EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020283 (Gene tree)
Gene ID: 103130656
Gene Symbol: arl4cb
Alias: -
Full Name: ADP-ribosylation factor-like 4Cb
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 579 bases
Position: chrKI520268.1:168620-169198
Accession: ZDB-GENE-040426-2382
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000020409	MMR_HSR1	PF01926.23	1.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020433	-	579	-	ENSPFOP00000020409	193 (aa)	-	A0A087YQV6

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000020283	arl4cb	75	30.667	ENSPFOG00000005666	sar1b	73	30.667
ENSPFOG00000020283	arl4cb	87	42.262	ENSPFOG00000012216	-	77	42.262
ENSPFOG00000020283	arl4cb	92	45.506	ENSPFOG00000017992	-	92	46.512
ENSPFOG00000020283	arl4cb	85	33.514	ENSPFOG00000006540	-	84	33.514
ENSPFOG00000020283	arl4cb	72	34.532	ENSPFOG00000012465	arl8a	71	34.532
ENSPFOG00000020283	arl4cb	86	36.145	ENSPFOG00000020069	arl14	83	36.145
ENSPFOG00000020283	arl4cb	62	37.500	ENSPFOG00000022194	-	58	37.500
ENSPFOG00000020283	arl4cb	94	30.220	ENSPFOG00000003916	arl8bb	71	35.461
ENSPFOG00000020283	arl4cb	93	39.665	ENSPFOG00000003241	arl1	93	40.000
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	39.444	ENSPFOG00000016633	arl8	96	39.444
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	47.191	ENSPFOG00000014787	-	96	47.191
ENSPFOG00000020283	arl4cb	90	36.994	ENSPFOG00000012486	arl3	86	38.889
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	46.927	ENSPFOG00000001778	arf3b	96	46.927
ENSPFOG00000020283	arl4cb	61	31.933	ENSPFOG00000012594	rab1ba	55	31.933
ENSPFOG00000020283	arl4cb	90	36.994	ENSPFOG00000012426	arl3	81	38.889
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	40.678	ENSPFOG00000005789	arl3l2	89	41.040
ENSPFOG00000020283	arl4cb	64	31.008	ENSPFOG00000010632	rab25a	58	31.008
ENSPFOG00000020283	arl4cb	94	30.220	ENSPFOG00000016361	arl8ba	71	35.461
ENSPFOG00000020283	arl4cb	67	30.435	ENSPFOG00000013027	rab22a	80	30.435
ENSPFOG00000020283	arl4cb	61	30.252	ENSPFOG00000013810	zgc:171927	54	30.252
ENSPFOG00000020283	arl4cb	92	47.753	ENSPFOG00000015817	arf5	92	48.538
ENSPFOG00000020283	arl4cb	64	31.008	ENSPFOG00000011310	rab25b	61	30.534
ENSPFOG00000020283	arl4cb	61	31.933	ENSPFOG00000001829	rab1ab	58	31.933
ENSPFOG00000020283	arl4cb	85	42.515	ENSPFOG00000007842	arl5c	88	42.515
ENSPFOG00000020283	arl4cb	90	32.022	ENSPFOG00000008534	ARL6	87	32.948
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	46.067	ENSPFOG00000012632	-	96	46.067
ENSPFOG00000020283	arl4cb	85	35.758	ENSPFOG00000006232	arl11	91	35.758
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	46.927	ENSPFOG00000006492	-	77	46.927
ENSPFOG00000020283	arl4cb	100	56.000	ENSPFOG00000020447	arl4d	93	57.754
ENSPFOG00000020283	arl4cb	67	30.435	ENSPFOG00000012977	rab22a	68	30.435
ENSPFOG00000020283	arl4cb	72	30.714	ENSPFOG00000000498	-	65	30.882
ENSPFOG00000020283	arl4cb	75	32.886	ENSPFOG00000023432	sar1ab	73	32.667
ENSPFOG00000020283	arl4cb	86	37.288	ENSPFOG00000003764	arfrp1	84	37.500
ENSPFOG00000020283	arl4cb	100	66.000	ENSPFOG00000020164	arl4aa	93	66.667
ENSPFOG00000020283	arl4cb	89	39.306	ENSPFOG00000001643	arl2	88	39.412
ENSPFOG00000020283	arl4cb	90	37.572	ENSPFOG00000019829	-	85	39.130
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	47.514	ENSPFOG00000013339	arf2b	96	46.369

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSG00000188042	ARL4C	94	95.000	Homo_sapiens
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.312	ENSAPOG00000023273	arl4cb	94	95.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSAMEG00000016052	ARL4C	75	95.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	96.875	ENSACIG00000000312	arl4cb	100	96.875	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	85.876	ENSACIG00000024420	-	90	85.876	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.312	ENSAPEG00000019862	arl4cb	94	95.556	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	96.354	ENSATEG00000019469	arl4cb	100	96.354	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	100	86.598	ENSATEG00000013007	-	93	86.188	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	93.750	ENSAPLG00000015708	ARL4C	94	93.889	Anas_platyrhynchos
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.271	ENSACAG00000010087	ARL4C	94	94.444	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSANAG00000038361	ARL4C	90	95.000	Aotus_nancymaae
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSACLG00000014218	arl4cb	94	95.000	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020283	arl4cb	93	86.740	ENSACLG00000014159	-	93	86.740	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.833	ENSAMXG00000024926	arl4cb	94	96.667	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	97	70.213	ENSAMXG00000024897	-	94	68.508	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCJAG00000042179	ARL4C	90	95.000	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	93	95.531	ENSCAFG00000012001	ARL4C	93	95.808	Canis_familiaris
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCAFG00020024408	ARL4C	94	95.000	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCHIG00000008457	ARL4C	94	95.000	Capra_hircus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSTSYG00000033922	ARL4C	90	95.000	Carlito_syrichta
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCCAG00000024558	ARL4C	90	95.000	Cebus_capucinus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCATG00000041801	ARL4C	89	95.000	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCLAG00000010525	ARL4C	93	95.000	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCSAG00000018795	ARL4C	94	95.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.312	ENSCPBG00000024707	ARL4C	94	96.111	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCANG00000035065	ARL4C	89	95.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCGRG00001010866	Arl4c	94	95.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSCGRG00000018449	Arl4c	94	95.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	91.146	ENSCSEG00000000838	arl4cb	83	91.111	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000020283	arl4cb	96	85.561	ENSCSEG00000005387	-	95	86.188	Cynoglossus_semilaevis
ENSPFOG00000020283	arl4cb	100	83.505	ENSCVAG00000023139	-	93	83.978	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	97.382	ENSCVAG00000020902	arl4cb	99	97.382	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.312	ENSDARG00000032708	arl4cb	94	95.556	Danio_rerio
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.271	ENSDARG00000057606	arl4ca	94	94.444	Danio_rerio
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSDNOG00000045362	ARL4C	94	95.000	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSDORG00000028955	Arl4c	94	95.000	Dipodomys_ordii
ENSPFOG00000020283	arl4cb	79	65.132	ENSEBUG00000004741	arl4cb	74	65.132	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSEASG00005019989	ARL4C	94	95.000	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	98	94.737	ENSEEUG00000012728	ARL4C	94	94.413	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	95	95.652	ENSELUG00000015699	arl4ca	91	95.930	Esox_lucius
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	96.354	ENSELUG00000004400	arl4cb	100	96.354	Esox_lucius
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSFCAG00000033226	ARL4C	89	95.000	Felis_catus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.312	ENSFALG00000015098	ARL4C	94	95.556	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSFDAG00000000777	ARL4C	94	95.000	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000020283	arl4cb	100	81.443	ENSFHEG00000013017	-	93	81.768	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	100	97.409	ENSFHEG00000009894	arl4cb	98	97.409	Fundulus_heteroclitus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	97.396	ENSGMOG00000020467	arl4cb	100	97.396	Gadus_morhua
ENSPFOG00000020283	arl4cb	91	96.000	ENSGALG00000052743	ARL4C	93	96.319	Gallus_gallus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	100	98.446	ENSGAFG00000020556	arl4cb	100	98.446	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.833	ENSGACG00000008143	arl4cb	94	96.111	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSGAGG00000013550	ARL4C	94	95.556	Gopherus_agassizii
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSGGOG00000023462	ARL4C	90	95.000	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSHBUG00000002490	arl4cb	94	95.000	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000020283	arl4cb	93	86.740	ENSHBUG00000009561	-	93	86.740	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSHGLG00000020294	ARL4C	94	95.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSPFOG00000020283	arl4cb	98	84.737	ENSHCOG00000008233	arl4cb	88	84.181	Hippocampus_comes
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.833	ENSIPUG00000002122	arl4cb	94	96.667	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	79.688	ENSIPUG00000006298	-	94	79.444	Ictalurus_punctatus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSSTOG00000023217	ARL4C	94	95.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.271	ENSJJAG00000010006	Arl4c	94	94.444	Jaculus_jaculus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	97.396	ENSKMAG00000011334	arl4cb	100	97.396	Kryptolebias_marmoratus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	96.875	ENSLBEG00000012677	arl4cb	100	96.875	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000020283	arl4cb	100	85.567	ENSLBEG00000010335	-	93	85.083	Labrus_bergylta
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	91.667	ENSLACG00000015350	ARL4C	90	91.667	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	96.354	ENSLOCG00000017842	arl4cb	92	96.667	Lepisosteus_oculatus
ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	94.792	ENSLAFG00000028097	ARL4C	94	95.000	Loxodonta_africana
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ENSPFOG00000020283	arl4cb	99	95.833	ENSMAMG00000013367	arl4cb	94	96.111	Mastacembelus_armatus
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