EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000022634 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3682 bases
Position: chrAYCK01029733.1:761-4442
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPFOP00000030922	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-50	1	8
ENSPFOP00000030922	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-50	2	8
ENSPFOP00000030922	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-50	3	8
ENSPFOP00000030922	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-50	4	8
ENSPFOP00000030922	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-50	5	8
ENSPFOP00000030922	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-50	6	8
ENSPFOP00000030922	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-50	7	8
ENSPFOP00000030922	zf-C2H2	PF00096.26	8.9e-50	8	8
ENSPFOP00000028655	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-45	1	7
ENSPFOP00000028655	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-45	2	7
ENSPFOP00000028655	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-45	3	7
ENSPFOP00000028655	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-45	4	7
ENSPFOP00000028655	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-45	5	7
ENSPFOP00000028655	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-45	6	7
ENSPFOP00000028655	zf-C2H2	PF00096.26	3.1e-45	7	7
ENSPFOP00000030922	zf-met	PF12874.7	2.7e-07	1	1
ENSPFOP00000028655	zf-met	PF12874.7	1.9e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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ENSPFOT00000022993	-	1206	-	ENSPFOP00000030922	402 (aa)	-	A0A096MHN1

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000022634	-	88	47.059	ENSPFOG00000000624	-	100	47.656
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ENSPFOG00000022634	-	89	40.458	ENSPFOG00000023510	-	94	41.176
ENSPFOG00000022634	-	68	40.141	ENSPFOG00000007708	-	99	37.269
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ENSPFOG00000022634	-	89	41.618	ENSPFOG00000006782	-	99	41.667
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ENSPFOG00000022634	-	68	36.620	ENSPFOG00000014213	PRDM15	51	36.620
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ENSPFOG00000022634	-	89	41.081	ENSPFOG00000024470	-	99	40.370
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