EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020556 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1557 bases
Position: chrKI520352.1:22384-23940
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000020682	MMR_HSR1	PF01926.23	1e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020706	-	1557	-	ENSPFOP00000020682	519 (aa)	-	A0A087YRM9

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000020556	-	98	57.087	ENSPFOG00000020973	-	98	57.540
ENSPFOG00000020556	-	96	51.904	ENSPFOG00000022760	-	98	51.904
ENSPFOG00000020556	-	97	57.115	ENSPFOG00000001000	-	93	57.312
ENSPFOG00000020556	-	98	53.801	ENSPFOG00000001008	-	97	53.801
ENSPFOG00000020556	-	98	54.403	ENSPFOG00000020555	-	97	54.403
ENSPFOG00000020556	-	97	47.937	ENSPFOG00000009476	-	99	47.816
ENSPFOG00000020556	-	88	33.264	ENSPFOG00000010758	-	74	33.058
ENSPFOG00000020556	-	97	54.941	ENSPFOG00000019823	-	96	54.150
ENSPFOG00000020556	-	99	64.038	ENSPFOG00000020664	-	97	64.038
ENSPFOG00000020556	-	98	57.476	ENSPFOG00000021874	-	98	57.476
ENSPFOG00000020556	-	95	31.579	ENSPFOG00000020108	-	97	31.579
ENSPFOG00000020556	-	91	64.916	ENSPFOG00000024669	-	97	64.916
ENSPFOG00000020556	-	87	49.446	ENSPFOG00000023267	-	89	51.493

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPFOG00000020556	-	100	57.443	ENSAPOG00000021040	-	87	56.298	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020556	-	99	57.996	ENSAPOG00000005726	-	96	57.996	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020556	-	96	55.336	ENSAPOG00000005749	-	92	55.336	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020556	-	86	33.836	ENSAPOG00000016636	-	91	33.621	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020556	-	98	59.612	ENSACIG00000023726	-	96	59.806	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	98	57.812	ENSACIG00000002240	-	96	57.812	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	95	30.888	ENSACIG00000022269	-	85	30.814	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	98	58.594	ENSACIG00000001022	-	96	57.812	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	98	58.008	ENSACIG00000021449	-	95	57.422	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	96	56.349	ENSACIG00000014898	-	94	56.480	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	98	61.133	ENSACIG00000021889	-	93	61.133	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	95	61.089	ENSACIG00000021882	-	93	60.721	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	96	56.574	ENSACIG00000008585	-	98	56.574	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	97	58.153	ENSACIG00000008246	-	91	57.957	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	74	61.340	ENSACIG00000023712	-	97	61.340	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	99	58.654	ENSACIG00000014961	-	94	58.462	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	99	57.925	ENSACIG00000010569	-	97	57.925	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	97	60.117	ENSACIG00000003168	-	96	60.506	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	98	58.333	ENSACIG00000008256	-	96	58.333	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	97	59.332	ENSACIG00000012148	-	94	57.926	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	97	57.339	ENSACIG00000014982	-	96	57.339	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	97	56.805	ENSACIG00000014973	-	95	56.805	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	98	59.020	ENSACIG00000003888	-	95	58.674	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	90	35.983	ENSACIG00000009814	-	86	35.504	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020556	-	99	55.426	ENSAPEG00000000062	-	96	55.426	Amphiprion_percula
ENSPFOG00000020556	-	97	61.736	ENSATEG00000023346	-	94	61.736	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020556	-	97	60.913	ENSATEG00000012558	-	93	61.310	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020556	-	100	55.192	ENSATEG00000017635	-	96	55.192	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020556	-	97	62.425	ENSATEG00000019965	-	93	62.425	Anabas_testudineus
ENSPFOG00000020556	-	78	66.007	ENSACLG00000009330	-	80	66.007	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020556	-	88	33.333	ENSACLG00000023468	-	81	32.919	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020556	-	92	53.498	ENSACLG00000021761	-	90	53.086	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020556	-	95	57.576	ENSACLG00000018599	-	95	57.172	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020556	-	99	62.178	ENSACLG00000009261	-	98	62.178	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020556	-	97	53.543	ENSACLG00000010007	-	76	53.543	Astatotilapia_calliptera
ENSPFOG00000020556	-	92	59.425	ENSACLG00000017259	-	93	59.425	Astatotilapia_calliptera
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