EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000015855 (Gene tree)
Gene ID: 103138280
Gene Symbol: tyw1
Alias: -
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 40501 bases
Position: chrKI519658.1:1455056-1495556
Accession: 103138280
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000029926	Wyosine_form	PF08608.12	1.7e-27	1	1
ENSPFOP00000015998	Wyosine_form	PF08608.12	1.7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.347	ENSG00000198874	TYW1	99	68.207	Homo_sapiens
ENSPFOG00000015855	tyw1	88	64.815	ENSG00000277149	TYW1B	93	65.948	Homo_sapiens
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	83.973	ENSAPOG00000014391	tyw1	100	81.806	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	77.870	ENSACIG00000007325	tyw1	100	78.099	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	83.562	ENSAOCG00000016792	tyw1	100	81.374	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	83.973	ENSAPEG00000015939	tyw1	100	81.770	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000015855	tyw1	90	79.027	ENSATEG00000006856	tyw1	94	77.697	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.847	ENSANAG00000037051	-	99	66.982	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	80.247	ENSACLG00000018688	tyw1	100	78.752	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	75.310	ENSAMXG00000004157	tyw1	99	76.138	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.711	ENSBTAG00000008446	TYW1	99	67.442	Bos_taurus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	65.854	ENSCJAG00000004295	-	99	66.125	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	65.850	ENSCAFG00000010867	-	99	67.579	Canis_familiaris
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	58.264	ENSCAFG00020005367	-	95	65.008	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.211	ENSCHIG00000019510	-	99	67.258	Capra_hircus
ENSPFOG00000015855	tyw1	89	67.169	ENSTSYG00000008236	-	99	66.968	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000015855	tyw1	87	64.431	ENSCAPG00000013569	-	100	64.431	Cavia_aperea
ENSPFOG00000015855	tyw1	97	65.890	ENSCPOG00000011182	-	98	65.710	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.621	ENSCCAG00000026643	-	99	67.344	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.073	ENSCATG00000043677	-	99	67.930	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000015855	tyw1	98	65.616	ENSCLAG00000006321	-	98	65.616	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.400	ENSCSAG00000018274	-	99	67.412	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000015855	tyw1	51	82.479	ENSCHOG00000003801	-	56	82.479	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.120	ENSCPBG00000014896	-	99	72.344	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000015855	tyw1	81	57.886	ENSCING00000004125	-	97	58.893	Ciona_intestinalis
ENSPFOG00000015855	tyw1	80	51.400	ENSCSAVG00000005712	-	100	55.689	Ciona_savignyi
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.347	ENSCANG00000033209	-	99	68.207	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000015855	tyw1	71	75.854	ENSCGRG00001003679	Tyw1	88	75.854	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	77.473	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	75.798	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000015855	tyw1	90	84.394	ENSCVAG00000001054	tyw1	96	83.187	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000015855	tyw1	100	72.863	ENSDARG00000062987	tyw1	97	74.355	Danio_rerio
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.166	ENSDNOG00000024165	-	99	66.985	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000015855	tyw1	87	61.994	ENSDORG00000014772	Tyw1	88	65.410	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000015855	tyw1	51	50.133	ENSETEG00000009904	-	81	50.411	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000015855	tyw1	59	74.074	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	74.074	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000015855	tyw1	98	67.715	ENSEASG00005008818	-	98	68.501	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000015855	tyw1	98	60.912	ENSECAG00000023164	-	98	81.034	Equus_caballus
ENSPFOG00000015855	tyw1	59	81.818	ENSEEUG00000005950	-	58	81.818	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	73.489	ENSELUG00000008449	tyw1	98	71.729	Esox_lucius
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.396	ENSFCAG00000014262	-	99	66.985	Felis_catus
ENSPFOG00000015855	tyw1	98	64.690	ENSFALG00000013810	-	99	64.690	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	64.714	ENSFDAG00000013270	-	99	65.986	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000015855	tyw1	83	83.604	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	83.604	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.622	ENSGALG00000001110	-	99	66.667	Gallus_gallus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	76.776	ENSGACG00000012692	tyw1	99	76.776	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000015855	tyw1	98	67.353	ENSGAGG00000022393	-	98	67.945	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000015855	tyw1	89	59.215	ENSGGOG00000001473	TYW1	99	60.181	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	79.973	ENSHBUG00000002640	tyw1	100	78.486	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000015855	tyw1	88	66.407	ENSHGLG00000012093	-	100	66.667	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	65.940	ENSHGLG00100011743	TYW1	99	66.076	Heterocephalus_glaber_male
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.125	ENSHCOG00000019949	tyw1	99	66.129	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000015855	tyw1	100	71.238	ENSIPUG00000016330	tyw1	100	71.904	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	64.595	ENSSTOG00000004067	-	91	65.182	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000015855	tyw1	97	65.223	ENSJJAG00000022959	Tyw1	99	65.082	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	82.944	ENSKMAG00000018599	tyw1	100	80.769	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000015855	tyw1	98	64.666	ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.484	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000015855	tyw1	97	73.370	ENSLOCG00000004035	tyw1	95	73.370	Lepisosteus_oculatus
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ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.209	ENSMMUG00000030374	-	99	68.065	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.575	ENSMNEG00000041992	-	99	73.588	Macaca_nemestrina
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ENSPFOG00000015855	tyw1	98	67.688	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	98	67.688	Mus_spretus
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ENSPFOG00000015855	tyw1	95	77.762	ENSNBRG00000016996	tyw1	98	79.063	Neolamprologus_brichardi
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ENSPFOG00000015855	tyw1	97	67.867	ENSOCUG00000003173	-	98	67.724	Oryctolagus_cuniculus
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ENSPFOG00000015855	tyw1	100	77.630	ENSORLG00015008095	tyw1	99	77.763	Oryzias_latipes_hsok
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ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.621	ENSPPRG00000004945	-	99	67.078	Panthera_pardus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	66.621	ENSPTIG00000019545	-	99	66.941	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	61.853	ENSPTRG00000023076	TYW1B	98	62.857	Pan_troglodytes
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ENSPFOG00000015855	tyw1	98	71.567	ENSPKIG00000006545	tyw1	96	72.261	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000015855	tyw1	96	76.912	ENSPMGG00000004240	tyw1	100	76.912	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPFOG00000015855	tyw1	99	67.896	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	67.896	Peromyscus_maniculatus_bairdii
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ENSPFOG00000015855	tyw1	99	80.110	ENSPNYG00000022381	tyw1	100	78.619	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000015855	tyw1	98	73.626	ENSPNAG00000009001	tyw1	98	75.586	Pygocentrus_nattereri
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