EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020104 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 765 bases
Position: chrKI519740.1:518914-519678
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000020230	MMR_HSR1	PF01926.23	9.9e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020254	-	765	-	ENSPFOP00000020230	255 (aa)	-	A0A087YQC7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000020104	-	85	39.450	ENSPFOG00000001388	-	63	39.450
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ENSPFOG00000020104	-	82	35.096	ENSPFOG00000023328	-	79	35.096
ENSPFOG00000020104	-	76	36.634	ENSPFOG00000022853	-	83	36.634
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ENSPFOG00000020104	-	82	39.623	ENSPFOG00000000263	-	60	39.623
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ENSPFOG00000020104	-	83	37.915	ENSPFOG00000024835	-	58	37.915
ENSPFOG00000020104	-	82	37.915	ENSPFOG00000018807	-	85	38.235
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ENSPFOG00000020104	-	78	43.216	ENSPFOG00000022954	-	69	43.216
ENSPFOG00000020104	-	80	36.715	ENSPFOG00000020945	-	63	36.715

Orthologs

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ENSPFOG00000020104	-	82	53.810	ENSAPOG00000002517	-	73	53.810	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	82	41.232	ENSAPOG00000002337	-	65	42.180	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	84	37.500	ENSAPOG00000022321	-	86	37.500	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	85	47.926	ENSAPOG00000009288	-	81	47.926	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	79	39.604	ENSAPOG00000021365	-	64	39.604	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	81	51.174	ENSAPOG00000002527	-	68	51.174	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSPFOG00000020104	-	80	32.512	ENSAPOG00000008529	-	76	32.512	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	82	39.623	ENSAPOG00000010738	-	65	39.623	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	79	35.644	ENSAPOG00000020108	-	57	35.644	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	80	32.536	ENSAPOG00000008819	-	87	32.536	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020104	-	80	39.130	ENSAPOG00000001075	-	91	39.130	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSPFOG00000020104	-	66	34.503	ENSACIG00000014670	-	66	34.503	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	81	43.062	ENSACIG00000006478	-	75	43.062	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	91	48.085	ENSACIG00000005587	-	82	48.085	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	57	31.646	ENSACIG00000014730	zgc:172131	80	31.646	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	71	33.158	ENSACIG00000014737	-	88	33.158	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	87	41.150	ENSACIG00000016635	-	82	41.150	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	80	41.748	ENSACIG00000012707	-	75	41.748	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020104	-	86	38.739	ENSACIG00000007178	-	73	38.739	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020104	-	75	40.722	ENSACIG00000005223	-	71	40.722	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	76	37.306	ENSACIG00000015088	-	74	37.306	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020104	-	63	44.172	ENSACIG00000012761	-	71	44.172	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	81	39.234	ENSACIG00000019149	-	61	39.713	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	79	41.791	ENSACIG00000007158	-	60	41.379	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020104	-	85	38.356	ENSACIG00000005780	-	64	38.356	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020104	-	84	38.889	ENSACIG00000002950	-	56	38.889	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020104	-	76	55.102	ENSAOCG00000016099	-	87	55.102	Amphiprion_ocellaris
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