EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020393 (Gene tree)
Gene ID: 103149997
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: oocyte zinc finger protein XlCOF6.1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1212 bases
Position: chrKI519850.1:608261-609472
Accession: 103149997
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000020519	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-49	1	8
ENSPFOP00000020519	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-49	2	8
ENSPFOP00000020519	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-49	3	8
ENSPFOP00000020519	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-49	4	8
ENSPFOP00000020519	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-49	5	8
ENSPFOP00000020519	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-49	6	8
ENSPFOP00000020519	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-49	7	8
ENSPFOP00000020519	zf-C2H2	PF00096.26	5.4e-49	8	8
ENSPFOP00000020519	zf-met	PF12874.7	1.1e-17	1	2
ENSPFOP00000020519	zf-met	PF12874.7	1.1e-17	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020543	-	1212	-	ENSPFOP00000020519	403 (aa)	XP_007569478	A0A087YR66

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSPFOG00000020393	-	95	43.077	ENSPFOG00000018782	-	91	43.077
ENSPFOG00000020393	-	98	45.935	ENSPFOG00000018784	-	99	48.252
ENSPFOG00000020393	-	90	51.341	ENSPFOG00000001339	-	100	53.138
ENSPFOG00000020393	-	99	46.795	ENSPFOG00000022423	-	92	48.214
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ENSPFOG00000020393	-	64	41.564	ENSPFOG00000005289	-	99	41.564
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ENSPFOG00000020393	-	92	49.145	ENSPFOG00000024642	-	99	50.500
ENSPFOG00000020393	-	72	32.581	ENSPFOG00000008519	-	100	35.556
ENSPFOG00000020393	-	86	40.927	ENSPFOG00000024470	-	98	40.927
ENSPFOG00000020393	-	95	48.276	ENSPFOG00000024085	-	97	48.276
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ENSPFOG00000020393	-	63	37.647	ENSPFOG00000007465	-	100	37.647
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