EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020109 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1512 bases
Position: chrAYCK01029542.1:4817-6328
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	1	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	2	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	3	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	4	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	5	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	6	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	7	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	8	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	9	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	10	11
ENSPFOP00000020235	zf-C2H2	PF00096.26	1.5e-65	11	11
ENSPFOP00000020235	zf-met	PF12874.7	1.7e-19	1	2
ENSPFOP00000020235	zf-met	PF12874.7	1.7e-19	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020259	-	1512	-	ENSPFOP00000020235	504 (aa)	-	A0A087YQD2

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

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ENSPFOG00000020109	-	81	49.738	ENSPFOG00000002879	-	99	49.738
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ENSPFOG00000020109	-	93	48.523	ENSPFOG00000018784	-	100	52.522
ENSPFOG00000020109	-	81	51.058	ENSPFOG00000004616	-	99	51.058
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