EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000001441 (Gene tree)
Gene ID: 111860043
Gene Symbol: sbno1
Alias: -
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18280 bases
Position: chrPGUA01000396.1:162550-180829
Accession: 111860043
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000014403	ResIII	PF04851.15	7.6e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000038844	-	4171	-	ENSPKIP00000014403	1388 (aa)	XP_023699099	UPI000CD64BD4

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000001441's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000001441's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000001441	sbno1	69	64.399	ENSPKIG00000024201	si:ch73-63e15.2	69	64.399
ENSPKIG00000001441	sbno1	73	58.566	ENSPKIG00000009707	-	79	64.172

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.371	ENSG00000139697	SBNO1	99	80.143	Homo_sapiens
ENSPKIG00000001441	sbno1	83	86.320	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	86.234	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.542	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	80.314	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	77.927	ENSACIG00000008088	sbno1	99	78.279	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.396	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	80.679	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.396	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	80.679	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.892	ENSATEG00000006667	sbno1	99	80.821	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	81.136	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	81.272	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	79.263	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	79.249	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000001441	sbno1	94	86.545	ENSANAG00000029958	-	99	85.435	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	77.116	ENSACLG00000024913	sbno1	100	77.243	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	85.214	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	85.143	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.670	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	80.443	Bos_taurus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.500	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	80.272	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.599	ENSCAFG00000007503	SBNO1	96	88.095	Canis_familiaris
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	84.144	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	84.144	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.176	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	86.176	Capra_hircus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.500	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	80.272	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	81.668	ENSCAPG00000000384	SBNO1	99	86.486	Cavia_aperea
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.486	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	86.486	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	76.303	ENSCCAG00000035316	SBNO1	99	76.000	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	79.325	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	86.126	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.667	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	86.667	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000001441	sbno1	83	84.801	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	84.715	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000001441	sbno1	96	77.290	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	76.982	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	81.195	ENSCPBG00000025968	SBNO1	98	81.116	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	76.353	ENSCANG00000042688	-	99	75.997	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	84.919	ENSCGRG00001017470	Sbno1	99	84.919	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	84.919	ENSCGRG00000004756	Sbno1	99	84.919	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.293	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	79.491	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.579	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	80.862	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	84.781	ENSDARG00000099080	sbno1	99	84.709	Danio_rerio
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.916	ENSDNOG00000017147	SBNO1	95	83.499	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	73.820	ENSDORG00000015261	Sbno1	83	83.453	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000001441	sbno1	93	76.656	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	76.656	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000001441	sbno1	75	62.441	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.383	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000001441	sbno1	51	77.260	ENSEASG00005012595	-	92	77.419	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.857	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	80.987	Equus_caballus
ENSPKIG00000001441	sbno1	82	80.874	ENSEEUG00000003793	SBNO1	82	80.874	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	83.980	ENSELUG00000002886	sbno1	99	83.427	Esox_lucius
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.641	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	80.558	Felis_catus
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	81.500	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	81.558	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.286	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	82.011	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.612	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	81.657	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000001441	sbno1	94	83.155	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	83.295	Gadus_morhua
ENSPKIG00000001441	sbno1	88	81.796	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	81.811	Gallus_gallus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.555	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	81.767	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000001441	sbno1	94	81.963	ENSGACG00000015633	sbno1	99	82.192	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000001441	sbno1	93	87.713	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	87.184	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.306	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	86.306	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	71.674	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	71.868	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000001441	sbno1	94	87.091	ENSHGLG00000014165	-	99	85.841	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000001441	sbno1	92	85.328	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	85.328	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	85.694	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	85.612	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.126	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	86.126	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.500	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	81.802	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.878	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	80.595	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.986	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	80.986	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	77.825	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	80.161	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	88.762	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	89.000	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	79.914	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	79.986	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.371	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	82.531	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.443	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	82.531	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.126	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	86.126	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.060	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	80.989	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	81.692	ENSMGAG00000003274	SBNO1	99	81.747	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000001441	sbno1	50	77.730	ENSMAUG00000004834	-	99	77.253	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	79.429	ENSMICG00000006573	-	99	82.771	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	85.817	ENSMOCG00000009390	Sbno1	99	85.817	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	76.387	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	76.617	Mola_mola
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.601	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	80.615	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.704	ENSMALG00000001056	sbno1	100	79.196	Monopterus_albus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.029	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	95	91.667	Mus_caroli
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.243	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	91.667	Mus_musculus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.329	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	95	91.667	Mus_pahari
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.243	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	95	91.667	Mus_spretus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.857	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	80.629	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.714	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	80.486	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.714	ENSNGAG00000012620	Sbno1	98	87.280	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	77.260	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	77.459	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	77.587	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	78.378	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000001441	sbno1	62	76.875	ENSMEUG00000008768	-	93	75.625	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	79.143	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	79.357	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.486	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	86.486	Octodon_degus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.323	ENSONIG00000015348	sbno1	100	79.211	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	79.753	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	79.840	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.269	ENSORLG00000001593	sbno1	99	80.306	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.538	ENSORLG00020015216	sbno1	99	80.255	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.538	ENSORLG00015002726	sbno1	99	80.255	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.538	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	80.255	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000001441	sbno1	50	74.713	ENSOGAG00000010781	-	99	75.036	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.627	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	80.399	Ovis_aries
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.486	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	86.486	Pan_paniscus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.641	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	80.558	Panthera_pardus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.528	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	80.444	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.306	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	86.306	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.126	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	86.126	Papio_anubis
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	80.769	ENSPSIG00000009572	-	99	80.470	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000001441	sbno1	92	76.935	ENSPSIG00000009256	-	99	77.357	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	85.637	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	85.637	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.186	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	80.415	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.003	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	81.427	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.003	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	81.427	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.946	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	81.201	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.452	ENSPREG00000017746	sbno1	100	80.707	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.286	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	79.986	Pongo_abelii
ENSPKIG00000001441	sbno1	88	73.842	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	73.619	Procavia_capensis
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.496	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	86.496	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000001441	sbno1	87	86.853	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	86.853	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	79.223	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	79.096	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	85.816	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	84.593	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	85.946	ENSRNOG00000001064	Sbno1	99	85.946	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	86.126	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	86.126	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000001441	sbno1	97	76.889	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	76.963	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	93.089	ENSSFOG00015019025	sbno1	100	93.089	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.413	ENSSMAG00000013640	sbno1	100	81.272	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	81.016	ENSSDUG00000023480	sbno1	100	81.215	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.946	ENSSLDG00000007928	sbno1	100	81.144	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000001441	sbno1	89	83.495	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	84.006	Sorex_araneus
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	79.240	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	79.484	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.775	ENSSPAG00000016244	sbno1	100	80.902	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.258	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	80.343	Sus_scrofa
ENSPKIG00000001441	sbno1	98	81.428	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	81.487	Taeniopygia_guttata
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.170	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	80.439	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000001441	sbno1	56	75.062	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	75.280	Tetraodon_nigroviridis
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.569	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	80.486	Ursus_americanus
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.569	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	80.486	Ursus_maritimus
ENSPKIG00000001441	sbno1	95	75.891	ENSVPAG00000007024	SBNO1	95	75.640	Vicugna_pacos
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	80.714	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	80.486	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000001441	sbno1	99	77.104	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	77.033	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000001441	sbno1	89	79.968	ENSXCOG00000011607	sbno1	99	78.369	Xiphophorus_couchianus
ENSPKIG00000001441	sbno1	100	80.946	ENSXMAG00000002140	sbno1	100	81.201	Xiphophorus_maculatus