EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000006027 (Gene tree)
Gene ID: 111850827
Gene Symbol: PAPOLG (1 of many)
Alias: -
Full Name: poly(A) polymerase gamma-like
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10291 bases
Position: chrPGUA01000022.1:1480017-1490307
Accession: 111850827
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000021832	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.7e-28	1	2
ENSPKIP00000021832	PAP_RNA-bind	PF04926.15	1.7e-28	2	2
ENSPKIP00000021784	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.2e-28	1	2
ENSPKIP00000021784	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.2e-28	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000002476	PAPOLG (1 of many)-202	1911	-	ENSPKIP00000021832	636 (aa)	-	-
ENSPKIT00000002427	PAPOLG (1 of many)-201	2149	XM_023825127	ENSPKIP00000021784	695 (aa)	XP_023680895	UPI000CD614BD

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000006027's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000006027's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	76.286	ENSPKIG00000003313	papolg	97	76.034
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	77	73.642	ENSPKIG00000014471	papola	91	64.643

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.563	ENSG00000115421	PAPOLG	100	84.615	Homo_sapiens
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	77.299	ENSAPOG00000004798	papolg	99	77.299	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	69.727	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	93	70.301	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	75.758	ENSACIG00000010546	papolg	97	76.225	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	77.299	ENSAOCG00000010254	papolg	99	77.299	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	77.299	ENSAPEG00000006944	papolg	99	77.299	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	77.273	ENSATEG00000009007	papolg	97	77.273	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	66.957	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	92	66.957	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	74	61.682	ENSACAG00000015048	-	89	61.682	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.423	ENSANAG00000024627	PAPOLG	93	72.674	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.421	ENSACLG00000015592	papolg	99	75.316	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	77.122	ENSAMXG00000004611	papolg	92	77.122	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	72.093	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	91	72.093	Bos_taurus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.423	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	94	70.423	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	69.620	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	86	70.183	Canis_familiaris
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	100	69.402	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	98	70.308	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	71.802	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	91	71.802	Capra_hircus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.787	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	94	70.787	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	59	74.869	ENSCAPG00000014901	-	100	78.478	Cavia_aperea
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.297	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	95	70.297	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.480	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	93	72.741	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	89	79.399	ENSCATG00000044395	PAPOLG	94	79.399	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.506	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	95	70.506	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.423	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	94	70.423	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	86	68.982	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	93	68.982	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	75	63.244	ENSCING00000024664	-	92	64.300	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	75	63.244	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.155	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.282	ENSCANG00000038120	PAPOLG	93	72.526	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	70.301	ENSCGRG00001014951	Papolg	95	70.301	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	70.301	ENSCGRG00000005552	-	95	70.301	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	81	87.389	ENSCSEG00000000771	papolg	88	79.658	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	84.775	ENSCVAG00000016602	papolg	97	84.375	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	77.746	ENSDARG00000012141	papolg	92	77.746	Danio_rerio
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	69.534	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	91	69.534	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	66	81.280	ENSDORG00000016228	Papolg	100	83.991	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	57.971	ENSETEG00000011815	PAPOLG	92	58.261	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	71	53.728	ENSEBUG00000005042	-	82	54.583	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	61	74.052	ENSEBUG00000004020	papolg	89	71.391	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	71.698	ENSEASG00005002038	PAPOLG	91	72.279	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	71.698	ENSECAG00000009859	PAPOLG	90	72.182	Equus_caballus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	65.037	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	90	65.037	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	77.410	ENSELUG00000014497	papolg	83	77.746	Esox_lucius
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.113	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	93	70.113	Felis_catus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	91	62.879	ENSFALG00000011079	PAPOLG	85	62.879	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	71.971	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	89	71.971	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	62	70.000	ENSFHEG00000019080	papolg	80	70.444	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	80	86.691	ENSGMOG00000018772	papolg	83	86.691	Gadus_morhua
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	63.254	ENSGALG00000007853	PAPOLG	97	63.254	Gallus_gallus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	86.796	ENSGAFG00000003263	papolg	83	74.507	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	75.606	ENSGACG00000002718	papolg	92	76.513	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.423	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	93	72.674	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.421	ENSHBUG00000004882	papolg	99	75.676	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	95	72.247	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	92	72.247	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	72.344	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	92	72.344	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	78.752	ENSHCOG00000006782	papolg	81	78.752	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	76.956	ENSIPUG00000021642	papolg	93	77.201	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.084	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	94	69.944	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	66	81.517	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	84.223	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	76.580	ENSKMAG00000016439	papolg	95	76.580	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	73.793	ENSLBEG00000023218	papolg	95	74.621	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	67.137	ENSLACG00000009543	PAPOLG	94	67.137	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	78.230	ENSLOCG00000016130	papolg	93	78.230	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	71.739	ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	83.765	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.000	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	94	70.563	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.000	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	94	70.563	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	62.797	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	94	63.357	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	69.633	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	93	72.444	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	77.286	ENSMAMG00000010667	papolg	92	78.176	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.421	ENSMZEG00005018140	papolg	99	75.316	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	64.390	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	91	64.390	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	71.765	ENSMAUG00000009088	Papolg	91	71.765	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.423	ENSMICG00000010042	PAPOLG	95	71.799	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	72.093	ENSMOCG00000006857	Papolg	91	72.093	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	76.901	ENSMMOG00000008020	papolg	93	77.044	Mola_mola
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	69.857	ENSMODG00000002160	PAPOLG	93	69.857	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	78.248	ENSMALG00000007012	papolg	94	77.729	Monopterus_albus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	73.077	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	84.615	Mus_caroli
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	72.929	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	84.615	Mus_musculus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	73.077	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	90	73.273	Mus_pahari
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	72.781	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	84.615	Mus_spretus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	69.900	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	84	70.471	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	71.852	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	90	71.852	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	72.294	ENSNGAG00000001120	Papolg	92	72.294	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	67.626	ENSNBRG00000011943	papolg	92	67.385	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	66	81.043	ENSNLEG00000009507	-	100	83.759	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	68	67.385	ENSMEUG00000013605	-	68	67.385	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	69.676	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	93	69.676	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	66	78.199	ENSODEG00000012424	PAPOLG	99	81.176	Octodon_degus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.000	ENSONIG00000002985	papolg	92	70.000	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	70.170	ENSOANG00000012403	PAPOLG	93	70.170	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.323	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	94	70.323	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.176	ENSORLG00000001577	papolg	95	75.926	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.641	ENSORLG00020002482	papolg	95	76.034	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	74.894	ENSORLG00015008836	papolg	95	75.641	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.641	ENSOMEG00000001406	papolg	82	75.966	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	71.657	ENSOARG00000001563	PAPOLG	83	71.657	Ovis_aries
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.563	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	93	72.821	Pan_paniscus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.113	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	93	70.113	Panthera_pardus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	69.972	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	93	69.972	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.563	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	93	72.821	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	66.292	ENSPANG00000014543	PAPOLG	94	66.854	Papio_anubis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	70.623	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	90	70.623	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	72.593	ENSPEMG00000008960	-	91	72.593	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	77	61.723	ENSPMAG00000004864	-	98	63.984	Petromyzon_marinus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	92	54.810	ENSPMAG00000002961	papolg	90	55.638	Petromyzon_marinus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.270	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	96	70.270	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	74.823	ENSPFOG00000012909	papolg	95	75.284	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	87.324	ENSPLAG00000018445	papolg	95	74.786	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	87.324	ENSPMEG00000003961	papolg	96	75.176	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	74.579	ENSPREG00000010358	papolg	83	74.579	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.423	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	94	70.423	Pongo_abelii
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	95	63.450	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	91	63.450	Procavia_capensis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	67.953	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	95	67.953	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	79	80.686	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	75	80.686	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	77.645	ENSPNYG00000006729	papolg	99	75.316	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	78.429	ENSPNAG00000015521	papolg	93	78.429	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	72.929	ENSRNOG00000006261	Papolg	90	72.929	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	65.867	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	94	65.867	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.522	ENSRROG00000035954	PAPOLG	93	72.781	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	99	70.000	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	93	72.821	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	90	70.615	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	91	70.615	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	69.394	ENSSFOG00015011874	papolg	91	69.394	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	82.000	ENSSFOG00015002383	papolg	92	83.763	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	92	87.455	ENSSMAG00000015598	papolg	96	73.040	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	79.416	ENSSDUG00000000912	papolg	95	81.184	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	78.917	ENSSLDG00000001217	papolg	95	78.917	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	92	72.030	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	91	72.030	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	75.559	ENSSPAG00000009004	papolg	94	79.787	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	70.697	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	95	71.449	Sus_scrofa
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	77	72.267	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	99	71.165	Taeniopygia_guttata
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	73.707	ENSTRUG00000006410	papolg	91	73.707	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	72.595	ENSTNIG00000017106	papolg	91	72.595	Tetraodon_nigroviridis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	66.424	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	92	66.424	Tupaia_belangeri
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	67.054	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	91	67.634	Tursiops_truncatus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	70.130	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	95	71.179	Ursus_americanus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	70.130	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	84	70.707	Ursus_maritimus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	94	68.584	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	91	69.174	Vicugna_pacos
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	98	69.761	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	94	70.323	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	97	68.458	ENSXETG00000002208	papolg	93	68.458	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	90	79.376	ENSXCOG00000006611	papolg	86	77.647	Xiphophorus_couchianus
ENSPKIG00000006027	PAPOLG	93	74.333	ENSXMAG00000007383	papolg	83	87.400	Xiphophorus_maculatus