EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000008130 (Gene tree)
Gene ID: 111859623
Gene Symbol: syf2
Alias: -
Full Name: SYF2 pre-mRNA splicing factor
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 4574 bases
Position: chrPGUA01000385.1:85122-89695
Accession: 111859623
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000025151	SYF2	PF08231.12	1.7e-53	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000005875	-	2208	-	ENSPKIP00000025151	235 (aa)	XP_023698222	UPI000CD65486

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000008130's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000008130's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.259	ENSG00000117614	SYF2	95	80.258	Homo_sapiens
ENSPKIG00000008130	syf2	94	90.045	ENSAPOG00000001174	syf2	100	85.714	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000008130	syf2	93	83.028	ENSAMEG00000010115	-	90	83.028	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000008130	syf2	83	84.103	ENSAMEG00000010134	-	100	84.103	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000008130	syf2	94	87.330	ENSACIG00000023688	syf2	88	87.330	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	86.809	ENSAOCG00000022046	syf2	100	86.809	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000008130	syf2	93	85.068	ENSAOCG00000010912	syf2	69	85.068	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000008130	syf2	100	86.134	ENSAPEG00000018858	syf2	92	86.134	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000008130	syf2	92	89.862	ENSATEG00000007745	syf2	100	84.874	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000008130	syf2	85	84.500	ENSAPLG00000016435	SYF2	99	84.500	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000008130	syf2	71	71.257	ENSACAG00000026777	-	100	71.257	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000008130	syf2	87	83.824	ENSACAG00000013653	-	100	83.824	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.583	ENSANAG00000032473	SYF2	99	79.583	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.878	ENSACLG00000019916	syf2	100	82.773	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000008130	syf2	100	84.034	ENSAMXG00000004051	syf2	100	84.034	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.959	ENSBTAG00000001651	SYF2	100	77.959	Bos_taurus
ENSPKIG00000008130	syf2	89	51.185	WBGene00019402	syf-2	90	50.943	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000008130	syf2	92	85.185	ENSCJAG00000046570	SYF2	95	80.687	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000008130	syf2	92	77.778	ENSCAFG00000030331	-	92	77.778	Canis_familiaris
ENSPKIG00000008130	syf2	99	78.970	ENSCAFG00000012895	-	100	76.423	Canis_familiaris
ENSPKIG00000008130	syf2	77	75.275	ENSCAFG00020021094	-	95	75.275	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000008130	syf2	99	78.970	ENSCAFG00020021091	-	100	76.423	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.778	ENSCHIG00000020874	SYF2	100	77.778	Capra_hircus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.508	ENSTSYG00000005114	SYF2	100	79.508	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000008130	syf2	84	83.838	ENSCAPG00000010006	SYF2	100	83.838	Cavia_aperea
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.279	ENSCPOG00000005326	SYF2	100	78.279	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.583	ENSCCAG00000022459	SYF2	99	79.583	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSCATG00000026917	SYF2	95	79.828	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000008130	syf2	99	81.034	ENSCLAG00000008474	SYF2	94	81.034	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSCSAG00000000948	SYF2	95	79.828	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000008130	syf2	72	63.068	ENSCHOG00000005273	-	98	63.068	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.163	ENSCPBG00000025073	SYF2	100	78.226	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000008130	syf2	90	55.607	ENSCING00000003017	-	89	55.140	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000008130	syf2	90	49.065	ENSCSAVG00000006627	-	98	49.065	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000008130	syf2	99	69.957	ENSCANG00000037322	SYF2	94	69.957	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.926	ENSCGRG00001020733	Syf2	100	78.926	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000008130	syf2	83	84.694	ENSCGRG00000005095	Syf2	96	84.422	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000008130	syf2	93	83.562	ENSCSEG00000000117	syf2	92	83.258	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000008130	syf2	94	85.520	ENSCVAG00000019543	syf2	100	81.172	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	84.874	ENSDARG00000004706	syf2	100	84.874	Danio_rerio
ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.551	ENSDNOG00000047605	SYF2	100	77.551	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.689	ENSDORG00000001274	Syf2	100	78.689	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000008130	syf2	93	54.545	FBgn0033556	CG12343	97	54.545	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000008130	syf2	94	67.273	ENSETEG00000015729	SYF2	96	68.182	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000008130	syf2	84	60.914	ENSEBUG00000015402	syf2	95	60.914	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.367	ENSEASG00005004224	-	100	78.367	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	70.661	ENSEASG00005004232	-	100	70.661	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.776	ENSECAG00000012023	-	100	78.776	Equus_caballus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.512	ENSECAG00000010440	-	100	78.512	Equus_caballus
ENSPKIG00000008130	syf2	70	69.591	ENSEEUG00000015084	SYF2	93	69.591	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	86.920	ENSELUG00000003465	syf2	99	86.920	Esox_lucius
ENSPKIG00000008130	syf2	93	84.404	ENSFCAG00000010324	-	75	84.404	Felis_catus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSFCAG00000043095	-	95	79.828	Felis_catus
ENSPKIG00000008130	syf2	87	80.882	ENSFALG00000000460	SYF2	88	81.019	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.424	ENSFDAG00000008310	SYF2	100	79.424	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000008130	syf2	94	70.721	ENSFHEG00000007238	syf2	98	70.721	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000008130	syf2	91	87.907	ENSGMOG00000019138	syf2	96	87.907	Gadus_morhua
ENSPKIG00000008130	syf2	94	83.710	ENSGALG00000013639	SYF2	93	80.426	Gallus_gallus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.832	ENSGAFG00000019435	syf2	100	79.832	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.878	ENSGACG00000007305	syf2	100	82.427	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.615	ENSGAGG00000010670	SYF2	99	78.947	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.722	ENSGGOG00000012796	SYF2	95	80.687	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.878	ENSHBUG00000020477	syf2	100	82.773	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000008130	syf2	94	71.493	ENSHGLG00000004304	-	98	69.231	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.869	ENSHGLG00000014393	SYF2	100	77.869	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.869	ENSHGLG00100014722	SYF2	100	77.869	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000008130	syf2	100	82.353	ENSHCOG00000012904	syf2	78	82.353	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000008130	syf2	100	85.294	ENSIPUG00000019859	syf2	100	85.294	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000008130	syf2	62	80.137	ENSSTOG00000023984	SYF2	100	80.137	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000008130	syf2	85	84.925	ENSJJAG00000013301	Syf2	94	84.925	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.435	ENSKMAG00000013856	syf2	100	81.435	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000008130	syf2	92	90.323	ENSLBEG00000014425	syf2	100	84.874	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000008130	syf2	94	80.995	ENSLACG00000012064	SYF2	93	80.995	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000008130	syf2	100	83.613	ENSLOCG00000002728	syf2	95	83.613	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000008130	syf2	78	58.152	ENSLAFG00000030814	-	100	58.152	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.367	ENSLAFG00000023150	-	100	78.367	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSMFAG00000041831	SYF2	95	79.828	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000008130	syf2	92	83.796	ENSMMUG00000002968	SYF2	95	80.687	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSMNEG00000030180	SYF2	95	79.828	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSMLEG00000030248	SYF2	95	79.828	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	83.613	ENSMAMG00000010403	syf2	98	83.613	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	83.193	ENSMZEG00005006429	syf2	100	83.193	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000008130	syf2	85	84.422	ENSMGAG00000002019	SYF2	100	84.422	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.163	ENSMAUG00000018974	Syf2	91	84.163	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000008130	syf2	85	84.925	ENSMICG00000016191	SYF2	100	84.925	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.752	ENSMOCG00000022938	Syf2	100	79.752	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000008130	syf2	94	85.068	ENSMMOG00000002396	syf2	92	85.068	Mola_mola
ENSPKIG00000008130	syf2	94	80.717	ENSMODG00000013951	-	97	80.717	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.328	ENSMALG00000010706	syf2	100	81.743	Monopterus_albus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	80.342	MGP_CAROLIEiJ_G0026633	Syf2	96	80.342	Mus_caroli
ENSPKIG00000008130	syf2	99	80.342	ENSMUSG00000028821	Syf2	96	80.342	Mus_musculus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	80.342	MGP_PahariEiJ_G0028966	Syf2	96	80.342	Mus_pahari
ENSPKIG00000008130	syf2	99	80.342	MGP_SPRETEiJ_G0027613	Syf2	96	80.342	Mus_spretus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.079	ENSMPUG00000015801	-	96	79.079	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000008130	syf2	100	76.423	ENSMPUG00000015802	-	100	76.423	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000008130	syf2	99	77.917	ENSMLUG00000001885	SYF2	98	77.917	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	81.034	ENSNGAG00000007912	Syf2	93	81.034	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000008130	syf2	100	73.663	ENSNBRG00000010720	syf2	99	74.153	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.722	ENSNLEG00000035185	SYF2	95	80.687	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.189	ENSOPRG00000012870	SYF2	100	78.189	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000008130	syf2	97	80.617	ENSODEG00000017664	-	95	80.617	Octodon_degus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	71.983	ENSODEG00000014338	-	96	71.983	Octodon_degus
ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.425	ENSONIG00000008213	syf2	100	82.353	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000008130	syf2	86	84.158	ENSOANG00000009552	SYF2	100	84.158	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	78.279	ENSOCUG00000013050	SYF2	95	81.545	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000008130	syf2	97	83.843	ENSORLG00000028820	syf2	98	83.843	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.933	ENSORLG00020018333	syf2	100	81.933	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.933	ENSORLG00015014665	syf2	100	81.933	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000008130	syf2	100	81.933	ENSOMEG00000013911	syf2	100	81.933	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000008130	syf2	100	79.508	ENSOGAG00000009962	SYF2	100	79.508	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000008130	syf2	94	82.511	ENSOARG00000006348	-	90	82.511	Ovis_aries
ENSPKIG00000008130	syf2	83	59.487	ENSOARG00000006269	-	100	59.487	Ovis_aries
ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.722	ENSPPAG00000036579	SYF2	95	80.687	Pan_paniscus
ENSPKIG00000008130	syf2	93	84.404	ENSPPRG00000001638	-	89	84.404	Panthera_pardus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSPPRG00000001651	-	95	79.828	Panthera_pardus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSPTIG00000007036	-	95	79.828	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000008130	syf2	92	85.185	ENSPTIG00000005711	-	80	84.091	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.722	ENSPTRG00000000352	SYF2	95	80.687	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSPANG00000008139	SYF2	95	79.828	Papio_anubis
ENSPKIG00000008130	syf2	97	80.085	ENSPSIG00000011816	SYF2	92	80.085	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000008130	syf2	94	88.688	ENSPMGG00000008755	syf2	86	88.688	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.615	ENSPEMG00000008283	Syf2	91	84.615	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000008130	syf2	94	83.710	ENSPCIG00000014235	SYF2	88	83.710	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000008130	syf2	94	83.710	ENSPFOG00000004116	syf2	91	83.710	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000008130	syf2	94	83.258	ENSPLAG00000006691	syf2	95	83.258	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.311	ENSPMEG00000011684	syf2	100	77.311	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000008130	syf2	92	86.111	ENSPREG00000003009	syf2	100	81.092	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000008130	syf2	99	80.687	ENSPPYG00000001713	SYF2	95	80.687	Pongo_abelii
ENSPKIG00000008130	syf2	100	54.918	ENSPCOG00000027011	SYF2	100	54.918	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000008130	syf2	99	71.674	ENSPVAG00000005841	SYF2	95	71.674	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000008130	syf2	94	86.878	ENSPNYG00000004979	syf2	100	82.773	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000008130	syf2	100	85.062	ENSPNAG00000015570	syf2	100	85.062	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000008130	syf2	99	80.342	ENSRNOG00000060597	Syf2	96	80.342	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000008130	syf2	99	77.682	ENSRBIG00000042970	SYF2	95	77.682	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.828	ENSRROG00000001347	SYF2	95	79.828	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000008130	syf2	99	79.583	ENSSBOG00000020184	SYF2	99	79.583	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000008130	syf2	94	82.805	ENSSHAG00000015630	-	89	82.805	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000008130	syf2	87	83.981	ENSSHAG00000007152	-	100	83.981	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000008130	syf2	100	88.235	ENSSFOG00015023647	syf2	100	88.235	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	80.672	ENSSMAG00000009867	syf2	100	80.672	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000008130	syf2	93	88.128	ENSSDUG00000013072	syf2	100	83.613	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000008130	syf2	93	88.128	ENSSLDG00000012677	syf2	100	83.613	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000008130	syf2	94	64.706	ENSSARG00000012889	SYF2	100	61.066	Sorex_araneus
ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.615	ENSSPUG00000005251	SYF2	92	80.342	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	83.193	ENSSPAG00000009626	syf2	100	83.193	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	77.551	ENSSSCG00000037481	SYF2	100	77.551	Sus_scrofa
ENSPKIG00000008130	syf2	63	52.980	ENSTGUG00000001126	SYF2	86	53.143	Taeniopygia_guttata
ENSPKIG00000008130	syf2	100	80.833	ENSTRUG00000001499	syf2	95	79.747	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000008130	syf2	94	84.615	ENSTNIG00000016912	syf2	99	84.615	Tetraodon_nigroviridis
ENSPKIG00000008130	syf2	100	60.246	ENSTBEG00000017370	SYF2	99	60.246	Tupaia_belangeri
ENSPKIG00000008130	syf2	92	84.259	ENSTTRG00000003550	SYF2	100	77.959	Tursiops_truncatus
ENSPKIG00000008130	syf2	100	76.423	ENSUAMG00000002897	SYF2	100	76.423	Ursus_americanus
ENSPKIG00000008130	syf2	92	83.333	ENSUMAG00000013108	SYF2	100	76.016	Ursus_maritimus
ENSPKIG00000008130	syf2	96	81.778	ENSVPAG00000005705	SYF2	92	81.778	Vicugna_pacos
ENSPKIG00000008130	syf2	87	83.902	ENSVVUG00000027181	-	88	83.028	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000008130	syf2	99	78.970	ENSVVUG00000027175	-	100	76.423	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000008130	syf2	100	74.793	ENSXETG00000022797	syf2	97	74.793	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000008130	syf2	91	85.116	ENSXMAG00000022698	syf2	100	79.832	Xiphophorus_maculatus