EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000010087 (Gene tree)
Gene ID: 111833581
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: transcription activator BRG1-like
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 23010 bases
Position: chrPGUA01000046.1:2794334-2817343
Accession: 111833581
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000028539	ResIII	PF04851.15	7.4e-09	1	1
ENSPKIP00000028625	ResIII	PF04851.15	7.5e-09	1	1
ENSPKIP00000028539	BRK	PF07533.16	7.7e-17	1	1
ENSPKIP00000028625	BRK	PF07533.16	7.9e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000009319	-	6297	XM_023792008	ENSPKIP00000028539	1604 (aa)	XP_023647776	UPI000CD62EAA
ENSPKIT00000009407	-	4878	-	ENSPKIP00000028625	1625 (aa)	-	-

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000010087	-	100	71.762	ENSPKIG00000018469	-	97	70.625
ENSPKIG00000010087	-	97	89.234	ENSPKIG00000007770	SMARCA4	98	89.774

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000010087	-	98	87.147	ENSG00000127616	SMARCA4	100	100.000	Homo_sapiens
ENSPKIG00000010087	-	89	90.015	ENSAPOG00000004542	SMARCA4	96	86.410	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000010087	-	77	88.264	ENSAPOG00000003509	smarca4a	98	88.093	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000010087	-	98	82.871	ENSAMEG00000010868	SMARCA4	98	82.339	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000010087	-	92	85.656	ENSACIG00000003035	-	95	85.781	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000010087	-	97	87.197	ENSACIG00000021550	smarca4a	98	86.567	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000010087	-	92	86.881	ENSAOCG00000009450	-	94	88.530	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000010087	-	72	91.406	ENSAOCG00000019167	smarca4a	100	85.247	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000010087	-	93	88.780	ENSAPEG00000023108	-	95	85.125	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000010087	-	72	91.493	ENSAPEG00000015559	smarca4a	100	85.317	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000010087	-	97	87.699	ENSATEG00000011524	smarca4a	100	86.687	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000010087	-	99	84.545	ENSATEG00000001094	-	96	85.357	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000010087	-	97	86.992	ENSANAG00000036991	SMARCA4	98	83.531	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000010087	-	97	87.093	ENSACLG00000000163	smarca4a	98	87.162	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000010087	-	92	85.920	ENSACLG00000008638	-	94	86.004	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000010087	-	94	88.780	ENSAMXG00000011238	-	94	89.726	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000010087	-	96	84.391	ENSAMXG00000021023	smarca4a	99	83.980	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.657	ENSBTAG00000019220	SMARCA4	98	87.343	Bos_taurus
ENSPKIG00000010087	-	98	83.665	ENSCJAG00000005936	SMARCA4	98	82.541	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.147	ENSCAFG00000017584	SMARCA4	98	86.529	Canis_familiaris
ENSPKIG00000010087	-	98	87.147	ENSCAFG00020024620	SMARCA4	97	86.529	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000010087	-	98	83.585	ENSCHIG00000015318	SMARCA4	98	83.396	Capra_hircus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.146	ENSTSYG00000012966	SMARCA4	98	87.217	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000010087	-	92	81.351	ENSCAPG00000015932	SMARCA4	92	91.297	Cavia_aperea
ENSPKIG00000010087	-	98	87.022	ENSCPOG00000015549	SMARCA4	98	86.341	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000010087	-	98	83.811	ENSCCAG00000031660	SMARCA4	97	83.416	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.147	ENSCATG00000029530	SMARCA4	98	86.466	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000010087	-	98	87.335	ENSCLAG00000011946	SMARCA4	98	87.469	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000010087	-	100	86.895	ENSCPBG00000009994	SMARCA4	99	86.913	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000010087	-	98	87.085	ENSCANG00000036013	SMARCA4	98	86.466	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000010087	-	98	86.897	ENSCGRG00001016732	Smarca4	98	86.216	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000010087	-	98	86.897	ENSCGRG00000017242	Smarca4	98	86.216	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000010087	-	97	85.505	ENSCSEG00000014771	smarca4a	98	86.010	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000010087	-	97	85.541	ENSCVAG00000006979	smarca4a	99	85.572	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000010087	-	96	85.003	ENSCVAG00000003018	-	94	86.040	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000010087	-	92	85.867	ENSDARG00000104339	SMARCA4	94	86.922	Danio_rerio
ENSPKIG00000010087	-	97	87.097	ENSDARG00000077226	smarca4a	100	87.271	Danio_rerio
ENSPKIG00000010087	-	97	78.101	ENSDNOG00000048847	SMARCA4	90	91.549	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000010087	-	84	81.236	ENSDORG00000002544	Smarca4	87	83.000	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000010087	-	92	76.331	ENSETEG00000013361	SMARCA4	91	76.576	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000010087	-	98	86.959	ENSEASG00005006167	SMARCA4	98	84.984	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.022	ENSECAG00000008334	SMARCA4	98	86.404	Equus_caballus
ENSPKIG00000010087	-	100	86.760	ENSELUG00000010247	smarca4a	100	85.549	Esox_lucius
ENSPKIG00000010087	-	97	79.244	ENSELUG00000023232	-	93	80.264	Esox_lucius
ENSPKIG00000010087	-	98	86.984	ENSFCAG00000004894	SMARCA4	98	86.304	Felis_catus
ENSPKIG00000010087	-	74	92.017	ENSFALG00000004208	SMARCA4	92	85.928	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000010087	-	90	87.114	ENSFDAG00000012237	SMARCA4	95	87.889	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000010087	-	97	84.926	ENSFHEG00000007902	-	96	85.812	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000010087	-	97	85.101	ENSFHEG00000010182	smarca4a	100	84.569	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000010087	-	86	80.328	ENSGMOG00000002649	smarca4a	94	80.952	Gadus_morhua
ENSPKIG00000010087	-	91	82.975	ENSGMOG00000005756	-	89	82.186	Gadus_morhua
ENSPKIG00000010087	-	72	86.379	ENSGALG00000047145	SMARCA4	100	85.376	Gallus_gallus
ENSPKIG00000010087	-	91	86.272	ENSGAFG00000014900	smarca4a	99	86.886	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000010087	-	96	82.707	ENSGAFG00000008827	-	94	83.486	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000010087	-	99	80.419	ENSGACG00000016033	-	95	82.546	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000010087	-	97	85.433	ENSGACG00000006691	smarca4a	100	84.733	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.626	ENSGAGG00000016757	SMARCA4	98	86.872	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000010087	-	98	87.147	ENSGGOG00000009882	SMARCA4	98	86.466	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000010087	-	96	85.732	ENSHBUG00000005447	-	95	85.923	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000010087	-	98	87.437	ENSHBUG00000021172	smarca4a	100	86.695	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000010087	-	98	86.579	ENSHGLG00000010519	SMARCA4	98	85.964	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000010087	-	98	86.466	ENSHGLG00100013774	SMARCA4	98	85.714	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000010087	-	93	87.748	ENSHCOG00000009510	smarca4a	96	86.959	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000010087	-	97	87.823	ENSIPUG00000006107	smarca4a	100	87.576	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000010087	-	98	86.713	ENSIPUG00000016346	-	94	87.853	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000010087	-	98	86.959	ENSSTOG00000007939	SMARCA4	98	86.278	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000010087	-	98	84.951	ENSJJAG00000012877	Smarca4	98	84.101	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000010087	-	97	86.773	ENSKMAG00000011931	smarca4a	100	86.109	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000010087	-	98	84.834	ENSKMAG00000019518	-	94	88.430	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000010087	-	92	84.745	ENSLBEG00000017383	smarca4a	97	84.166	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000010087	-	95	83.568	ENSLBEG00000020655	-	94	83.642	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000010087	-	52	82.151	ENSLACG00000015309	SMARCA4	100	83.634	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000010087	-	97	85.778	ENSLOCG00000007820	smarca4a	99	84.925	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000010087	-	98	86.984	ENSLAFG00000001433	SMARCA4	98	86.304	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000010087	-	98	87.147	ENSMFAG00000032146	SMARCA4	97	86.466	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000010087	-	98	87.147	ENSMMUG00000012042	SMARCA4	96	91.456	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000010087	-	98	87.131	ENSMNEG00000028512	SMARCA4	98	86.512	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000010087	-	98	86.984	ENSMLEG00000034976	SMARCA4	98	86.304	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000010087	-	99	83.838	ENSMAMG00000002841	-	94	88.564	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000010087	-	98	86.880	ENSMAMG00000009256	smarca4a	100	86.389	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000010087	-	92	86.544	ENSMZEG00005023861	-	94	86.759	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000010087	-	98	87.320	ENSMZEG00005003889	smarca4a	100	86.581	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000010087	-	98	86.671	ENSMAUG00000020731	Smarca4	98	86.054	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000010087	-	98	86.921	ENSMICG00000009806	SMARCA4	98	86.241	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000010087	-	98	86.671	ENSMOCG00000022209	Smarca4	98	86.116	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000010087	-	95	85.659	ENSMMOG00000007571	smarca4a	98	85.677	Mola_mola
ENSPKIG00000010087	-	96	82.707	ENSMMOG00000008466	-	95	83.159	Mola_mola
ENSPKIG00000010087	-	98	85.908	ENSMODG00000006287	SMARCA4	98	84.686	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000010087	-	97	86.251	ENSMALG00000003388	smarca4a	100	86.160	Monopterus_albus
ENSPKIG00000010087	-	87	84.192	ENSMALG00000021534	-	96	85.610	Monopterus_albus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.085	MGP_CAROLIEiJ_G0031879	Smarca4	100	86.425	Mus_caroli
ENSPKIG00000010087	-	98	87.085	ENSMUSG00000032187	Smarca4	99	86.425	Mus_musculus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.476	MGP_PahariEiJ_G0014745	Smarca4	100	87.391	Mus_pahari
ENSPKIG00000010087	-	98	87.085	MGP_SPRETEiJ_G0033003	Smarca4	100	86.425	Mus_spretus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.210	ENSMPUG00000005711	SMARCA4	98	86.529	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000010087	-	98	87.335	ENSMLUG00000004491	-	98	86.591	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000010087	-	98	86.926	ENSNGAG00000021852	Smarca4	98	86.181	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000010087	-	95	85.473	ENSNBRG00000011457	smarca4a	96	85.882	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000010087	-	86	84.903	ENSNBRG00000018865	-	96	85.766	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000010087	-	94	84.013	ENSNLEG00000012389	SMARCA4	92	84.867	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000010087	-	78	86.207	ENSOPRG00000000885	-	76	86.207	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000010087	-	98	85.428	ENSODEG00000017127	SMARCA4	98	84.250	Octodon_degus
ENSPKIG00000010087	-	98	87.312	ENSONIG00000008196	smarca4a	100	86.408	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000010087	-	97	85.741	ENSONIG00000018040	-	95	86.176	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000010087	-	96	81.830	ENSOCUG00000001787	SMARCA4	96	82.250	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000010087	-	97	85.287	ENSORLG00000015452	smarca4a	100	85.627	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000010087	-	96	85.932	ENSORLG00000003955	-	96	85.134	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000010087	-	97	84.968	ENSORLG00020004611	smarca4a	100	85.627	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000010087	-	96	85.940	ENSORLG00020009728	-	96	85.144	Oryzias_latipes_hni
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