EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000003313 (Gene tree)
Gene ID: 111859451
Gene Symbol: papolg
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma-like
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10596 bases
Position: chrPGUA01000012.1:3823892-3834487
Accession: 111859451
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000017457	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.2e-28	1	2
ENSPKIP00000017457	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.2e-28	2	2
ENSPKIP00000017410	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.6e-28	1	2
ENSPKIP00000017410	PAP_RNA-bind	PF04926.15	3.6e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000041969	-	3644	-	ENSPKIP00000017457	713 (aa)	-	-
ENSPKIT00000041920	-	3722	XM_023842113	ENSPKIP00000017410	739 (aa)	XP_023697881	UPI000CD61448

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000003313's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000003313's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000003313	papolg	99	58.808	ENSPKIG00000014471	papola	99	59.713
ENSPKIG00000003313	papolg	97	76.034	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	76.286

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.630	ENSG00000115421	PAPOLG	100	85.897	Homo_sapiens
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.867	ENSAPOG00000004798	papolg	99	77.867	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	71.984	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	99	72.386	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.689	ENSACIG00000010546	papolg	99	73.706	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.733	ENSAOCG00000010254	papolg	99	77.733	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000003313	papolg	100	78.000	ENSAPEG00000006944	papolg	99	78.000	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.036	ENSATEG00000009007	papolg	98	77.733	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	66.358	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	66.358	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000003313	papolg	80	59.106	ENSACAG00000015048	-	100	59.106	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.721	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	73.721	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.393	ENSACLG00000015592	papolg	98	75.195	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000003313	papolg	100	78.071	ENSAMXG00000004611	papolg	100	78.071	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.377	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	72.377	Bos_taurus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.363	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	72.363	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	71.812	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	64.194	Canis_familiaris
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.895	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	74.309	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.244	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	72.244	Capra_hircus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	71.788	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	71.788	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000003313	papolg	53	80.315	ENSCAPG00000014901	-	100	80.315	Cavia_aperea
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.727	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	72.727	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.345	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	74.345	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000003313	papolg	91	80.258	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	80.258	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.836	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	72.836	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.363	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	72.363	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000003313	papolg	89	70.282	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	70.282	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000003313	papolg	72	61.284	ENSCING00000024664	-	96	61.284	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000003313	papolg	70	63.400	ENSCSAVG00000009085	-	99	63.400	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.136	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	74.136	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	71.622	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	71.622	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000003313	papolg	99	71.622	ENSCGRG00000005552	-	100	71.622	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.962	ENSCSEG00000000771	papolg	99	75.962	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.333	ENSCVAG00000016602	papolg	89	89.579	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	79.470	ENSDARG00000012141	papolg	100	79.470	Danio_rerio
ENSPKIG00000003313	papolg	100	70.187	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	70.187	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000003313	papolg	60	85.151	ENSDORG00000016228	Papolg	100	85.151	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000003313	papolg	99	58.233	ENSETEG00000011815	PAPOLG	100	58.478	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000003313	papolg	61	70.284	ENSEBUG00000004020	papolg	93	67.971	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000003313	papolg	66	57.569	ENSEBUG00000005042	-	84	56.033	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.619	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	73.016	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.619	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	72.995	Equus_caballus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	64.171	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	64.171	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	80.149	ENSELUG00000014497	papolg	99	70.567	Esox_lucius
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.473	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	72.473	Felis_catus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	60.450	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	60.450	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.497	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	72.497	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000003313	papolg	66	67.515	ENSFHEG00000019080	papolg	90	68.307	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000003313	papolg	88	86.847	ENSGMOG00000018772	papolg	93	86.847	Gadus_morhua
ENSPKIG00000003313	papolg	100	65.164	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	65.164	Gallus_gallus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.788	ENSGAFG00000003263	papolg	98	74.574	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.564	ENSGACG00000002718	papolg	100	76.253	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.274	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	74.274	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.393	ENSHBUG00000004882	papolg	98	75.526	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000003313	papolg	99	72.616	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	99	72.616	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.642	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	72.642	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.741	ENSHCOG00000006782	papolg	99	76.312	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.483	ENSIPUG00000021642	papolg	100	77.718	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.414	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	72.414	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000003313	papolg	60	85.383	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	85.383	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.366	ENSKMAG00000016439	papolg	98	75.366	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.959	ENSLBEG00000023218	papolg	99	73.004	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000003313	papolg	99	66.401	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	66.401	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000003313	papolg	100	80.079	ENSLOCG00000016130	papolg	100	80.079	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.679	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.687	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.363	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	72.764	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.363	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	72.764	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000003313	papolg	100	65.915	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	66.313	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.997	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	74.412	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.067	ENSMAMG00000010667	papolg	98	77.868	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	77.119	ENSMZEG00005018140	papolg	99	77.419	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000003313	papolg	99	64.257	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	99	64.257	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000003313	papolg	99	72.200	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	72.200	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.553	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	74.553	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.133	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	72.133	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.303	ENSMMOG00000008020	papolg	99	77.600	Mola_mola
ENSPKIG00000003313	papolg	98	72.335	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	72.335	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.036	ENSMALG00000007012	papolg	98	77.097	Monopterus_albus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.933	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	85.781	Mus_caroli
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.067	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	85.781	Mus_musculus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.667	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	72.703	Mus_pahari
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.800	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	85.781	Mus_spretus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.016	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	72.414	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000003313	papolg	99	72.446	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	99	72.446	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.267	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	72.267	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000003313	papolg	100	66.976	ENSNBRG00000011943	papolg	99	66.711	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000003313	papolg	60	84.919	ENSNLEG00000009507	-	100	84.919	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000003313	papolg	66	68.919	ENSMEUG00000013605	-	68	68.919	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000003313	papolg	100	71.751	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	71.751	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000003313	papolg	59	82.742	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	82.742	Octodon_degus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	70.121	ENSONIG00000002985	papolg	100	69.960	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	71.825	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	71.825	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.149	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	72.149	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.816	ENSORLG00000001577	papolg	99	75.332	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.879	ENSORLG00020002482	papolg	99	75.265	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.553	ENSORLG00015008836	papolg	99	75.066	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.735	ENSOMEG00000001406	papolg	99	75.564	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000003313	papolg	56	65.700	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	65.700	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.244	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	72.244	Ovis_aries
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.412	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	74.412	Pan_paniscus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.473	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	72.473	Panthera_pardus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.340	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	72.340	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.412	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	74.412	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000003313	papolg	100	69.108	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	69.507	Papio_anubis
ENSPKIG00000003313	papolg	99	69.076	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	69.076	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000003313	papolg	99	72.297	ENSPEMG00000008960	-	100	72.297	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000003313	papolg	69	63.380	ENSPMAG00000004864	-	98	63.380	Petromyzon_marinus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	54.172	ENSPMAG00000002961	papolg	99	54.667	Petromyzon_marinus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.487	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	72.487	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.526	ENSPFOG00000012909	papolg	99	74.244	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.657	ENSPLAG00000018445	papolg	98	74.574	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.560	ENSPMEG00000003961	papolg	98	74.084	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.585	ENSPREG00000010358	papolg	98	73.760	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.096	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	72.096	Pongo_abelii
ENSPKIG00000003313	papolg	99	65.906	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	65.906	Procavia_capensis
ENSPKIG00000003313	papolg	100	67.497	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	67.497	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000003313	papolg	88	80.287	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	88	80.287	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.311	ENSPNYG00000006729	papolg	99	77.311	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000003313	papolg	100	78.457	ENSPNAG00000015521	papolg	100	78.457	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.667	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	72.667	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	68.048	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	68.048	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.238	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	74.238	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.859	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	74.274	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000003313	papolg	94	72.269	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	72.269	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000003313	papolg	100	75.995	ENSSFOG00015002383	papolg	100	75.995	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	69.553	ENSSFOG00015011874	papolg	100	69.553	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000003313	papolg	97	88.043	ENSSMAG00000015598	papolg	99	72.785	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	79.050	ENSSDUG00000000912	papolg	98	79.637	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000003313	papolg	100	77.554	ENSSLDG00000001217	papolg	98	78.121	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000003313	papolg	99	71.585	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	71.585	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	76.190	ENSSPAG00000009004	papolg	99	76.190	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.988	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	72.988	Sus_scrofa
ENSPKIG00000003313	papolg	74	71.537	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	97	71.537	Taeniopygia_guttata
ENSPKIG00000003313	papolg	100	74.795	ENSTRUG00000006410	papolg	99	74.795	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000003313	papolg	100	70.696	ENSTNIG00000017106	papolg	100	70.696	Tetraodon_nigroviridis
ENSPKIG00000003313	papolg	99	66.033	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	66.033	Tupaia_belangeri
ENSPKIG00000003313	papolg	100	68.302	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	68.700	Tursiops_truncatus
ENSPKIG00000003313	papolg	100	73.489	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	73.901	Ursus_americanus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	71.909	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	72.312	Ursus_maritimus
ENSPKIG00000003313	papolg	99	69.220	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	69.624	Vicugna_pacos
ENSPKIG00000003313	papolg	100	71.973	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	72.090	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000003313	papolg	99	69.241	ENSXETG00000002208	papolg	99	69.241	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000003313	papolg	71	89.087	ENSXCOG00000006611	papolg	74	89.087	Xiphophorus_couchianus
ENSPKIG00000003313	papolg	77	86.733	ENSXMAG00000007383	papolg	96	86.733	Xiphophorus_maculatus