EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020390 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 18519 bases
Position: chrKI519850.1:473789-492307
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	1	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	2	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	3	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	4	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	5	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	6	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	7	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	8	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	9	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	10	11
ENSPFOP00000020516	zf-C2H2	PF00096.26	1e-60	11	11
ENSPFOP00000020516	zf-met	PF12874.7	6.2e-15	1	2
ENSPFOP00000020516	zf-met	PF12874.7	6.2e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020540	-	1503	-	ENSPFOP00000020516	501 (aa)	-	A0A087YR63

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000020390	-	81	49.213	ENSPFOG00000024469	-	97	49.213
ENSPFOG00000020390	-	80	44.758	ENSPFOG00000024748	-	75	46.377
ENSPFOG00000020390	-	71	32.877	ENSPFOG00000008241	si:dkey-89b17.4	85	32.121
ENSPFOG00000020390	-	78	50.530	ENSPFOG00000024048	-	98	48.348
ENSPFOG00000020390	-	86	46.411	ENSPFOG00000024512	-	83	46.411
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ENSPFOG00000020390	-	91	49.738	ENSPFOG00000005288	-	89	49.738
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ENSPFOG00000020390	-	76	46.104	ENSPFOG00000009483	-	100	48.366
ENSPFOG00000020390	-	91	53.299	ENSPFOG00000015553	-	73	53.299
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ENSPFOG00000020390	-	62	49.576	ENSPFOG00000010114	-	82	49.576
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ENSPFOG00000020390	-	92	40.925	ENSPFOG00000020449	-	100	45.307
ENSPFOG00000020390	-	90	48.276	ENSPFOG00000022634	-	100	51.538
ENSPFOG00000020390	-	97	50.909	ENSPFOG00000008638	-	99	50.909
ENSPFOG00000020390	-	99	50.704	ENSPFOG00000001339	-	100	55.340
ENSPFOG00000020390	-	62	43.675	ENSPFOG00000018771	-	62	43.675
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