EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000022933 (Gene tree)
Gene ID: 107837947
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: zinc finger protein 879-like
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6834 bases
Position: chrKI519802.1:406060-412893
Accession: 107837947
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSPFOP00000025073	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-42	2	7
ENSPFOP00000025073	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-42	3	7
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ENSPFOP00000025073	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-42	6	7
ENSPFOP00000025073	zf-C2H2	PF00096.26	7.8e-42	7	7
ENSPFOP00000025073	zf-met	PF12874.7	2.9e-13	1	2
ENSPFOP00000025073	zf-met	PF12874.7	2.9e-13	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPFOT00000023072	-	5100	-	ENSPFOP00000025073	662 (aa)	XP_016534346	A0A096M0Y2

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
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ENSPFOG00000022933	-	61	44.737	ENSPFOG00000009806	-	100	39.041
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