EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000003562 (Gene tree)
Gene ID: 111853065
Gene Symbol: polr1e
Alias: -
Full Name: RNA polymerase I subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 4559 bases
Position: chrPGUA01000026.1:3240026-3244584
Accession: 111853065
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000017782	RNA_pol_I_A49	PF06870.12	1.1e-103	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000042301	-	1338	-	ENSPKIP00000017782	420 (aa)	XP_023685351	UPI000CD6376F

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000003562's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03020	RNA polymerase	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000003562's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSG00000137054	POLR1E	98	45.694	Homo_sapiens
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	54.415	ENSAPOG00000012452	polr1e	99	54.415	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	42.516	ENSAMEG00000010193	POLR1E	95	42.516	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	51.781	ENSACIG00000009884	polr1e	99	55.980	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.907	ENSAOCG00000005665	polr1e	99	58.907	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	59.145	ENSAPEG00000020581	polr1e	99	59.145	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	59.524	ENSATEG00000020609	polr1e	99	59.524	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000003562	polr1e	80	39.119	ENSAPLG00000010340	POLR1E	99	39.119	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.172	ENSANAG00000038046	POLR1E	98	46.172	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	ENSACLG00000013685	polr1e	99	58.195	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	53.810	ENSAMXG00000018181	polr1e	99	53.810	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	48.804	ENSBTAG00000012243	POLR1E	98	48.804	Bos_taurus
ENSPKIG00000003562	polr1e	96	44.282	ENSCJAG00000010512	POLR1E	92	45.553	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	48.086	ENSCAFG00000002377	POLR1E	98	47.847	Canis_familiaris
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	48.086	ENSCAFG00020017851	POLR1E	98	48.086	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	48.804	ENSCHIG00000019479	POLR1E	98	48.804	Capra_hircus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.172	ENSTSYG00000002075	POLR1E	98	45.933	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000003562	polr1e	69	46.207	ENSCAPG00000015653	POLR1E	99	46.207	Cavia_aperea
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.698	ENSCPOG00000009965	POLR1E	100	46.698	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	42.344	ENSCCAG00000029460	POLR1E	98	42.344	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSCATG00000031732	POLR1E	98	45.694	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000003562	polr1e	87	47.123	ENSCLAG00000012701	POLR1E	95	47.123	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSCSAG00000010782	POLR1E	95	47.250	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000003562	polr1e	96	38.861	ENSCHOG00000013024	POLR1E	84	38.861	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	47.143	ENSCPBG00000006923	POLR1E	99	47.143	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.694	ENSCANG00000036112	POLR1E	98	45.455	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.324	ENSCGRG00001006197	Polr1e	95	45.324	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.084	ENSCGRG00000006430	Polr1e	95	45.084	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	52.506	ENSCSEG00000005121	polr1e	99	52.506	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.995	ENSCVAG00000019759	polr1e	99	57.995	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	97	53.676	ENSDARG00000006434	polr1e	99	53.222	Danio_rerio
ENSPKIG00000003562	polr1e	100	39.958	ENSDNOG00000010257	POLR1E	99	39.958	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000003562	polr1e	86	45.304	ENSETEG00000018204	POLR1E	100	45.304	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.694	ENSEASG00005000675	POLR1E	98	45.694	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSECAG00000014669	POLR1E	98	45.933	Equus_caballus
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	42.145	ENSEEUG00000011928	POLR1E	85	42.145	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.920	ENSELUG00000008150	polr1e	99	57.920	Esox_lucius
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	47.017	ENSFCAG00000013081	POLR1E	99	47.017	Felis_catus
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	45.771	ENSFALG00000012950	POLR1E	99	45.771	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.523	ENSFDAG00000016917	POLR1E	98	46.283	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	ENSFHEG00000009801	polr1e	99	58.195	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000003562	polr1e	97	47.677	ENSGMOG00000003336	POLR1E	96	47.677	Gadus_morhua
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.445	ENSGALG00000005395	POLR1E	99	46.209	Gallus_gallus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.629	ENSGAFG00000004850	polr1e	99	58.629	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	52.257	ENSGACG00000016087	polr1e	99	52.257	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	41.397	ENSGAGG00000001659	POLR1E	99	40.855	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000003562	polr1e	100	45.843	ENSGGOG00000001882	POLR1E	99	45.606	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	ENSHBUG00000002559	polr1e	99	58.195	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.763	ENSHGLG00000002036	POLR1E	98	46.763	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	47.002	ENSHGLG00100012784	POLR1E	98	47.002	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.007	ENSHCOG00000002774	polr1e	99	57.007	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	51.905	ENSIPUG00000003019	polr1e	99	51.905	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	100	44.893	ENSSTOG00000009810	POLR1E	99	44.893	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.265	ENSJJAG00000020731	Polr1e	94	46.265	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	59.382	ENSKMAG00000000046	polr1e	99	59.382	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	60.047	ENSLBEG00000003104	polr1e	99	60.047	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000003562	polr1e	85	51.913	ENSLACG00000003416	POLR1E	99	51.913	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000003562	polr1e	100	56.161	ENSLOCG00000012859	polr1e	99	56.161	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.539	ENSLAFG00000012831	POLR1E	98	46.301	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.694	ENSMFAG00000045465	POLR1E	98	43.709	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSMMUG00000017892	POLR1E	98	45.694	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	42.757	ENSMNEG00000040283	POLR1E	98	42.757	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSMLEG00000031135	POLR1E	98	45.694	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.095	ENSMAMG00000001260	polr1e	99	58.095	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.720	ENSMZEG00005021536	polr1e	99	57.720	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.215	ENSMAUG00000021044	Polr1e	95	45.215	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.651	ENSMICG00000003673	POLR1E	98	46.411	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000003562	polr1e	98	45.169	ENSMOCG00000012920	Polr1e	94	45.169	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.346	ENSMMOG00000007391	polr1e	99	57.346	Mola_mola
ENSPKIG00000003562	polr1e	96	44.335	ENSMODG00000002884	POLR1E	98	44.335	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.857	ENSMALG00000002665	polr1e	99	57.857	Monopterus_albus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.324	MGP_CAROLIEiJ_G0025967	Polr1e	97	46.231	Mus_caroli
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	44.844	ENSMUSG00000028318	Polr1e	97	45.729	Mus_musculus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.283	MGP_PahariEiJ_G0024114	Polr1e	97	46.985	Mus_pahari
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.084	MGP_SPRETEiJ_G0026930	Polr1e	97	45.980	Mus_spretus
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	43.111	ENSMPUG00000006040	POLR1E	95	43.111	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	47.608	ENSMLUG00000012688	POLR1E	95	47.608	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	48.558	ENSNGAG00000002520	Polr1e	94	48.558	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.957	ENSNBRG00000016822	polr1e	99	57.957	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.172	ENSNLEG00000003616	POLR1E	98	45.933	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000003562	polr1e	73	51.111	ENSMEUG00000015372	-	80	51.111	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000003562	polr1e	86	42.659	ENSOPRG00000014206	POLR1E	99	42.659	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000003562	polr1e	98	47.826	ENSODEG00000014565	POLR1E	95	47.826	Octodon_degus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.432	ENSONIG00000008921	polr1e	99	58.432	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.651	ENSOCUG00000024773	POLR1E	98	46.651	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.518	ENSORLG00000005143	polr1e	99	57.518	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000003562	polr1e	94	55.330	ENSORLG00020007271	polr1e	99	56.848	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.279	ENSORLG00015000137	polr1e	99	57.279	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.143	ENSOMEG00000013264	polr1e	98	57.143	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.694	ENSOGAG00000012981	POLR1E	96	45.694	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	48.565	ENSOARG00000011465	POLR1E	95	48.565	Ovis_aries
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSPPAG00000034566	POLR1E	98	45.694	Pan_paniscus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.539	ENSPPRG00000005649	POLR1E	99	46.539	Panthera_pardus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	46.778	ENSPTIG00000009774	POLR1E	99	46.778	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSPTRG00000020944	POLR1E	98	45.694	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSPANG00000025563	POLR1E	98	45.694	Papio_anubis
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	48.995	ENSPSIG00000003274	POLR1E	92	49.497	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	52.632	ENSPMGG00000024169	polr1e	96	52.632	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	36.930	ENSPEMG00000022300	-	94	37.410	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.694	ENSPEMG00000019151	-	95	45.694	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000003562	polr1e	98	45.169	ENSPCIG00000014798	POLR1E	99	45.169	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	55.756	ENSPFOG00000019627	polr1e	99	55.756	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.531	ENSPLAG00000022679	polr1e	99	58.531	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000003562	polr1e	86	60.331	ENSPMEG00000022123	polr1e	93	60.331	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.583	ENSPREG00000009470	polr1e	99	57.583	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.694	ENSPPYG00000019061	POLR1E	98	45.455	Pongo_abelii
ENSPKIG00000003562	polr1e	57	41.423	ENSPCAG00000004891	POLR1E	77	41.423	Procavia_capensis
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.694	ENSPCOG00000027448	POLR1E	98	45.455	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	47.118	ENSPVAG00000007940	POLR1E	83	47.118	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.957	ENSPNYG00000001032	polr1e	99	57.957	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	54.676	ENSPNAG00000006987	polr1e	99	54.676	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.215	ENSRNOG00000012664	Polr1e	95	45.215	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	46.617	ENSRBIG00000034214	POLR1E	99	46.859	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	45.933	ENSRROG00000031986	POLR1E	98	45.694	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000003562	polr1e	96	45.926	ENSSBOG00000021415	POLR1E	98	45.301	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000003562	polr1e	86	43.526	ENSSHAG00000016084	POLR1E	99	43.646	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	66.667	ENSSFOG00015002293	polr1e	99	66.667	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	59.857	ENSSMAG00000011672	polr1e	93	59.857	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	ENSSDUG00000022279	polr1e	99	58.195	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	ENSSLDG00000024918	polr1e	99	58.195	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000003562	polr1e	55	42.241	ENSSARG00000009810	-	58	42.241	Sorex_araneus
ENSPKIG00000003562	polr1e	100	47.031	ENSSPUG00000009499	POLR1E	99	46.905	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	58.195	ENSSPAG00000021240	polr1e	99	58.195	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000003562	polr1e	98	47.942	ENSSSCG00000005347	POLR1E	97	47.942	Sus_scrofa
ENSPKIG00000003562	polr1e	94	39.150	ENSTGUG00000007169	POLR1E	99	39.150	Taeniopygia_guttata
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	54.610	ENSTRUG00000020779	polr1e	99	56.771	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	55.582	ENSTNIG00000017812	polr1e	99	55.582	Tetraodon_nigroviridis
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	46.867	ENSTBEG00000013786	POLR1E	84	46.867	Tupaia_belangeri
ENSPKIG00000003562	polr1e	96	46.929	ENSTTRG00000008294	POLR1E	86	46.929	Tursiops_truncatus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	47.608	ENSUAMG00000012474	POLR1E	98	48.066	Ursus_americanus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	47.608	ENSUMAG00000011496	POLR1E	98	47.608	Ursus_maritimus
ENSPKIG00000003562	polr1e	83	42.241	ENSVPAG00000009048	POLR1E	82	42.241	Vicugna_pacos
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	48.193	ENSVVUG00000019954	POLR1E	98	48.193	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000003562	polr1e	95	45.679	ENSXETG00000006533	polr1e	96	45.679	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	57.007	ENSXCOG00000013706	polr1e	99	57.007	Xiphophorus_couchianus
ENSPKIG00000003562	polr1e	99	60.095	ENSXMAG00000012484	polr1e	99	60.095	Xiphophorus_maculatus