENSSPUG00000006348	NRDE2	97	47.842	Sphenodon_punctatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	94	73.889	ENSSPAG00000000539	nrde2	99	74.254	Stegastes_partitus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	45.075	ENSSSCG00000002434	NRDE2	100	45.620	Sus_scrofa
ENSPFOG00000013217	nrde2	98	45.798	ENSTGUG00000012462	-	99	46.108	Taeniopygia_guttata
ENSPFOG00000013217	nrde2	77	66.414	ENSTRUG00000002798	nrde2	97	66.306	Takifugu_rubripes
ENSPFOG00000013217	nrde2	88	40.361	ENSTBEG00000011834	NRDE2	82	51.402	Tupaia_belangeri
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	44.574	ENSTTRG00000013583	NRDE2	100	45.041	Tursiops_truncatus
ENSPFOG00000013217	nrde2	88	44.707	ENSUAMG00000004159	NRDE2	92	45.361	Ursus_americanus
ENSPFOG00000013217	nrde2	91	43.896	ENSUMAG00000006393	NRDE2	96	43.996	Ursus_maritimus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	43.325	ENSVVUG00000018202	NRDE2	88	45.883	Vulpes_vulpes
ENSPFOG00000013217	nrde2	91	44.455	ENSXETG00000015708	nrde2	91	45.158	Xenopus_tropicalis
ENSPFOG00000013217	nrde2	94	84.767	ENSXCOG00000013298	nrde2	100	84.857	Xiphophorus_couchianus
ENSPFOG00000013217	nrde2	99	91.681	ENSXMAG00000009320	nrde2	100	91.514	Xiphophorus_maculatus