EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020555 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1557 bases
Position: chrKI520256.1:30700-32256
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000020681	MMR_HSR1	PF01926.23	8.3e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020705	-	1557	-	ENSPFOP00000020681	518 (aa)	-	A0A087YRM8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000020555	-	91	31.089	ENSPFOG00000010758	-	77	31.287
ENSPFOG00000020555	-	93	30.402	ENSPFOG00000020108	-	97	30.402
ENSPFOG00000020555	-	97	55.750	ENSPFOG00000021874	-	98	55.750
ENSPFOG00000020555	-	96	46.351	ENSPFOG00000009476	-	100	44.417
ENSPFOG00000020555	-	90	56.751	ENSPFOG00000024669	-	96	56.751
ENSPFOG00000020555	-	85	46.939	ENSPFOG00000023267	-	98	46.939
ENSPFOG00000020555	-	97	56.530	ENSPFOG00000020664	-	95	56.530
ENSPFOG00000020555	-	96	56.250	ENSPFOG00000020973	-	99	56.226
ENSPFOG00000020555	-	97	54.403	ENSPFOG00000020556	-	98	54.403
ENSPFOG00000020555	-	96	70.120	ENSPFOG00000022760	-	100	70.120
ENSPFOG00000020555	-	98	52.047	ENSPFOG00000019823	-	98	52.047
ENSPFOG00000020555	-	98	54.651	ENSPFOG00000001000	-	94	54.651
ENSPFOG00000020555	-	99	93.992	ENSPFOG00000001008	-	99	93.992

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000020555	-	86	32.495	ENSAPOG00000016636	-	92	32.495	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020555	-	96	55.952	ENSAPOG00000005749	-	92	55.952	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020555	-	97	55.294	ENSAPOG00000005726	-	94	55.294	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020555	-	97	56.556	ENSAPOG00000021040	-	85	56.556	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020555	-	88	32.479	ENSACIG00000009814	-	84	32.479	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	97	55.382	ENSACIG00000014961	-	93	55.382	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	96	58.333	ENSACIG00000001022	-	95	58.333	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	99	56.178	ENSACIG00000003888	-	97	57.143	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	97	57.002	ENSACIG00000002240	-	95	57.002	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	96	56.522	ENSACIG00000014898	-	93	57.227	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	98	57.611	ENSACIG00000012148	-	96	58.189	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	97	57.812	ENSACIG00000021449	-	94	57.812	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	97	56.202	ENSACIG00000008256	-	96	56.589	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	76	59.250	ENSACIG00000023712	-	99	59.250	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	96	57.310	ENSACIG00000003168	-	95	57.700	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	98	52.539	ENSACIG00000008246	-	93	52.539	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	95	53.984	ENSACIG00000008585	-	98	53.984	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	95	58.097	ENSACIG00000014973	-	95	58.097	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	97	58.077	ENSACIG00000010569	-	96	58.077	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	98	56.069	ENSACIG00000023726	-	97	56.455	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	97	60.665	ENSACIG00000021889	-	93	60.665	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	96	56.238	ENSACIG00000014982	-	96	56.238	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	95	57.344	ENSACIG00000021882	-	93	57.229	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020555	-	97	54.224	ENSAPEG00000000062	-	95	54.224	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000020555	-	97	50.098	ENSATEG00000017635	-	94	50.098	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020555	-	97	57.393	ENSATEG00000023346	-	95	57.588	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020555	-	97	56.031	ENSATEG00000019965	-	96	56.031	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020555	-	97	55.426	ENSATEG00000012558	-	96	55.620	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020555	-	85	55.806	ENSACLG00000006285	-	98	55.806	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	96	52.446	ENSACLG00000018599	-	98	52.446	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	95	57.006	ENSACLG00000006538	-	97	57.006	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	94	53.239	ENSACLG00000006543	-	90	53.414	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	92	53.498	ENSACLG00000021761	-	90	53.498	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	96	51.575	ENSACLG00000010007	-	76	51.575	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	73	54.047	ENSACLG00000015361	-	94	54.047	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	97	61.386	ENSACLG00000009261	-	98	61.386	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	99	52.896	ENSACLG00000018271	-	95	52.896	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	63	33.721	ENSACLG00000023033	-	85	33.721	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	96	30.297	ENSACLG00000023126	-	98	31.429	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	91	54.605	ENSACLG00000017259	-	94	54.605	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	76	58.576	ENSACLG00000009330	-	82	58.576	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020555	-	97	37.945	ENSAMXG00000037920	-	99	37.945	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000020555	-	94	40.237	ENSAMXG00000029346	-	96	41.199	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000020555	-	96	30.467	ENSAMXG00000035937	-	93	30.467	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000020555	-	98	35.609	ENSAMXG00000034407	-	97	35.609	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000020555	-	97	34.875	ENSAMXG00000041770	-	95	34.875	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000020555	-	96	37.695	ENSAMXG00000033407	-	97	38.596	Astyanax_mexicanus
ENSPFOG00000020555	-	97	44.298	ENSAMXG00000030535	-	97	44.298	Astyanax_mexicanus
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ENSPFOG00000020555	-	92	37.805	ENSAMXG00000039672	-	94	37.931	Astyanax_mexicanus
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ENSPFOG00000020555	-	97	57.843	ENSCVAG00000007803	-	97	58.039	Cyprinodon_variegatus
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