EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000014330 (Gene tree)
Gene ID: 103136487
Gene Symbol: urb2
Alias: -
Full Name: URB2 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 30363 bases
Position: chrKI519643.1:217285-247647
Accession: 103136487
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000022146	Urb2	PF10441.9	6.1e-17	1	1
ENSPFOP00000014479	Urb2	PF10441.9	6.4e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000029101	-	5144	-	ENSPFOP00000022146	1530 (aa)	-	A0A096LSK5
ENSPFOT00000014501	-	5226	XM_007549758	ENSPFOP00000014479	1577 (aa)	XP_007549820	A0A087Y8X6

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.459	ENSG00000135763	URB2	96	58.537	Homo_sapiens
ENSPFOG00000014330	urb2	90	63.858	ENSAPOG00000000608	urb2	100	62.269	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.219	ENSAMEG00000009206	URB2	100	34.997	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000014330	urb2	100	64.046	ENSAOCG00000019961	urb2	100	64.106	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000014330	urb2	100	64.106	ENSAPEG00000005263	urb2	100	64.166	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000014330	urb2	100	62.026	ENSATEG00000020930	urb2	100	61.789	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000014330	urb2	97	36.440	ENSAPLG00000002998	URB2	99	35.912	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000014330	urb2	99	38.005	ENSACAG00000001285	URB2	99	37.942	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.101	ENSANAG00000033963	URB2	99	35.053	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000014330	urb2	91	60.079	ENSACLG00000009254	urb2	100	60.343	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000014330	urb2	99	40.331	ENSAMXG00000003474	urb2	99	40.522	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.755	ENSBTAG00000010180	URB2	100	35.778	Bos_taurus
ENSPFOG00000014330	urb2	95	55.705	ENSCJAG00000010968	URB2	99	55.705	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.780	ENSCAFG00000012118	URB2	99	34.216	Canis_familiaris
ENSPFOG00000014330	urb2	93	32.821	ENSCAFG00020027217	URB2	98	33.129	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.399	ENSCHIG00000014513	URB2	100	35.189	Capra_hircus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.865	ENSTSYG00000006924	URB2	100	35.398	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000014330	urb2	61	43.558	ENSCPOG00000020777	-	99	43.558	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.133	ENSCCAG00000023932	URB2	99	34.848	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.829	ENSCATG00000043366	URB2	99	35.013	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.765	ENSCLAG00000006268	URB2	99	35.556	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.640	ENSCSAG00000010599	URB2	99	34.695	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000014330	urb2	69	40.594	ENSCHOG00000010163	URB2	69	40.594	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000014330	urb2	99	38.602	ENSCPBG00000006191	URB2	99	38.602	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.513	ENSCANG00000023711	URB2	99	34.507	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.674	ENSCGRG00001009591	Urb2	99	35.547	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.674	ENSCGRG00000011259	Urb2	99	35.547	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000014330	urb2	100	52.471	ENSCSEG00000000299	urb2	100	52.471	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000014330	urb2	100	75.062	ENSCVAG00000011011	urb2	100	75.435	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	43.702	ENSDARG00000003217	urb2	99	67.000	Danio_rerio
ENSPFOG00000014330	urb2	97	33.069	ENSDNOG00000043064	URB2	99	33.510	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.861	ENSDORG00000014975	Urb2	99	35.596	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000014330	urb2	95	38.028	ENSETEG00000002869	URB2	95	38.028	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.185	ENSEASG00005012060	URB2	100	35.171	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000014330	urb2	93	57.343	ENSECAG00000012338	URB2	100	57.343	Equus_caballus
ENSPFOG00000014330	urb2	92	51.773	ENSEEUG00000002669	URB2	92	51.773	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	47.782	ENSELUG00000014647	urb2	100	47.878	Esox_lucius
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.802	ENSFCAG00000007662	URB2	99	34.794	Felis_catus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	36.958	ENSFALG00000003385	URB2	99	36.569	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.769	ENSFDAG00000021079	URB2	99	35.546	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000014330	urb2	100	75.883	ENSFHEG00000010357	urb2	100	76.007	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	53.231	ENSGMOG00000012459	urb2	100	52.473	Gadus_morhua
ENSPFOG00000014330	urb2	99	36.911	ENSGALG00000011101	URB2	99	36.625	Gallus_gallus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	61.524	ENSGACG00000016179	urb2	100	61.524	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	38.335	ENSGAGG00000021879	URB2	99	38.365	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.650	ENSGGOG00000025643	URB2	99	34.640	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000014330	urb2	100	61.441	ENSHBUG00000018469	urb2	100	61.502	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000014330	urb2	97	34.593	ENSHGLG00000016561	URB2	99	34.658	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.785	ENSHGLG00100001838	URB2	99	34.708	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000014330	urb2	100	41.293	ENSIPUG00000020315	urb2	100	41.293	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.321	ENSSTOG00000025323	URB2	99	35.361	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	36.010	ENSJJAG00000011998	Urb2	99	35.539	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	66.161	ENSKMAG00000020129	urb2	100	66.101	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	37.984	ENSLACG00000002038	URB2	99	37.903	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000014330	urb2	99	43.722	ENSLOCG00000015462	urb2	99	43.850	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.778	ENSLAFG00000012484	URB2	100	35.320	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.788	ENSMFAG00000039905	URB2	99	34.635	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.956	ENSMMUG00000009509	URB2	99	34.802	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.893	ENSMNEG00000038762	URB2	99	34.739	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.766	ENSMLEG00000043252	URB2	99	34.950	Mandrillus_leucophaeus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	58.869	ENSMAMG00000020365	urb2	100	58.869	Mastacembelus_armatus
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ENSPFOG00000014330	urb2	94	34.556	ENSMGAG00000012073	URB2	98	34.574	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000014330	urb2	95	53.691	ENSMAUG00000017980	Urb2	99	53.691	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.513	ENSMICG00000033302	URB2	100	34.868	Microcebus_murinus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.403	ENSMOCG00000020369	Urb2	99	35.531	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000014330	urb2	100	61.190	ENSMALG00000006529	urb2	100	61.131	Monopterus_albus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.758	ENSMUSG00000031976	Urb2	99	34.403	Mus_musculus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.410	ENSMPUG00000012438	URB2	99	35.410	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.664	ENSNGAG00000016524	Urb2	99	35.592	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.962	ENSNLEG00000014450	URB2	99	34.783	Nomascus_leucogenys
ENSPFOG00000014330	urb2	91	41.441	ENSMEUG00000016434	URB2	92	41.441	Notamacropus_eugenii
ENSPFOG00000014330	urb2	88	78.571	ENSOPRG00000009906	URB2	86	78.571	Ochotona_princeps
ENSPFOG00000014330	urb2	99	36.118	ENSODEG00000005593	URB2	99	35.911	Octodon_degus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	62.918	ENSONIG00000017078	urb2	100	63.175	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.735	ENSOANG00000013732	URB2	99	34.929	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.911	ENSOCUG00000010700	URB2	100	35.893	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	60.244	ENSORLG00000010915	urb2	100	60.134	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000014330	urb2	100	60.220	ENSORLG00020003361	urb2	100	60.220	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000014330	urb2	100	59.890	ENSORLG00015001534	urb2	100	59.890	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000014330	urb2	100	61.336	ENSOMEG00000010076	urb2	100	61.543	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.089	ENSOGAG00000003021	URB2	100	35.116	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.335	ENSOARG00000003102	URB2	100	35.230	Ovis_aries
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.885	ENSPPAG00000040629	URB2	99	34.659	Pan_paniscus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.796	ENSPPRG00000012767	URB2	99	34.684	Panthera_pardus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.032	ENSPTIG00000012577	URB2	99	75.000	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.885	ENSPTRG00000002092	URB2	99	34.659	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000014330	urb2	99	33.755	ENSPANG00000002245	URB2	99	33.795	Papio_anubis
ENSPFOG00000014330	urb2	99	42.794	ENSPKIG00000005787	urb2	99	42.794	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000014330	urb2	99	37.666	ENSPSIG00000002690	URB2	99	37.666	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000014330	urb2	96	33.889	ENSPEMG00000019551	Urb2	100	34.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.087	ENSPCIG00000030071	URB2	99	34.628	Phascolarctos_cinereus
ENSPFOG00000014330	urb2	100	98.034	ENSPLAG00000014654	urb2	100	98.034	Poecilia_latipinna
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ENSPFOG00000014330	urb2	100	94.673	ENSPREG00000010268	urb2	100	94.673	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000014330	urb2	100	34.559	ENSPPYG00000000123	URB2	100	34.405	Pongo_abelii
ENSPFOG00000014330	urb2	100	35.414	ENSPCOG00000023537	URB2	100	35.287	Propithecus_coquereli
ENSPFOG00000014330	urb2	99	32.952	ENSPVAG00000002108	URB2	99	33.081	Pteropus_vampyrus
ENSPFOG00000014330	urb2	91	60.079	ENSPNYG00000016840	urb2	100	60.343	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000014330	urb2	99	42.357	ENSPNAG00000013684	urb2	99	42.320	Pygocentrus_nattereri
ENSPFOG00000014330	urb2	99	35.102	ENSRNOG00000026853	Urb2	97	34.741	Rattus_norvegicus
ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.879	ENSRBIG00000037937	URB2	99	34.843	Rhinopithecus_bieti
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ENSPFOG00000014330	urb2	99	34.866	ENSSBOG00000023055	URB2	99	34.662	Saimiri_boliviensis_boliviensis
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ENSPFOG00000014330	urb2	100	90.996	ENSXMAG00000015059	urb2	100	90.996	Xiphophorus_maculatus