EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000016823 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: rpp38
Alias: -
Full Name: ribonuclease P/MRP 38 subunit
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 657 bases
Position: chrKI519687.1:1460296-1460952
Accession: ZDB-GENE-040718-258
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000016882	Ribosomal_L7Ae	PF01248.26	3.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000016904	-	612	-	ENSPFOP00000016882	203 (aa)	-	A0A087YFS9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	45.109	ENSG00000152464	RPP38	61	45.109	Homo_sapiens
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	58.654	ENSAPOG00000001240	rpp38	76	59.361	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000016823	rpp38	91	45.408	ENSAMEG00000018832	RPP38	68	45.408	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	61.881	ENSACIG00000011592	rpp38	76	63.507	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	58.108	ENSAOCG00000017293	rpp38	77	58.798	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	61.765	ENSAPEG00000002315	rpp38	76	62.326	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000016823	rpp38	99	61.905	ENSATEG00000000731	rpp38	76	61.905	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000016823	rpp38	92	46.734	ENSAPLG00000002054	RPP38	74	45.833	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	63.918	ENSACLG00000016958	rpp38	75	63.725	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	64.433	ENSACLG00000016962	rpp38	75	64.216	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000016823	rpp38	80	49.383	ENSAMXG00000025023	rpp38	61	49.708	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	45.355	ENSBTAG00000007702	RPP38	61	45.355	Bos_taurus
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	45.455	ENSCAFG00000024373	RPP38	65	45.455	Canis_familiaris
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	45.455	ENSCAFG00020008008	RPP38	65	45.455	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	44.444	ENSCHIG00000012484	RPP38	71	42.723	Capra_hircus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.027	ENSCPOG00000003981	RPP38	61	47.027	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	48.588	ENSCLAG00000010194	RPP38	61	48.588	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000016823	rpp38	78	44.886	ENSCSAG00000019055	RPP38	61	46.196	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	46.032	ENSCHOG00000004335	RPP38	65	46.032	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	43.434	ENSCGRG00001001395	Rpp38	66	43.434	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	43.434	ENSCGRG00000017441	Rpp38	66	43.434	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	58.586	ENSCSEG00000001721	rpp38	75	58.654	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	67.619	ENSCVAG00000001676	rpp38	76	67.873	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	96	50.515	ENSDARG00000040350	rpp38	71	51.485	Danio_rerio
ENSPFOG00000016823	rpp38	87	44.681	ENSDNOG00000040314	RPP38	65	44.681	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	49.718	ENSDORG00000009783	Rpp38	62	49.718	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000016823	rpp38	89	44.845	ENSETEG00000002839	RPP38	66	44.845	Echinops_telfairi
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	46.857	ENSEASG00005019783	RPP38	60	46.857	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000016823	rpp38	81	45.402	ENSEEUG00000014677	RPP38	60	45.402	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000016823	rpp38	81	53.403	ENSELUG00000010160	rpp38	67	53.465	Esox_lucius
ENSPFOG00000016823	rpp38	89	46.032	ENSFCAG00000022449	RPP38	64	46.032	Felis_catus
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	46.117	ENSFALG00000014804	RPP38	73	44.749	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000016823	rpp38	90	44.000	ENSFDAG00000018669	RPP38	66	44.000	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	72.038	ENSFHEG00000013741	rpp38	76	72.398	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000016823	rpp38	92	48.058	ENSGALG00000008794	RPP38	70	46.789	Gallus_gallus
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	63.918	ENSHBUG00000010937	rpp38	75	63.235	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.514	ENSHGLG00000012144	RPP38	61	47.514	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000016823	rpp38	75	52.288	ENSIPUG00000022879	rpp38	63	52.439	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	85	47.222	ENSSTOG00000025699	RPP38	61	47.222	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	46.316	ENSJJAG00000007523	Rpp38	65	46.316	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	60.396	ENSKMAG00000003986	rpp38	74	61.792	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000016823	rpp38	92	61.538	ENSLBEG00000006853	rpp38	76	59.330	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000016823	rpp38	93	44.186	ENSLACG00000006502	RPP38	74	44.493	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000016823	rpp38	90	48.969	ENSLOCG00000018347	rpp38	73	46.479	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	45.503	ENSLAFG00000000509	RPP38	66	45.503	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000016823	rpp38	78	44.886	ENSMMUG00000007679	RPP38	61	46.196	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000016823	rpp38	97	62.687	ENSMAMG00000012774	rpp38	72	63.682	Mastacembelus_armatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	63.918	ENSMZEG00005003200	rpp38	75	63.725	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	64.948	ENSMZEG00005003189	rpp38	75	64.216	Maylandia_zebra
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	49.510	ENSMGAG00000008217	RPP38	71	47.222	Meleagris_gallopavo
ENSPFOG00000016823	rpp38	87	43.367	ENSMAUG00000003644	Rpp38	66	43.367	Mesocricetus_auratus
ENSPFOG00000016823	rpp38	89	44.103	ENSMOCG00000007020	Rpp38	67	44.103	Microtus_ochrogaster
ENSPFOG00000016823	rpp38	83	60.795	ENSMMOG00000003446	rpp38	66	60.795	Mola_mola
ENSPFOG00000016823	rpp38	79	48.571	ENSMODG00000024091	RPP38	62	47.778	Monodelphis_domestica
ENSPFOG00000016823	rpp38	98	57.143	ENSMALG00000002356	rpp38	75	57.143	Monopterus_albus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.253	MGP_CAROLIEiJ_G0023133	Rpp38	62	47.253	Mus_caroli
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.253	ENSMUSG00000049950	Rpp38	62	47.253	Mus_musculus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.802	MGP_PahariEiJ_G0019193	Rpp38	62	47.802	Mus_pahari
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.253	MGP_SPRETEiJ_G0024051	Rpp38	62	47.253	Mus_spretus
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	47.120	ENSMPUG00000018523	RPP38	67	47.120	Mustela_putorius_furo
ENSPFOG00000016823	rpp38	84	41.899	ENSMLUG00000002153	RPP38	65	44.560	Myotis_lucifugus
ENSPFOG00000016823	rpp38	91	45.226	ENSNGAG00000011066	Rpp38	68	45.226	Nannospalax_galili
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	63.590	ENSNBRG00000006994	rpp38	75	64.706	Neolamprologus_brichardi
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	65.641	ENSONIG00000020467	rpp38	74	65.196	Oreochromis_niloticus
ENSPFOG00000016823	rpp38	83	46.328	ENSOCUG00000022768	-	63	47.027	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000016823	rpp38	83	45.604	ENSOCUG00000024367	-	63	47.027	Oryctolagus_cuniculus
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	61.194	ENSORLG00000009219	rpp38	76	61.137	Oryzias_latipes
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	61.194	ENSORLG00020011503	rpp38	72	61.137	Oryzias_latipes_hni
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	61.194	ENSORLG00015017702	rpp38	72	61.137	Oryzias_latipes_hsok
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	60.591	ENSOMEG00000005414	rpp38	75	60.094	Oryzias_melastigma
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	48.295	ENSOGAG00000008059	RPP38	61	47.727	Otolemur_garnettii
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	44.221	ENSOARG00000004534	RPP38	71	42.723	Ovis_aries
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	46.196	ENSPPAG00000041577	RPP38	55	46.196	Pan_paniscus
ENSPFOG00000016823	rpp38	89	46.032	ENSPPRG00000015329	RPP38	64	46.032	Panthera_pardus
ENSPFOG00000016823	rpp38	89	46.032	ENSPTIG00000007188	RPP38	64	46.032	Panthera_tigris_altaica
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	46.196	ENSPTRG00000002318	RPP38	55	46.196	Pan_troglodytes
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	54.348	ENSPKIG00000025652	rpp38	64	54.348	Paramormyrops_kingsleyae
ENSPFOG00000016823	rpp38	97	44.076	ENSPSIG00000001527	RPP38	72	44.076	Pelodiscus_sinensis
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	45.055	ENSPEMG00000008375	Rpp38	62	45.055	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	49.444	ENSPCIG00000009096	RPP38	58	49.444	Phascolarctos_cinereus
ENSPFOG00000016823	rpp38	100	89.908	ENSPLAG00000007626	rpp38	77	89.908	Poecilia_latipinna
ENSPFOG00000016823	rpp38	91	89.500	ENSPMEG00000020392	rpp38	79	89.500	Poecilia_mexicana
ENSPFOG00000016823	rpp38	100	88.532	ENSPREG00000017744	rpp38	78	88.532	Poecilia_reticulata
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	45.652	ENSPPYG00000002113	RPP38	61	45.652	Pongo_abelii
ENSPFOG00000016823	rpp38	78	47.674	ENSPVAG00000007155	RPP38	60	48.889	Pteropus_vampyrus
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	64.433	ENSPNYG00000004293	rpp38	75	63.725	Pundamilia_nyererei
ENSPFOG00000016823	rpp38	85	49.425	ENSPNAG00000010633	rpp38	69	49.189	Pygocentrus_nattereri
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	48.023	ENSRNOG00000038025	Rpp38	64	48.023	Rattus_norvegicus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.778	ENSSHAG00000015529	RPP38	62	47.778	Sarcophilus_harrisii
ENSPFOG00000016823	rpp38	99	59.903	ENSSMAG00000018276	rpp38	74	59.903	Scophthalmus_maximus
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	62.626	ENSSDUG00000001651	rpp38	75	62.319	Seriola_dumerili
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	61.616	ENSSLDG00000014355	rpp38	75	61.353	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	45.143	ENSSARG00000012099	RPP38	70	45.143	Sorex_araneus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	46.961	ENSSPUG00000018363	-	62	46.961	Sphenodon_punctatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	44.199	ENSSPUG00000008560	-	61	44.199	Sphenodon_punctatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	47.514	ENSSPUG00000005237	-	62	47.514	Sphenodon_punctatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	95	61.979	ENSSPAG00000020387	rpp38	74	62.189	Stegastes_partitus
ENSPFOG00000016823	rpp38	82	44.944	ENSSSCG00000027110	RPP38	61	44.944	Sus_scrofa
ENSPFOG00000016823	rpp38	94	48.780	ENSTGUG00000001366	RPP38	75	47.248	Taeniopygia_guttata
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ENSPFOG00000016823	rpp38	88	44.103	ENSTTRG00000004420	RPP38	65	44.103	Tursiops_truncatus
ENSPFOG00000016823	rpp38	91	45.408	ENSUAMG00000002618	RPP38	68	45.408	Ursus_americanus
ENSPFOG00000016823	rpp38	91	45.408	ENSUMAG00000012382	RPP38	68	45.408	Ursus_maritimus
ENSPFOG00000016823	rpp38	88	45.550	ENSVVUG00000005272	RPP38	67	45.550	Vulpes_vulpes
ENSPFOG00000016823	rpp38	84	44.134	ENSXETG00000003419	rpp38	67	44.503	Xenopus_tropicalis