EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000022423 (Gene tree)
Gene ID: 103147886
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 501-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 61808 bases
Position: chrKI519802.1:14929-76736
Accession: 103147886
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000026527	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-38	1	6
ENSPFOP00000026527	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-38	2	6
ENSPFOP00000026527	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-38	3	6
ENSPFOP00000026527	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-38	4	6
ENSPFOP00000026527	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-38	5	6
ENSPFOP00000026527	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-38	6	6
ENSPFOP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-37	1	6
ENSPFOP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-37	2	6
ENSPFOP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-37	3	6
ENSPFOP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-37	4	6
ENSPFOP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-37	5	6
ENSPFOP00000030426	zf-C2H2	PF00096.26	3.6e-37	6	6
ENSPFOP00000026527	zf-met	PF12874.7	8.1e-12	1	3
ENSPFOP00000026527	zf-met	PF12874.7	8.1e-12	2	3
ENSPFOP00000026527	zf-met	PF12874.7	8.1e-12	3	3
ENSPFOP00000030426	zf-met	PF12874.7	9.4e-11	1	2
ENSPFOP00000030426	zf-met	PF12874.7	9.4e-11	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000027196	-	3140	XM_016678867	ENSPFOP00000030426	427 (aa)	XP_016534353	A0A096MG85
ENSPFOT00000023036	-	2575	-	ENSPFOP00000026527	337 (aa)	-	A0A096M536

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000022423	-	92	46.281	ENSPFOG00000022095	-	96	46.091
ENSPFOG00000022423	-	75	41.875	ENSPFOG00000000667	-	75	41.875
ENSPFOG00000022423	-	82	45.669	ENSPFOG00000003366	-	87	45.669
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ENSPFOG00000022423	-	92	46.341	ENSPFOG00000022026	-	71	46.341
ENSPFOG00000022423	-	84	50.216	ENSPFOG00000024183	-	99	50.000
ENSPFOG00000022423	-	93	42.742	ENSPFOG00000023528	-	90	42.742
ENSPFOG00000022423	-	85	44.724	ENSPFOG00000024133	-	96	44.724
ENSPFOG00000022423	-	93	56.186	ENSPFOG00000000774	-	94	56.186
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ENSPFOG00000022423	-	92	48.214	ENSPFOG00000020392	-	99	48.214
ENSPFOG00000022423	-	87	58.065	ENSPFOG00000017595	-	100	58.065
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ENSPFOG00000022423	-	94	46.988	ENSPFOG00000018583	-	89	46.154
ENSPFOG00000022423	-	86	50.000	ENSPFOG00000005592	-	100	50.000
ENSPFOG00000022423	-	92	50.800	ENSPFOG00000020109	-	99	50.800
ENSPFOG00000022423	-	88	54.375	ENSPFOG00000023483	-	100	54.375
ENSPFOG00000022423	-	89	37.736	ENSPFOG00000006287	-	67	37.736
ENSPFOG00000022423	-	92	50.800	ENSPFOG00000020455	-	99	50.800
ENSPFOG00000022423	-	99	51.579	ENSPFOG00000019617	-	100	51.579
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