EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000013638 (Gene tree)
Gene ID: 103140767
Gene Symbol: prpf3
Alias: -
Full Name: PRP3 pre-mRNA processing factor 3 homolog (yeast)
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 7397 bases
Position: chrKI519687.1:159695-167091
Accession: ZDB-GENE-040823-3
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000013720	PRP3	PF08572.10	1.8e-77	1	1
ENSPFOP00000013720	PWI	PF01480.17	2.1e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000013739	-	3079	-	ENSPFOP00000013720	702 (aa)	-	A0A087Y6R7

Gene Model

Click here to download ENSPFOG00000013638's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPFOG00000013638's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSG00000117360	PRPF3	100	72.380	Homo_sapiens
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.950	ENSAPOG00000015584	prpf3	100	86.950	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	72.380	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.178	ENSACIG00000007876	prpf3	100	86.460	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.525	ENSAOCG00000011449	prpf3	100	87.092	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.686	ENSATEG00000023583	prpf3	100	86.364	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	72.419	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	72.380	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.186	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	71.469	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	72.380	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.325	ENSACLG00000020127	prpf3	100	86.040	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	80.252	ENSAMXG00000007306	prpf3	100	79.552	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	72.380	Bos_taurus
ENSPFOG00000013638	prpf3	81	39.092	WBGene00010844	prp-3	96	35.725	Caenorhabditis_elegans
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	72.380	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	72.380	Canis_familiaris
ENSPFOG00000013638	prpf3	81	71.228	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	72.105	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	72.380	Capra_hircus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	72.380	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000013638	prpf3	72	71.906	ENSCAPG00000017812	PRPF3	86	72.189	Cavia_aperea
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.671	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	72.238	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	72.380	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	59.494	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	60.056	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.955	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	72.521	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000013638	prpf3	76	81.752	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	81.387	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.853	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	72.096	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000013638	prpf3	59	59.712	ENSCING00000003312	-	99	59.472	Ciona_intestinalis
ENSPFOG00000013638	prpf3	83	52.901	ENSCSAVG00000008720	-	97	52.901	Ciona_savignyi
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.246	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	71.813	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	72.380	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	72.380	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	84.017	ENSCSEG00000002532	prpf3	100	84.017	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	90.896	ENSCVAG00000009318	prpf3	100	90.456	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	79.830	ENSDARG00000086425	prpf3	100	79.830	Danio_rerio
ENSPFOG00000013638	prpf3	89	75.000	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	67.801	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000013638	prpf3	93	71.537	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	72.146	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000013638	prpf3	80	52.632	FBgn0036915	Prp3	99	52.491	Drosophila_melanogaster
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	72.521	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	61.170	ENSEBUG00000011680	prpf3	100	61.037	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.955	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	72.521	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	72.380	Equus_caballus
ENSPFOG00000013638	prpf3	83	72.398	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	72.172	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	73.202	ENSELUG00000013624	prpf3	100	73.034	Esox_lucius
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	72.380	Felis_catus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.671	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	72.238	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	91.880	ENSFHEG00000021746	prpf3	100	91.880	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	80.872	ENSGMOG00000008535	prpf3	100	80.591	Gadus_morhua
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	72.560	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	72.521	Gallus_gallus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	96.439	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	96.439	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	84.322	ENSGACG00000011792	prpf3	100	83.757	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.711	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	74.245	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000013638	prpf3	86	77.876	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	77.581	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.467	ENSHBUG00000003493	prpf3	100	86.182	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.671	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	72.238	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	52.482	ENSHGLG00000016033	-	100	52.766	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	52.408	ENSHGLG00100008951	-	100	52.550	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.671	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	72.238	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	81.586	ENSHCOG00000014058	prpf3	100	82.295	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	79.007	ENSIPUG00000000902	PRPF3	100	78.612	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	72.380	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.913	ENSKMAG00000001390	prpf3	100	86.056	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.017	ENSLBEG00000026310	prpf3	100	89.130	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000013638	prpf3	93	67.018	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	66.867	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	72.380	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	72.380	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000013638	prpf3	92	71.473	ENSMMUG00000016301	PRPF3	97	73.259	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	72.380	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000013638	prpf3	98	49.000	ENSMLEG00000041065	-	97	49.143	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000013638	prpf3	86	77.876	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	77.581	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	84.703	ENSMAMG00000014968	prpf3	100	84.419	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.883	ENSMZEG00005015970	prpf3	100	86.883	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	72.560	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	72.521	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	72.380	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.530	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	74.423	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.671	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	72.238	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	80.028	ENSMMOG00000016131	prpf3	100	80.028	Mola_mola
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	72.316	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	72.560	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	83.003	ENSMALG00000007257	prpf3	100	82.955	Monopterus_albus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.388	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	71.955	Mus_caroli
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.388	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	71.955	Mus_musculus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.388	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	71.530	Mus_pahari
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.388	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	71.955	Mus_spretus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	69.972	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	70.538	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.429	ENSMLUG00000004646	-	100	71.994	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	72.380	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.798	ENSNBRG00000003462	prpf3	100	86.798	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000013638	prpf3	90	72.468	ENSNLEG00000009841	PRPF3	99	73.259	Nomascus_leucogenys
ENSPFOG00000013638	prpf3	83	64.118	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	63.968	Notamacropus_eugenii
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	72.380	Ochotona_princeps
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.994	ENSODEG00000011363	-	100	72.238	Octodon_degus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	54.202	ENSODEG00000014412	-	100	54.342	Octodon_degus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	87.024	ENSONIG00000006394	prpf3	100	87.024	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	55.698	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	55.698	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	72.380	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	85.470	ENSORLG00000010330	prpf3	100	84.758	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	85.613	ENSORLG00020009054	prpf3	100	84.900	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	85.328	ENSORLG00015015016	prpf3	100	84.615	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	87.179	ENSOMEG00000000940	prpf3	100	86.895	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	68.028	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	68.592	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	72.380	Ovis_aries
ENSPFOG00000013638	prpf3	98	55.683	ENSPPAG00000043769	-	99	55.029	Pan_paniscus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.671	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	72.238	Pan_paniscus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	72.380	Panthera_pardus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	72.380	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000013638	prpf3	98	54.676	ENSPTRG00000047819	-	99	54.023	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	72.380	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.671	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	72.238	Papio_anubis
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	80.309	ENSPKIG00000010501	prpf3	100	79.887	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	72.380	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	72.340	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	74.964	ENSPMGG00000007776	prpf3	100	73.684	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSPEMG00000011672	Prpf3	100	72.380	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPFOG00000013638	prpf3	61	72.603	ENSPMAG00000005588	prpf3	97	72.603	Petromyzon_marinus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	72.316	ENSPCIG00000008795	PRPF3	100	72.560	Phascolarctos_cinereus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	98.291	ENSPLAG00000018103	prpf3	100	98.291	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	98.006	ENSPMEG00000023546	prpf3	100	98.006	Poecilia_mexicana
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	96.866	ENSPREG00000017216	prpf3	100	96.866	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000013638	prpf3	76	62.687	ENSPPYG00000018646	-	99	63.619	Pongo_abelii
ENSPFOG00000013638	prpf3	93	70.669	ENSPPYG00000000900	PRPF3	99	71.277	Pongo_abelii
ENSPFOG00000013638	prpf3	87	72.846	ENSPCAG00000014908	PRPF3	87	73.127	Procavia_capensis
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.671	ENSPCOG00000013828	PRPF3	100	72.238	Propithecus_coquereli
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	70.822	ENSPVAG00000013472	PRPF3	100	71.388	Pteropus_vampyrus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.798	ENSPNYG00000004279	prpf3	100	86.798	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	78.992	ENSPNAG00000001799	prpf3	100	78.151	Pygocentrus_nattereri
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.530	ENSRNOG00000025629	Prpf3	100	72.096	Rattus_norvegicus
ENSPFOG00000013638	prpf3	82	74.265	ENSRBIG00000028854	PRPF3	98	73.529	Rhinopithecus_bieti
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSRROG00000027464	PRPF3	100	72.380	Rhinopithecus_roxellana
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	65.912	ENSSBOG00000033104	PRPF3	100	66.147	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.893	ENSSHAG00000009548	PRPF3	100	72.458	Sarcophilus_harrisii
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	79.416	ENSSFOG00015022014	prpf3	100	78.860	Scleropages_formosus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	86.076	ENSSMAG00000015739	prpf3	100	85.935	Scophthalmus_maximus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	82.051	ENSSDUG00000006840	prpf3	100	81.481	Seriola_dumerili
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	85.253	ENSSLDG00000015423	prpf3	100	85.534	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSSARG00000011064	PRPF3	100	72.380	Sorex_araneus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.827	ENSSPUG00000000809	PRPF3	100	71.648	Sphenodon_punctatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	85.997	ENSSPAG00000018721	prpf3	100	86.846	Stegastes_partitus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSSSCG00000030119	PRPF3	100	74.778	Sus_scrofa
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	62.906	ENSTGUG00000004552	PRPF3	100	62.764	Taeniopygia_guttata
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	80.912	ENSTRUG00000014923	prpf3	100	80.484	Takifugu_rubripes
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	81.601	ENSTNIG00000008058	prpf3	100	80.899	Tetraodon_nigroviridis
ENSPFOG00000013638	prpf3	80	71.946	ENSTBEG00000014072	PRPF3	88	73.077	Tupaia_belangeri
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	66.997	ENSTTRG00000010616	PRPF3	100	67.564	Tursiops_truncatus
ENSPFOG00000013638	prpf3	80	75.000	ENSUAMG00000009345	PRPF3	100	74.778	Ursus_americanus
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSUMAG00000003720	PRPF3	100	72.380	Ursus_maritimus
ENSPFOG00000013638	prpf3	87	77.376	ENSVPAG00000005425	PRPF3	89	77.149	Vicugna_pacos
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.813	ENSVVUG00000007933	PRPF3	100	72.380	Vulpes_vulpes
ENSPFOG00000013638	prpf3	99	71.469	ENSXETG00000018654	prpf3	100	71.469	Xenopus_tropicalis
ENSPFOG00000013638	prpf3	100	97.151	ENSXMAG00000016347	prpf3	100	97.151	Xiphophorus_maculatus