EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020691 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 5972 bases
Position: chrKI519621.1:3445201-3451172
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSPFOP00000020815	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-31	2	5
ENSPFOP00000020815	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-31	3	5
ENSPFOP00000020815	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-31	4	5
ENSPFOP00000020815	zf-C2H2	PF00096.26	8.2e-31	5	5
ENSPFOP00000020815	zf-met	PF12874.7	2.8e-05	1	2
ENSPFOP00000020815	zf-met	PF12874.7	2.8e-05	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000020841	-	5784	-	ENSPFOP00000020815	237 (aa)	-	A0A087YS12

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSPFOG00000020691	-	91	42.553	ENSPFOG00000018776	-	100	42.683
ENSPFOG00000020691	-	81	37.931	ENSPFOG00000024692	-	56	37.870
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