EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPFOG00000023732 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Poecilia_formosa
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9939 bases
Position: chrKI520592.1:39897-49835
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
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ENSPFOP00000024944	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-39	3	8
ENSPFOP00000024944	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-39	4	8
ENSPFOP00000024944	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-39	5	8
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ENSPFOP00000024944	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-39	7	8
ENSPFOP00000024944	zf-C2H2	PF00096.26	5.8e-39	8	8
ENSPFOP00000021419	zf-C2H2	PF00096.26	6.6e-09	1	1
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ENSPFOP00000024944	zf-met	PF12874.7	1.1e-10	2	3
ENSPFOP00000024944	zf-met	PF12874.7	1.1e-10	3	3

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
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Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPFOG00000023732	-	68	39.827	ENSPFOG00000010114	-	62	43.842
ENSPFOG00000023732	-	76	42.063	ENSPFOG00000010113	-	51	42.063
ENSPFOG00000023732	-	82	45.614	ENSPFOG00000004126	-	100	46.570
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ENSPFOG00000023732	-	98	41.053	ENSPFOG00000007333	-	93	41.053
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