EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000005688 (Gene tree)
Gene ID: 111850785
Gene Symbol: XPO1
Alias: -
Full Name: exportin-1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17645 bases
Position: chrPGUA01000022.1:1365073-1382717
Accession: 111850785
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000021212	CRM1_C	PF08767.11	3.1e-131	1	1
ENSPKIP00000021212	Xpo1	PF08389.12	1.5e-41	1	1
ENSPKIP00000021212	IBN_N	PF03810.19	1.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000001841	XPO1-201	5114	-	ENSPKIP00000021212	1071 (aa)	XP_023680807	UPI000CD6099A

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03008	Ribosome biogenesis in eukaryotes	KEGG
pki03013	RNA transport	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	96.452	ENSPKIG00000003545	xpo1b	100	96.981

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSG00000082898	XPO1	100	93.931	Homo_sapiens
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.798	ENSAPOG00000004984	-	100	95.798	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	90.638	ENSAPOG00000002354	xpo1a	100	90.638	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.776	ENSAMEG00000003460	XPO1	100	94.776	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	96.277	ENSACIG00000010818	-	100	96.277	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	92.660	ENSACIG00000010259	xpo1a	100	92.660	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.530	ENSAOCG00000018914	xpo1a	100	92.530	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.705	ENSAOCG00000010121	-	100	95.705	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000005688	XPO1	91	92.791	ENSAPEG00000006583	xpo1a	99	92.791	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.705	ENSAPEG00000007038	-	100	95.705	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.250	ENSATEG00000020750	xpo1a	100	92.250	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.705	ENSATEG00000008816	-	100	95.705	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.958	ENSAPLG00000004008	XPO1	100	94.958	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.771	ENSACAG00000002501	XPO1	100	94.771	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSANAG00000020802	XPO1	100	93.931	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.892	ENSACLG00000015192	-	100	95.892	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	92.979	ENSACLG00000015669	xpo1a	100	92.979	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	96.452	ENSAMXG00000012704	xpo1b	100	96.452	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	94.068	ENSAMXG00000003069	xpo1a	100	94.068	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSBTAG00000013254	XPO1	100	94.865	Bos_taurus
ENSPKIG00000005688	XPO1	99	52.311	WBGene00002078	xpo-1	99	52.311	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSCJAG00000008877	XPO1	100	93.931	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSCAFG00000003050	XPO1	100	94.865	Canis_familiaris
ENSPKIG00000005688	XPO1	93	95.080	ENSCAFG00020026910	XPO1	99	95.080	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSCHIG00000018132	XPO1	100	94.865	Capra_hircus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSTSYG00000004330	XPO1	100	94.865	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000005688	XPO1	53	90.426	ENSCAPG00000006454	-	100	90.426	Cavia_aperea
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.371	ENSCPOG00000034053	XPO1	100	93.371	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	75.696	ENSCCAG00000037445	XPO1	100	76.438	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.086	ENSCATG00000032674	XPO1	100	94.574	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.585	ENSCLAG00000012953	XPO1	100	94.585	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSCSAG00000014606	XPO1	100	93.931	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000005688	XPO1	83	96.109	ENSCHOG00000012088	XPO1	83	96.109	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSCPBG00000026239	XPO1	100	94.865	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000005688	XPO1	99	81.157	ENSCING00000024562	-	99	81.157	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000005688	XPO1	99	80.280	ENSCSAVG00000005965	-	99	80.280	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	89.916	ENSCANG00000028883	XPO1	100	93.972	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSCGRG00001000263	Xpo1	100	93.931	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSCGRG00000001520	Xpo1	100	93.931	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	95.213	ENSCSEG00000001693	XPO1	100	95.213	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	91.503	ENSCVAG00000016558	xpo1a	100	91.503	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.518	ENSCVAG00000016788	-	100	95.518	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.371	ENSDARG00000078041	xpo1a	100	95.511	Danio_rerio
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	96.359	ENSDARG00000063229	xpo1b	100	96.359	Danio_rerio
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.771	ENSDNOG00000005805	XPO1	100	94.771	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000005688	XPO1	93	92.161	ENSDORG00000013050	Xpo1	100	92.161	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000005688	XPO1	99	70.759	FBgn0020497	emb	99	70.759	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000005688	XPO1	94	94.096	ENSETEG00000018045	XPO1	94	94.096	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000005688	XPO1	90	79.046	ENSEBUG00000012580	-	100	87.758	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSEASG00005007223	XPO1	100	94.865	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSECAG00000024920	XPO1	100	94.865	Equus_caballus
ENSPKIG00000005688	XPO1	92	93.750	ENSEEUG00000009479	XPO1	92	93.750	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	95.319	ENSELUG00000012707	xpo1a	100	95.319	Esox_lucius
ENSPKIG00000005688	XPO1	87	93.041	ENSELUG00000014306	-	99	93.041	Esox_lucius
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSFCAG00000002702	XPO1	100	94.865	Felis_catus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.771	ENSFALG00000010989	XPO1	100	94.771	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.184	ENSFDAG00000014716	XPO1	100	93.184	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000005688	XPO1	53	81.206	ENSFHEG00000018974	-	100	81.206	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	91.970	ENSFHEG00000002412	xpo1a	100	91.970	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	89.823	ENSGMOG00000019063	-	100	89.823	Gadus_morhua
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.277	ENSGMOG00000004441	xpo1a	100	93.277	Gadus_morhua
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.958	ENSGALG00000029476	XPO1	100	94.958	Gallus_gallus
ENSPKIG00000005688	XPO1	91	95.675	ENSGAFG00000003355	-	98	95.675	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	92.766	ENSGAFG00000004408	xpo1a	100	92.766	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.437	ENSGACG00000019736	xpo1a	100	92.437	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.705	ENSGACG00000002743	-	100	95.705	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSGAGG00000017558	XPO1	100	94.865	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSGGOG00000034878	XPO1	100	93.931	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.798	ENSHBUG00000020037	-	100	95.798	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.530	ENSHBUG00000007128	xpo1a	100	92.530	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.491	ENSHGLG00000003115	XPO1	100	94.491	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.491	ENSHGLG00100012227	XPO1	100	94.491	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	95.319	ENSHCOG00000006949	XPO1	100	95.319	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	96.452	ENSIPUG00000012891	Xpo1	100	96.452	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.211	ENSIPUG00000024394	XPO1	100	94.211	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.678	ENSSTOG00000016122	XPO1	100	94.678	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.771	ENSJJAG00000020468	Xpo1	100	94.771	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	91.970	ENSKMAG00000004830	xpo1a	100	91.970	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.612	ENSKMAG00000016218	-	100	95.612	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.612	ENSLBEG00000005740	-	100	95.612	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	90.572	ENSLBEG00000002104	xpo1a	100	90.572	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	73.869	ENSLACG00000018213	XPO1	100	73.869	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	96.359	ENSLOCG00000016095	xpo1b	99	96.359	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.491	ENSLAFG00000014553	XPO1	100	94.491	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSMFAG00000038679	XPO1	100	93.931	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSMMUG00000006941	XPO1	100	93.931	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSMNEG00000030909	XPO1	100	93.931	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.093	ENSMLEG00000032004	XPO1	100	92.093	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.612	ENSMAMG00000010568	-	100	95.612	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.530	ENSMAMG00000023037	xpo1a	100	92.530	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.892	ENSMZEG00005018158	-	98	95.984	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	92.530	ENSMZEG00005005105	xpo1a	100	92.530	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000005688	XPO1	68	95.041	ENSMGAG00000001496	-	100	95.041	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	ENSMAUG00000006769	Xpo1	100	93.931	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSMICG00000027770	XPO1	100	94.865	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.211	ENSMOCG00000012169	Xpo1	100	94.211	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000005688	XPO1	87	95.945	ENSMMOG00000008001	-	99	95.945	Mola_mola
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	93.298	ENSMMOG00000018767	xpo1a	100	93.298	Mola_mola
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.744	ENSMODG00000002831	XPO1	100	93.744	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000005688	XPO1	88	92.242	ENSMALG00000008617	xpo1a	100	92.242	Monopterus_albus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	95.331	ENSMALG00000007085	-	100	95.331	Monopterus_albus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.118	MGP_CAROLIEiJ_G0016136	Xpo1	100	94.118	Mus_caroli
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.024	ENSMUSG00000020290	Xpo1	100	94.024	Mus_musculus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	93.931	MGP_PahariEiJ_G0016754	Xpo1	100	93.931	Mus_pahari
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.024	MGP_SPRETEiJ_G0016979	Xpo1	100	94.024	Mus_spretus
ENSPKIG00000005688	XPO1	100	94.865	ENSMPUG00000005560	XPO1	100	94.865	Mustela_putorius_furo
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