EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000005220 (Gene tree)
Gene ID: 111832890
Gene Symbol: eefsec
Alias: -
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9779 bases
Position: chrPGUA01000429.1:10529-20307
Accession: 111832890
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000020463	GTP_EFTU	PF00009.27	7.9e-29	1	1
ENSPKIP00000020446	GTP_EFTU	PF00009.27	2.3e-28	1	1
ENSPKIP00000020463	MMR_HSR1	PF01926.23	8.6e-07	1	1
ENSPKIP00000020446	MMR_HSR1	PF01926.23	2.2e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000001063	-	2950	-	ENSPKIP00000020446	584 (aa)	XP_023646409	UPI000CD5E04C
ENSPKIT00000001080	-	1113	-	ENSPKIP00000020463	370 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000005220's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000005220's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSG00000132394	EEFSEC	99	62.131	Homo_sapiens
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.818	ENSAPOG00000015931	eefsec	98	76.215	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000005220	eefsec	73	65.919	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	87	65.695	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.663	ENSACIG00000022407	eefsec	99	84.861	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.439	ENSAOCG00000008603	eefsec	98	76.389	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSAPEG00000017090	eefsec	98	76.042	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSATEG00000002753	eefsec	99	76.471	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000005220	eefsec	73	66.591	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	99	65.548	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	66.431	ENSANAG00000032691	EEFSEC	99	62.664	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.818	ENSACLG00000024565	eefsec	98	85.259	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000005220	eefsec	99	79.615	ENSAMXG00000002260	eefsec	99	73.595	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	71.984	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	99	72.266	Bos_taurus
ENSPKIG00000005220	eefsec	78	44.681	WBGene00008133	efsc-1	91	33.270	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.430	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	99	62.171	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	64.667	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	81	63.192	Canis_familiaris
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	66.551	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	99	63.235	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	70.428	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	99	63.940	Capra_hircus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.765	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	99	62.643	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	57.624	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	56.863	Cavia_aperea
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	68.132	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	99	72.491	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.430	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	99	61.842	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSCATG00000019414	EEFSEC	99	62.131	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	68.132	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	99	72.491	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	63.667	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	99	61.803	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	68.493	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	88	65.599	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	65.789	ENSCSAVG00000002208	-	100	61.074	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSCANG00000031492	EEFSEC	99	62.131	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	69.963	ENSCGRG00001018089	Eefsec	99	63.773	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	68.864	ENSCGRG00000010063	Eefsec	99	73.606	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000005220	eefsec	99	80.882	ENSCSEG00000003008	eefsec	99	85.259	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.682	ENSCVAG00000005381	eefsec	98	76.125	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	82.677	ENSDARG00000004696	eefsec	99	73.276	Danio_rerio
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	66.308	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	99	62.562	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	52.096	ENSDORG00000000264	Eefsec	85	66.667	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	44.755	FBgn0034627	eEFSec	99	44.755	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000005220	eefsec	99	57.214	ENSETEG00000007406	EEFSEC	99	57.048	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	66.667	ENSEBUG00000015029	eefsec	93	53.308	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	65.320	ENSEASG00005006786	EEFSEC	99	63.427	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	65.320	ENSECAG00000016565	EEFSEC	99	63.427	Equus_caballus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	76.724	ENSELUG00000016632	eefsec	98	76.471	Esox_lucius
ENSPKIG00000005220	eefsec	99	63.770	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	99	63.770	Felis_catus
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	65.863	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	64.950	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	61.829	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	98	72.667	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.682	ENSFHEG00000007155	eefsec	98	75.260	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	76.991	ENSGMOG00000007705	eefsec	99	73.494	Gadus_morhua
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	67.528	ENSGALG00000038684	EEFSEC	99	65.268	Gallus_gallus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSGAFG00000021692	eefsec	99	77.163	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSGACG00000000793	eefsec	99	77.547	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	99	64.755	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	98	65.430	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000005220	eefsec	86	63.740	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	98	63.168	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.818	ENSHBUG00000008917	eefsec	97	77.969	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	68.132	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	99	71.333	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	68.132	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	95	63.193	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.439	ENSHCOG00000004193	eefsec	99	75.690	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	78.030	ENSIPUG00000017291	eefsec	97	73.888	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	61.600	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	98	72.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	73	73.606	ENSJJAG00000020703	-	99	73.606	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.682	ENSKMAG00000019907	eefsec	98	75.779	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	82.576	ENSLBEG00000017908	eefsec	98	76.990	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000005220	eefsec	85	69.625	ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.945	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000005220	eefsec	100	76.868	ENSLOCG00000014535	eefsec	100	75.127	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	99	61.706	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	99	61.360	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	99	62.295	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000005220	eefsec	81	61.167	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	99	60.765	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	99	62.459	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000005220	eefsec	83	61.614	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	93	61.024	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	83.056	ENSMAMG00000023964	eefsec	99	84.462	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.110	ENSMZEG00005009380	eefsec	98	85.259	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000005220	eefsec	66	63.250	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	62.162	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000005220	eefsec	90	66.788	ENSMAUG00000011197	Eefsec	99	74.349	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	69.963	ENSMOCG00000017748	Eefsec	99	74.721	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	79.778	ENSMMOG00000021820	eefsec	98	84.861	Mola_mola
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	77.358	ENSMODG00000008034	EEFSEC	81	66.606	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	78.832	ENSMALG00000016211	eefsec	98	79.110	Monopterus_albus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	69.963	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	99	74.721	Mus_caroli
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	69.963	ENSMUSG00000033216	Eefsec	99	74.721	Mus_musculus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	69.963	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	99	74.721	Mus_pahari
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	69.963	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	99	74.721	Mus_spretus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	65.436	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	95	63.756	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000005220	eefsec	83	61.736	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	99	61.538	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000005220	eefsec	73	74.721	ENSNGAG00000023278	-	99	74.721	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.818	ENSNBRG00000002387	eefsec	98	85.259	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	99	61.967	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	64.718	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	99	63.600	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	65.517	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	99	63.667	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	68.498	ENSODEG00000002928	EEFSEC	99	72.862	Octodon_degus
ENSPKIG00000005220	eefsec	81	72.443	ENSONIG00000019038	eefsec	100	72.651	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000005220	eefsec	81	63.415	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	62.374	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	65.646	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	99	63.245	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.303	ENSORLG00000001377	eefsec	98	83.665	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.303	ENSORLG00020000729	eefsec	98	83.665	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	80.303	ENSORLG00015001986	eefsec	98	76.215	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000005220	eefsec	83	74.021	ENSOMEG00000010071	eefsec	88	74.433	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000005220	eefsec	74	66.079	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	98	65.859	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000005220	eefsec	64	64.948	ENSOARG00000004600	EEFSEC	100	64.691	Ovis_aries
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	99	62.131	Pan_paniscus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	65.772	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	99	64.145	Panthera_pardus
ENSPKIG00000005220	eefsec	85	61.996	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	92	62.188	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	99	62.131	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSPANG00000017041	EEFSEC	99	62.459	Papio_anubis
ENSPKIG00000005220	eefsec	81	81.132	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	97	67.736	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSPMGG00000020300	eefsec	99	74.913	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	69.597	ENSPEMG00000013677	Eefsec	99	74.349	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000005220	eefsec	82	75.926	ENSPMAG00000006779	eefsec	98	67.669	Petromyzon_marinus
ENSPKIG00000005220	eefsec	81	62.753	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	99	62.048	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSPFOG00000003748	eefsec	98	76.776	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSPLAG00000018012	eefsec	99	76.776	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSPMEG00000001202	eefsec	99	76.776	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSPREG00000012235	eefsec	99	76.817	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000005220	eefsec	99	62.787	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	99	61.967	Pongo_abelii
ENSPKIG00000005220	eefsec	89	58.519	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	99	58.333	Procavia_capensis
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	72.093	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	99	61.589	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	70.498	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	65	70.498	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.818	ENSPNYG00000005726	eefsec	98	85.259	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	79.924	ENSPNAG00000016724	eefsec	99	72.931	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	69.963	ENSRNOG00000012954	Eefsec	99	74.206	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	64.000	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	99	62.295	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000005220	eefsec	68	72.619	ENSRROG00000030260	-	85	71.042	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000005220	eefsec	81	60.563	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	99	60.563	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000005220	eefsec	81	64.575	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	99	62.500	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000005220	eefsec	100	84.411	ENSSFOG00015021109	eefsec	100	79.132	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	79.545	ENSSMAG00000001454	eefsec	99	75.433	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000005220	eefsec	100	79.197	ENSSDUG00000007924	eefsec	99	84.774	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	79.197	ENSSLDG00000024985	eefsec	99	75.521	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000005220	eefsec	53	69.149	ENSSARG00000003789	-	56	70.213	Sorex_araneus
ENSPKIG00000005220	eefsec	81	64.155	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	63.951	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	82.197	ENSSPAG00000001320	eefsec	99	85.259	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	71.429	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	99	67.500	Sus_scrofa
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	71.542	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	99	65.000	Taeniopygia_guttata
ENSPKIG00000005220	eefsec	99	79.927	ENSTRUG00000010327	eefsec	99	75.214	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	84.462	ENSTNIG00000003225	eefsec	99	76.603	Tetraodon_nigroviridis
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	70.000	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	99	62.895	Tursiops_truncatus
ENSPKIG00000005220	eefsec	98	65.772	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	99	63.816	Ursus_americanus
ENSPKIG00000005220	eefsec	73	65.772	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	91	65.044	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000005220	eefsec	80	69.038	ENSXETG00000002066	eefsec	99	68.828	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSXCOG00000019916	eefsec	99	75.868	Xiphophorus_couchianus
ENSPKIG00000005220	eefsec	97	81.061	ENSXMAG00000001839	eefsec	99	76.083	Xiphophorus_maculatus