EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000018774 (Gene tree)
Gene ID: 103152588
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: gastrula zinc finger protein XlCGF57.1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 3868 bases
Position: chrKI519617.1:5299925-5303792
Accession: 103152588
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSPFOP00000021360	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-66	6	13
ENSPFOP00000021360	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-66	7	13
ENSPFOP00000021360	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-66	8	13
ENSPFOP00000021360	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-66	9	13
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ENSPFOP00000021360	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-66	13	13
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ENSPFOP00000030204	zf-C2H2	PF00096.26	1.1e-58	11	11
ENSPFOP00000021344	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-58	1	11
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ENSPFOP00000021344	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-58	8	11
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ENSPFOP00000021344	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-58	10	11
ENSPFOP00000021344	zf-C2H2	PF00096.26	1.2e-58	11	11
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ENSPFOP00000021344	zf-met	PF12874.7	8e-37	6	6

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSPFOT00000023632	-	1284	-	ENSPFOP00000021344	428 (aa)	-	A0A096LQA3
ENSPFOT00000031732	-	3248	-	ENSPFOP00000021360	701 (aa)	XP_007573181	A0A096LQB9

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000018774	-	92	31.392	ENSPFOG00000008241	si:dkey-89b17.4	95	31.858
ENSPFOG00000018774	-	94	36.577	ENSPFOG00000010474	-	98	36.577
ENSPFOG00000018774	-	99	46.763	ENSPFOG00000004894	-	99	48.546
ENSPFOG00000018774	-	99	43.701	ENSPFOG00000003377	-	99	43.701
ENSPFOG00000018774	-	94	48.611	ENSPFOG00000021850	-	91	47.268
ENSPFOG00000018774	-	99	46.721	ENSPFOG00000001339	-	100	50.681
ENSPFOG00000018774	-	95	42.857	ENSPFOG00000010422	-	96	46.131
ENSPFOG00000018774	-	99	39.815	ENSPFOG00000023510	-	94	40.486
ENSPFOG00000018774	-	99	47.788	ENSPFOG00000015553	-	91	46.350
ENSPFOG00000018774	-	99	43.137	ENSPFOG00000024470	-	88	43.976
ENSPFOG00000018774	-	99	60.355	ENSPFOG00000018580	-	99	59.079
ENSPFOG00000018774	-	100	66.337	ENSPFOG00000018583	-	100	54.217
ENSPFOG00000018774	-	99	36.207	ENSPFOG00000017913	-	100	42.012
ENSPFOG00000018774	-	95	55.357	ENSPFOG00000024567	-	100	51.930
ENSPFOG00000018774	-	96	47.619	ENSPFOG00000000667	-	75	47.619
ENSPFOG00000018774	-	97	41.509	ENSPFOG00000024692	-	87	41.509
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