EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020533 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 276 bases
Position: chrKI519649.1:722876-723151
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000020659	zf-nanos	PF05741.13	6.7e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020683	-	276	-	ENSPFOP00000020659	92 (aa)	-	A0A087YRK6

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000020533	-	67	67.742	ENSG00000188613	NANOS1	75	66.667	Homo_sapiens
ENSPFOG00000020533	-	84	55.844	ENSG00000188425	NANOS2	55	55.844	Homo_sapiens
ENSPFOG00000020533	-	67	67.742	ENSAMEG00000020160	-	70	66.154	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000023803	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000025452	-	61	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000022041	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000026914	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000023823	-	61	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000027212	-	60	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000025655	-	61	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	88	50.617	ENSACAG00000024432	-	63	50.617	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000024434	-	63	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000024003	-	63	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	88	51.852	ENSACAG00000025556	-	56	51.852	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000022207	-	65	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	85	61.538	ENSACAG00000027867	-	96	61.538	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000022675	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000024639	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000023391	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000023650	-	60	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000022322	-	63	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000027568	-	61	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	86	55.000	ENSACAG00000011358	-	99	55.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000026478	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	47.619	ENSACAG00000024995	-	62	47.619	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000024504	-	61	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000026334	-	63	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000024218	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000023428	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000025632	-	63	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000026716	-	63	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000025307	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000025729	-	63	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000024274	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	74	55.882	ENSACAG00000022236	-	52	55.882	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000024364	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000022861	-	61	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000027440	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000022088	-	63	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000022918	-	60	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	51.190	ENSACAG00000026819	-	64	51.190	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000017474	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000027995	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000023813	-	63	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000023774	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000025093	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
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ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000023519	-	64	50.000	Anolis_carolinensis
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ENSPFOG00000020533	-	91	50.000	ENSACAG00000010268	-	60	50.000	Anolis_carolinensis
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ENSPFOG00000020533	-	91	48.810	ENSACAG00000014502	-	63	48.810	Anolis_carolinensis
ENSPFOG00000020533	-	100	95.652	ENSACLG00000013474	-	50	95.652	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020533	-	84	54.545	ENSBTAG00000047505	NANOS2	55	54.545	Bos_taurus
ENSPFOG00000020533	-	84	54.545	ENSCJAG00000012141	NANOS2	54	54.545	Callithrix_jacchus
ENSPFOG00000020533	-	67	67.742	ENSCAFG00000025549	-	59	60.811	Canis_familiaris
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSCAFG00000024541	NANOS2	55	53.247	Canis_familiaris
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSCAFG00020001772	NANOS2	55	53.247	Canis_lupus_dingo
ENSPFOG00000020533	-	84	54.545	ENSCHIG00000012637	NANOS2	55	54.545	Capra_hircus
ENSPFOG00000020533	-	84	51.948	ENSCAPG00000016771	NANOS2	58	51.948	Cavia_aperea
ENSPFOG00000020533	-	84	51.948	ENSCPOG00000014969	NANOS2	58	51.948	Cavia_porcellus
ENSPFOG00000020533	-	84	55.844	ENSCATG00000018951	NANOS2	55	55.844	Cercocebus_atys
ENSPFOG00000020533	-	90	49.425	ENSCLAG00000001832	NANOS2	66	49.425	Chinchilla_lanigera
ENSPFOG00000020533	-	84	55.844	ENSCSAG00000019629	NANOS2	55	55.844	Chlorocebus_sabaeus
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSCHOG00000001937	NANOS2	55	53.247	Choloepus_hoffmanni
ENSPFOG00000020533	-	97	55.435	ENSCPBG00000002172	NANOS1	75	55.435	Chrysemys_picta_bellii
ENSPFOG00000020533	-	84	54.545	ENSCANG00000012014	NANOS2	55	54.545	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSCGRG00001013726	Nanos2	58	53.247	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSCGRG00000019170	Nanos2	58	53.247	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPFOG00000020533	-	68	55.556	ENSCVAG00000006947	nanos2	57	49.351	Cyprinodon_variegatus
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSDNOG00000044718	NANOS2	55	53.247	Dasypus_novemcinctus
ENSPFOG00000020533	-	68	70.769	ENSEBUG00000002646	-	68	65.753	Eptatretus_burgeri
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSEASG00005014235	NANOS2	59	50.602	Equus_asinus_asinus
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSECAG00000006033	NANOS2	59	50.602	Equus_caballus
ENSPFOG00000020533	-	86	53.165	ENSEEUG00000009930	NANOS2	57	53.165	Erinaceus_europaeus
ENSPFOG00000020533	-	76	48.101	ENSELUG00000019091	-	55	48.101	Esox_lucius
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSFCAG00000027661	NANOS2	55	53.247	Felis_catus
ENSPFOG00000020533	-	58	43.396	ENSFALG00000006160	NANOS3	63	43.396	Ficedula_albicollis
ENSPFOG00000020533	-	84	53.247	ENSFDAG00000016342	NANOS2	57	53.247	Fukomys_damarensis
ENSPFOG00000020533	-	75	84.058	ENSGMOG00000015980	-	61	84.058	Gadus_morhua
ENSPFOG00000020533	-	63	56.897	ENSGMOG00000016541	nanos3	57	56.897	Gadus_morhua
ENSPFOG00000020533	-	100	89.130	ENSGMOG00000020465	nanos1	100	89.130	Gadus_morhua
ENSPFOG00000020533	-	99	81.319	ENSGAFG00000017593	NANOS1	52	81.319	Gambusia_affinis
ENSPFOG00000020533	-	100	96.739	ENSGACG00000016692	-	100	96.739	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000020533	-	75	85.507	ENSGACG00000004930	-	63	85.507	Gasterosteus_aculeatus
ENSPFOG00000020533	-	84	55.844	ENSGGOG00000013447	NANOS2	55	55.844	Gorilla_gorilla
ENSPFOG00000020533	-	100	95.652	ENSHBUG00000019798	-	50	95.652	Haplochromis_burtoni
ENSPFOG00000020533	-	84	50.649	ENSSTOG00000021724	NANOS2	58	50.649	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPFOG00000020533	-	86	41.772	ENSLACG00000013286	NANOS3	54	41.772	Latimeria_chalumnae
ENSPFOG00000020533	-	98	47.778	ENSLAFG00000014090	NANOS2	62	47.778	Loxodonta_africana
ENSPFOG00000020533	-	84	55.844	ENSMFAG00000017215	NANOS2	55	55.844	Macaca_fascicularis
ENSPFOG00000020533	-	67	67.742	ENSMMUG00000048654	NANOS1	75	66.667	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000020533	-	84	55.844	ENSMMUG00000008103	NANOS2	55	55.844	Macaca_mulatta
ENSPFOG00000020533	-	84	55.844	ENSMNEG00000004633	NANOS2	55	55.844	Macaca_nemestrina
ENSPFOG00000020533	-	84	55.844	ENSMLEG00000001810	NANOS2	55	55.844	Mandrillus_leucophaeus
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ENSPFOG00000020533	-	86	55.696	ENSMOCG00000001985	Nanos2	60	55.696	Microtus_ochrogaster
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