EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000003545 (Gene tree)
Gene ID: 111859037
Gene Symbol: xpo1b
Alias: -
Full Name: exportin 1 (CRM1 homolog%2C yeast) b
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 19230 bases
Position: chrPGUA01000012.1:3882859-3902088
Accession: ZDB-GENE-070530-6
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000017805	CRM1_C	PF08767.11	4.4e-134	1	1
ENSPKIP00000017849	CRM1_C	PF08767.11	5.2e-134	1	1
ENSPKIP00000017805	Xpo1	PF08389.12	1.7e-41	1	1
ENSPKIP00000017849	Xpo1	PF08389.12	1.9e-41	1	1
ENSPKIP00000017805	IBN_N	PF03810.19	1.3e-11	1	1
ENSPKIP00000017849	IBN_N	PF03810.19	1.6e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000042324	-	8315	-	ENSPKIP00000017805	1027 (aa)	-	-
ENSPKIT00000042368	-	7920	-	ENSPKIP00000017849	1122 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
pki03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.981	ENSPKIG00000005688	XPO1	100	96.452

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSG00000082898	XPO1	100	98.387	Homo_sapiens
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.442	ENSAPOG00000004984	-	100	98.226	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	91.915	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	91.915	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.276	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	97.295	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	98.191	ENSACIG00000010818	-	100	98.191	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	93.936	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	93.936	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.866	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	93.464	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.345	ENSAOCG00000010121	-	100	98.133	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000003545	xpo1b	95	94.027	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	94.027	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.345	ENSAPEG00000007038	-	100	98.133	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.866	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	93.277	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.345	ENSATEG00000008816	-	100	98.133	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.566	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	97.479	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSACAG00000002501	XPO1	100	97.292	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSANAG00000020802	XPO1	100	96.545	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	94.043	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	94.043	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.150	ENSACLG00000015192	-	100	97.852	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	99.026	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	98.786	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	95.657	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	95.657	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	97.386	Bos_taurus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	99	53.032	WBGene00002078	xpo-1	99	51.941	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	96.545	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	97.386	Canis_familiaris
ENSPKIG00000003545	xpo1b	97	97.189	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	97.189	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	97.386	Capra_hircus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	97.386	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000003545	xpo1b	55	92.553	ENSCAPG00000006454	-	100	92.553	Cavia_aperea
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	95.910	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	95.892	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	77.079	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	78.108	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	94.660	ENSCATG00000032674	XPO1	100	96.596	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.079	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	97.106	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	96.545	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	82	98.212	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	98.184	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.468	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	97.386	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	82.588	ENSCING00000024562	-	100	81.471	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	80.558	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.299	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	92.113	ENSCANG00000028883	XPO1	100	96.099	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.203	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	96.265	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.203	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	96.265	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	97.447	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	97.447	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.184	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	92.624	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.150	ENSCVAG00000016788	-	100	97.852	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	95.521	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	96.904	Danio_rerio
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	99.221	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	99.066	Danio_rerio
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.468	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	97.479	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	91	94.111	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	94.289	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	71.304	FBgn0020497	emb	99	70.853	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000003545	xpo1b	94	96.787	ENSETEG00000018045	XPO1	94	96.863	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000003545	xpo1b	94	79.564	ENSEBUG00000012580	-	100	88.402	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSEASG00005007223	XPO1	100	97.386	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSECAG00000024920	XPO1	100	97.386	Equus_caballus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	91	95.289	ENSELUG00000014306	-	99	95.289	Esox_lucius
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	97.021	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	97.021	Esox_lucius
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	97.386	Felis_catus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSFALG00000010989	XPO1	100	97.292	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	95.618	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	95.518	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.574	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	92.997	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	92.308	ENSGMOG00000019063	-	100	92.344	Gadus_morhua
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	94.839	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	94.398	Gadus_morhua
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.566	ENSGALG00000029476	XPO1	100	97.479	Gallus_gallus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	95	97.837	ENSGAFG00000003355	-	98	97.837	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	94.149	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	94.149	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.053	ENSGACG00000002743	-	100	97.852	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.671	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	93.277	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	97.292	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	96.545	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.671	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	93.277	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.247	ENSHBUG00000020037	-	100	97.946	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.981	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	97.012	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.981	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	97.012	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	97.234	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	97.234	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.008	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	95.425	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	99.026	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	98.786	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.176	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	97.199	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.274	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	97.292	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.566	ENSKMAG00000016218	-	100	97.199	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.574	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	92.810	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	91.843	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	91.843	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.247	ENSLBEG00000005740	-	100	98.039	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	75.650	ENSLACG00000018213	XPO1	100	76.547	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	99.318	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	99.069	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.981	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	97.012	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	96.545	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	96.545	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	96.545	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	94.665	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	94.791	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.345	ENSMAMG00000010568	-	100	98.133	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.768	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	93.371	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	93.671	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	93.277	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	98.150	ENSMZEG00005018158	-	98	97.940	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000003545	xpo1b	71	97.383	ENSMGAG00000001496	-	100	97.383	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.203	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	96.265	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.371	ENSMICG00000027770	XPO1	100	97.386	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	96.545	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	94.362	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	94.362	Mola_mola
ENSPKIG00000003545	xpo1b	91	97.972	ENSMMOG00000008001	-	99	97.972	Mola_mola
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.397	ENSMODG00000002831	XPO1	100	96.359	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	97.858	ENSMALG00000007085	-	100	97.666	Monopterus_albus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	92	93.305	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	93.305	Monopterus_albus
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.592	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	96.639	Mus_caroli
ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.495	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	96.545	Mus_musculus
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