EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000013491 (Gene tree)
Gene ID: 103140057
Gene Symbol: rab18b
Alias: -
Full Name: ras-related protein Rab-18-B
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 5467 bases
Position: chrKI519677.1:2538517-2543983
Accession: 103140057
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000013519	MMR_HSR1	PF01926.23	2.4e-07	1	1
ENSPFOP00000025397	MMR_HSR1	PF01926.23	6.7e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000031954	-	2152	-	ENSPFOP00000025397	237 (aa)	-	A0A096M1V6
ENSPFOT00000013538	-	2056	-	ENSPFOP00000013519	205 (aa)	XP_007555068	A0A087Y666

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000013491	rab18b	87	34.615	ENSPFOG00000008547	rab34a	59	34.615
ENSPFOG00000013491	rab18b	80	44.910	ENSPFOG00000014499	si:dkey-34d22.5	75	44.910
ENSPFOG00000013491	rab18b	93	32.461	ENSPFOG00000008890	rras	84	32.461
ENSPFOG00000013491	rab18b	77	30.625	ENSPFOG00000020033	rasd4	83	30.625
ENSPFOG00000013491	rab18b	82	51.765	ENSPFOG00000005479	rab30	83	51.765
ENSPFOG00000013491	rab18b	83	42.105	ENSPFOG00000011424	RAB41	79	42.105
ENSPFOG00000013491	rab18b	79	45.399	ENSPFOG00000013027	rab22a	99	45.399
ENSPFOG00000013491	rab18b	83	48.837	ENSPFOG00000006655	rab35b	100	43.842
ENSPFOG00000013491	rab18b	95	44.615	ENSPFOG00000000498	-	94	44.615
ENSPFOG00000013491	rab18b	85	43.429	ENSPFOG00000011316	rab11al	81	43.429
ENSPFOG00000013491	rab18b	84	44.382	ENSPFOG00000019144	-	72	44.382
ENSPFOG00000013491	rab18b	82	37.059	ENSPFOG00000000601	si:ch73-116o1.2	81	37.059
ENSPFOG00000013491	rab18b	86	48.023	ENSPFOG00000001829	rab1ab	87	48.023
ENSPFOG00000013491	rab18b	80	45.122	ENSPFOG00000006224	-	75	45.122
ENSPFOG00000013491	rab18b	94	41.237	ENSPFOG00000012977	rab22a	98	41.237
ENSPFOG00000013491	rab18b	87	33.889	ENSPFOG00000002595	hrasb	87	34.337
ENSPFOG00000013491	rab18b	82	45.562	ENSPFOG00000011310	rab25b	80	45.562
ENSPFOG00000013491	rab18b	84	44.382	ENSPFOG00000006314	-	72	44.382
ENSPFOG00000013491	rab18b	80	45.122	ENSPFOG00000006159	rab11ba	75	45.122
ENSPFOG00000013491	rab18b	95	45.192	ENSPFOG00000004786	rab2a	97	45.192
ENSPFOG00000013491	rab18b	97	40.887	ENSPFOG00000011263	rab5aa	91	40.887
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ENSPFOG00000013491	rab18b	80	40.828	ENSPFOG00000000349	rab33ba	70	40.828
ENSPFOG00000013491	rab18b	95	33.500	ENSPFOG00000003934	-	96	33.500
ENSPFOG00000013491	rab18b	79	45.062	ENSPFOG00000009284	rab11a	75	45.062
ENSPFOG00000013491	rab18b	96	41.546	ENSPFOG00000013182	RAB15	97	41.546
ENSPFOG00000013491	rab18b	78	44.375	ENSPFOG00000010632	rab25a	74	44.375
ENSPFOG00000013491	rab18b	83	43.605	ENSPFOG00000004684	-	81	43.605
ENSPFOG00000013491	rab18b	95	34.500	ENSPFOG00000003465	RAB7A	96	34.500
ENSPFOG00000013491	rab18b	71	46.259	ENSPFOG00000004037	rab33a	52	46.259
ENSPFOG00000013491	rab18b	77	30.864	ENSPFOG00000001515	rhebl1	85	30.864
ENSPFOG00000013491	rab18b	85	31.461	ENSPFOG00000011444	rab34b	70	31.461
ENSPFOG00000013491	rab18b	77	33.333	ENSPFOG00000004921	rheb	86	33.333
ENSPFOG00000013491	rab18b	93	42.347	ENSPFOG00000014418	-	95	42.347
ENSPFOG00000013491	rab18b	96	38.191	ENSPFOG00000003742	rab6ba	95	38.191
ENSPFOG00000013491	rab18b	83	42.690	ENSPFOG00000019509	rab6a	80	42.690
ENSPFOG00000013491	rab18b	93	33.500	ENSPFOG00000013066	RAB29	96	33.500
ENSPFOG00000013491	rab18b	93	45.361	ENSPFOG00000012594	rab1ba	90	45.361
ENSPFOG00000013491	rab18b	92	36.123	ENSPFOG00000004746	si:dkey-16l2.16	91	36.123
ENSPFOG00000013491	rab18b	83	34.483	ENSPFOG00000017960	rabl2	77	34.483
ENSPFOG00000013491	rab18b	80	42.424	ENSPFOG00000004838	rab42a	62	42.424
ENSPFOG00000013491	rab18b	88	44.505	ENSPFOG00000005901	-	89	42.233
ENSPFOG00000013491	rab18b	81	47.024	ENSPFOG00000017775	rab15	77	47.024
ENSPFOG00000013491	rab18b	79	46.914	ENSPFOG00000019821	RAB14	75	46.914
ENSPFOG00000013491	rab18b	81	34.337	ENSPFOG00000015499	kras	87	34.337
ENSPFOG00000013491	rab18b	93	35.897	ENSPFOG00000020060	rab9b	97	35.897
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ENSPFOG00000013491	rab18b	79	33.133	ENSPFOG00000006335	dnajc27	61	33.133
ENSPFOG00000013491	rab18b	80	45.122	ENSPFOG00000024114	-	75	45.122
ENSPFOG00000013491	rab18b	79	50.000	ENSPFOG00000013810	zgc:171927	74	50.000
ENSPFOG00000013491	rab18b	71	44.079	ENSPFOG00000022360	-	63	44.079
ENSPFOG00000013491	rab18b	71	40.816	ENSPFOG00000009101	-	63	40.816
ENSPFOG00000013491	rab18b	79	39.157	ENSPFOG00000024704	rab9a	83	39.157
ENSPFOG00000013491	rab18b	61	37.795	ENSPFOG00000024387	rras2	74	37.795
ENSPFOG00000013491	rab18b	92	43.455	ENSPFOG00000014630	rab4a	89	43.455
ENSPFOG00000013491	rab18b	84	45.143	ENSPFOG00000001579	rab12	67	46.951
ENSPFOG00000013491	rab18b	74	41.290	ENSPFOG00000015409	si:dkey-13a21.4	76	41.290
ENSPFOG00000013491	rab18b	79	34.146	ENSPFOG00000008678	si:cabz01085950.1	81	34.146
ENSPFOG00000013491	rab18b	83	42.197	ENSPFOG00000004492	RAB39B	81	42.197
ENSPFOG00000013491	rab18b	83	37.209	ENSPFOG00000011493	rab23	72	37.209
ENSPFOG00000013491	rab18b	80	44.848	ENSPFOG00000023458	rab5c	91	40.299
ENSPFOG00000013491	rab18b	80	47.561	ENSPFOG00000001167	-	76	47.561

Orthologs

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ENSPFOG00000013491	rab18b	99	76.050	ENSAMEG00000015990	RAB18	99	76.050	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000013491	rab18b	100	94.634	ENSACIG00000008102	rab18b	100	94.634	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000013491	rab18b	100	93.659	ENSAOCG00000013479	rab18b	100	93.659	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000013491	rab18b	100	93.171	ENSAPEG00000022923	rab18b	100	93.171	Amphiprion_percula
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ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSBTAG00000009871	RAB18	88	84.878	Bos_taurus
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ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSCAFG00020003253	RAB18	99	84.878	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSCHIG00000008749	RAB18	99	84.878	Capra_hircus
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.390	ENSTSYG00000013092	RAB18	99	84.390	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSCPOG00000032827	RAB18	99	84.878	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSCCAG00000006762	RAB18	99	84.878	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSCATG00000009672	RAB18	99	84.878	Cercocebus_atys
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ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSCANG00000035397	RAB18	99	84.878	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSCGRG00001017519	Rab18	99	84.878	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSCGRG00000017201	Rab18	99	84.878	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	89.706	ENSCSEG00000016803	rab18b	99	92.821	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	86.765	ENSDARG00000098344	rab18b	99	86.765	Danio_rerio
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSDNOG00000047713	RAB18	99	84.878	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000013491	rab18b	55	86.726	ENSDNOG00000038845	-	75	86.726	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	73.171	ENSDORG00000029360	-	95	73.171	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.390	ENSDORG00000028596	-	99	84.390	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSEASG00005007164	RAB18	99	84.878	Equus_asinus_asinus
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ENSPFOG00000013491	rab18b	94	85.938	ENSFALG00000007160	RAB18	99	83.981	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000013491	rab18b	100	96.098	ENSFHEG00000020035	rab18b	100	96.098	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000013491	rab18b	100	83.902	ENSGMOG00000016608	rab18b	100	83.902	Gadus_morhua
ENSPFOG00000013491	rab18b	99	84.878	ENSGALG00000007435	RAB18	99	84.878	Gallus_gallus
ENSPFOG00000013491	rab18b	100	99.024	ENSGAFG00000008560	rab18b	100	99.024	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000013491	rab18b	100	88.293	ENSGACG00000016395	rab18b	100	88.293	Gasterosteus_aculeatus
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