EuRBPDB

Description

RBDs

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000015142 (Gene tree)
Gene ID: 103142904
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: si:dkey-98f17.5
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 14650 bases
Position: chrKI519713.1:941947-956596
Accession: ZDB-GENE-060526-354
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000015218	MMR_HSR1	PF01926.23	9.2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000015240	-	3430	-	ENSPFOP00000015218	451 (aa)	-	A0A087YB15

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	60.706	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	99	60.706

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.382	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	99	59.382	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.022	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	100	90.022	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	57.709	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	99	57.709	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	89.800	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	100	89.800	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.603	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	99	59.603	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.466	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	100	90.466	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.244	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	100	90.244	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.382	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	99	59.382	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	89.135	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	100	89.135	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.823	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	99	59.823	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	57.206	ENSACAG00000028632	-	99	57.206	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	58.681	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	99	58.681	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.909	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	100	90.909	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.737	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	59.737	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	79.204	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	100	79.204	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	79	60.167	ENSCING00000020807	-	94	60.167	Ciona_intestinalis
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	98	54.402	ENSCSAVG00000009987	-	98	54.628	Ciona_savignyi
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	87.140	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	84.543	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	58.278	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	99	58.720	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	60.044	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	99	60.044	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	94.235	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	100	94.235	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	98	82.167	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	100	82.167	Danio_rerio
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	60.486	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	100	73.096	Danio_rerio
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	79	55.182	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	95	55.182	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	79.510	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	79.510	Esox_lucius
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.251	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	59.251	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	94.013	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	100	94.013	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	89	54.703	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.703	Gadus_morhua
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.382	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	99	59.382	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	97.783	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	89	97.783	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	85	63.472	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	61.481	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	57	94.595	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	100	94.595	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	91.131	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	100	91.131	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	58.901	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	99	58.901	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	83.445	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	83.445	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.161	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.161	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	76.549	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	76.549	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	81	58.791	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	80	58.791	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	96	59.174	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	99	59.404	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	91.574	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	100	91.574	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	58.720	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	99	58.720	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	88.470	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	100	88.470	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	61.504	ENSLACG00000004899	-	99	61.504	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	61.470	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	98	61.693	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	69.128	ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.128	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	72.222	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	72.222	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	89.800	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	100	89.800	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	96	59.862	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	99	59.725	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	91.131	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	100	91.131	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	58.462	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	99	58.462	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	57.709	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	99	57.709	Mola_mola
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	98	87.330	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	100	87.330	Monopterus_albus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.382	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	99	59.382	Monopterus_albus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.466	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	100	90.466	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	96	59.633	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	98	59.633	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.121	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	99	59.121	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	91.131	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	100	91.131	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	85.366	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	100	85.366	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.823	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	99	59.823	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.603	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	99	59.603	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	88.470	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	100	88.470	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.823	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	99	59.823	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	88.914	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	100	88.914	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	90.022	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	100	90.022	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	60.265	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	99	60.265	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	58.720	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	99	59.031	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	56.984	ENSPKIG00000023918	-	98	56.984	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	74.558	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	100	74.558	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	59.341	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	99	59.341	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	83.814	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	100	83.814	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	100	99.113	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	100	99.113	Poecilia_latipinna
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