EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000014484 (Gene tree)
Gene ID: 103137044
Gene Symbol: si:dkey-86e18.1
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC103137044
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4358 bases
Position: chrKI519647.1:474405-478762
Accession: 103137044
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000021760	Isy1	PF06246.12	5.7e-10	1	1
ENSPFOP00000014508	Isy1	PF06246.12	9.8e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000014530	-	3277	-	ENSPFOP00000014508	304 (aa)	XP_007550622	A0A087Y905
ENSPFOT00000029255	-	1494	-	ENSPFOP00000021760	259 (aa)	-	A0A096LRG9

Gene Model

Click here to download ENSPFOG00000014484's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPFOG00000014484's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	63.810	ENSAPOG00000002792	si:dkey-86e18.1	99	63.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	64.925	ENSACIG00000007867	si:dkey-86e18.1	99	64.925	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	64.639	ENSAOCG00000014440	si:dkey-86e18.1	99	64.639	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	62.102	ENSAPEG00000011831	si:dkey-86e18.1	99	62.102	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	60.256	ENSATEG00000018061	si:dkey-86e18.1	100	60.256	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	59.935	ENSACLG00000012308	si:dkey-86e18.1	100	60.127	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	52.045	ENSAMXG00000038638	si:dkey-86e18.1	99	52.045	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	53.401	ENSCSEG00000007482	-	99	53.401	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	70.227	ENSCVAG00000020099	si:dkey-86e18.1	99	70.227	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	55.212	ENSDARG00000043536	si:dkey-86e18.1	99	55.212	Danio_rerio
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	50.333	ENSELUG00000007229	si:dkey-86e18.1	99	50.333	Esox_lucius
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	79.805	ENSFHEG00000023250	si:dkey-86e18.1	99	79.805	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	76	91.810	ENSGAFG00000006609	si:dkey-86e18.1	78	91.810	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	59.609	ENSHBUG00000018237	si:dkey-86e18.1	100	59.810	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	50.741	ENSIPUG00000012213	si:dkey-86e18.1	100	50.741	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	68.182	ENSKMAG00000008387	si:dkey-86e18.1	99	68.182	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	55.682	ENSLBEG00000008055	si:dkey-86e18.1	98	55.926	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	42.160	ENSLACG00000003926	si:dkey-86e18.1	100	42.160	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	48.519	ENSLOCG00000008902	si:dkey-86e18.1	100	48.529	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	61.709	ENSMAMG00000016989	si:dkey-86e18.1	100	61.709	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	59.935	ENSMZEG00005019446	si:dkey-86e18.1	100	60.127	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	65.000	ENSMMOG00000002257	si:dkey-86e18.1	99	65.000	Mola_mola
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	61.597	ENSMALG00000004349	si:dkey-86e18.1	99	61.597	Monopterus_albus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	61.832	ENSNBRG00000023611	si:dkey-86e18.1	99	61.852	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	62.214	ENSONIG00000002738	si:dkey-86e18.1	100	62.222	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	60.000	ENSORLG00000028970	si:dkey-86e18.1	100	60.000	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	59.236	ENSORLG00020021835	si:dkey-86e18.1	100	59.236	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	59.494	ENSORLG00015018600	si:dkey-86e18.1	100	59.494	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	55.911	ENSOMEG00000001778	si:dkey-86e18.1	100	56.369	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	49.237	ENSPKIG00000009550	si:dkey-86e18.1	100	49.237	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	57.854	ENSPMGG00000008481	si:dkey-86e18.1	99	57.854	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	99.342	ENSPLAG00000009910	si:dkey-86e18.1	100	99.342	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	98.355	ENSPMEG00000003114	si:dkey-86e18.1	100	98.355	Poecilia_mexicana
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	82.239	ENSPREG00000002081	si:dkey-86e18.1	99	82.239	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	97	59.935	ENSPNYG00000007473	si:dkey-86e18.1	100	60.127	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	52.747	ENSPNAG00000008048	si:dkey-86e18.1	100	52.747	Pygocentrus_nattereri
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	47.482	ENSSFOG00015002284	si:dkey-86e18.1	100	47.482	Scleropages_formosus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	96	57.383	ENSSMAG00000017672	si:dkey-86e18.1	99	57.605	Scophthalmus_maximus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	61.562	ENSSDUG00000000818	si:dkey-86e18.1	100	61.562	Seriola_dumerili
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	60.625	ENSSLDG00000000289	si:dkey-86e18.1	100	60.625	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	67.638	ENSSPAG00000014712	si:dkey-86e18.1	100	67.638	Stegastes_partitus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	99	56.738	ENSTRUG00000024468	si:dkey-86e18.1	99	57.092	Takifugu_rubripes
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	79.923	ENSXCOG00000008851	si:dkey-86e18.1	99	79.923	Xiphophorus_couchianus
ENSPFOG00000014484	si:dkey-86e18.1	100	91.447	ENSXMAG00000011403	si:dkey-86e18.1	100	91.447	Xiphophorus_maculatus