EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000020982 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 939 bases
Position: chrKI519930.1:89526-90464
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000021104	MMR_HSR1	PF01926.23	5.4e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000021132	-	876	-	ENSPFOP00000021104	292 (aa)	-	A0A087YSV1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000020982	-	67	35.500	ENSPFOG00000022479	-	83	35.500
ENSPFOG00000020982	-	79	63.102	ENSPFOG00000000259	-	88	63.102
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ENSPFOG00000020982	-	75	41.518	ENSPFOG00000000172	-	84	41.518
ENSPFOG00000020982	-	68	36.139	ENSPFOG00000003348	-	64	35.644
ENSPFOG00000020982	-	76	61.321	ENSPFOG00000000217	-	92	61.321
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ENSPFOG00000020982	-	72	37.931	ENSPFOG00000018914	-	94	37.931
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Orthologs

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ENSPFOG00000020982	-	72	65.877	ENSAPOG00000001075	-	96	66.190	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020982	-	70	34.247	ENSAPOG00000002527	-	69	34.247	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020982	-	57	61.905	ENSAPOG00000007631	-	88	57.513	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020982	-	68	69.192	ENSAPOG00000018915	-	85	69.192	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020982	-	87	44.882	ENSAPOG00000020108	-	67	45.238	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020982	-	99	53.952	ENSAPOG00000002337	-	72	57.955	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSPFOG00000020982	-	76	35.345	ENSAPOG00000009288	-	83	35.345	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSPFOG00000020982	-	67	64.583	ENSAPOG00000009059	-	89	64.943	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020982	-	66	30.457	ENSAPOG00000008819	-	85	30.457	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPFOG00000020982	-	92	36.585	ENSAPOG00000007181	-	55	37.943	Acanthochromis_polyacanthus
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ENSPFOG00000020982	-	56	65.644	ENSACIG00000022374	-	83	65.644	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020982	-	66	59.896	ENSACIG00000012204	-	81	59.896	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	56	47.853	ENSACIG00000000631	-	56	47.853	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	92	47.037	ENSACIG00000016313	-	80	49.020	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	82	39.453	ENSACIG00000012714	-	84	39.453	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	93	43.223	ENSACIG00000012159	-	62	45.161	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	93	58.672	ENSACIG00000006484	-	75	60.956	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	56	37.805	ENSACIG00000019509	-	75	37.805	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	67	35.616	ENSACIG00000009149	-	73	35.616	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	64	31.579	ENSACIG00000003906	-	61	31.579	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	71	39.171	ENSACIG00000005587	-	75	39.171	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020982	-	71	64.734	ENSACIG00000006478	-	77	64.734	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	63	65.217	ENSACIG00000005223	-	70	65.217	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020982	-	96	56.771	ENSACIG00000007158	-	72	56.771	Amphilophus_citrinellus
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ENSPFOG00000020982	-	63	35.519	ENSACIG00000003050	-	79	35.519	Amphilophus_citrinellus
ENSPFOG00000020982	-	65	38.191	ENSAOCG00000016099	-	87	38.191	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000020982	-	72	57.820	ENSAOCG00000022559	si:dkey-73p2.1	73	57.820	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000020982	-	75	39.462	ENSAOCG00000015984	-	80	37.903	Amphiprion_ocellaris
ENSPFOG00000020982	-	81	41.350	ENSAOCG00000013326	-	84	41.423	Amphiprion_ocellaris
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