EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000010501 (Gene tree)
Gene ID: 111853297
Gene Symbol: prpf3
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 3
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 10548 bases
Position: chrPGUA01000253.1:60579-71126
Accession: 111853297
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000029176	PRP3	PF08572.10	3.2e-77	1	1
ENSPKIP00000029219	PRP3	PF08572.10	2.9e-76	1	1
ENSPKIP00000029219	PWI	PF01480.17	3.6e-12	1	1
ENSPKIP00000029176	PWI	PF01480.17	4.1e-12	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000009967	-	5402	-	ENSPKIP00000029176	699 (aa)	XP_023685791	UPI000CD63FB2
ENSPKIT00000010012	-	1869	-	ENSPKIP00000029219	622 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSG00000117360	PRPF3	100	74.322	Homo_sapiens
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	83.665	ENSAPOG00000015584	prpf3	100	84.091	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.608	ENSAMEG00000001630	PRPF3	100	74.465	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	81.895	ENSACIG00000007876	prpf3	100	81.895	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	82.511	ENSAOCG00000011449	prpf3	100	82.934	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	83.121	ENSATEG00000023583	prpf3	100	83.546	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	75.464	ENSAPLG00000002440	PRPF3	100	74.750	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.217	ENSACAG00000003176	PRPF3	100	74.538	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSANAG00000026138	PRPF3	100	74.322	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.682	ENSACLG00000020127	prpf3	100	81.108	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	82.889	ENSAMXG00000007306	prpf3	100	82.889	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSBTAG00000013946	PRPF3	100	74.322	Bos_taurus
ENSPKIG00000010501	prpf3	85	38.959	WBGene00010844	prp-3	95	35.901	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSCJAG00000009926	PRPF3	100	74.322	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSCAFG00000011820	PRPF3	100	74.322	Canis_familiaris
ENSPKIG00000010501	prpf3	81	72.566	ENSCAFG00020019653	PRPF3	100	72.389	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSCHIG00000015434	PRPF3	100	74.322	Capra_hircus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.608	ENSTSYG00000001383	PRPF3	100	74.465	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000010501	prpf3	92	68.491	ENSCAPG00000017812	PRPF3	95	68.491	Cavia_aperea
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.750	ENSCPOG00000008068	PRPF3	100	74.608	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSCCAG00000026380	PRPF3	100	74.322	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	62.890	ENSCATG00000041778	PRPF3	100	62.748	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.608	ENSCLAG00000015009	PRPF3	100	74.465	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000010501	prpf3	76	86.131	ENSCHOG00000011645	PRPF3	76	86.131	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.893	ENSCPBG00000008216	PRPF3	100	74.750	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000010501	prpf3	66	58.993	ENSCING00000003312	-	100	59.242	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000010501	prpf3	85	55.759	ENSCSAVG00000008720	-	94	55.556	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	73.894	ENSCANG00000036769	PRPF3	100	73.752	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSCGRG00001019100	Prpf3	100	74.322	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSCGRG00000007322	Prpf3	100	74.322	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	82.915	ENSCSEG00000002532	prpf3	100	82.915	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	81.418	ENSCVAG00000009318	prpf3	100	81.844	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	81.223	ENSDARG00000086425	prpf3	100	82.979	Danio_rerio
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	76.480	ENSDNOG00000005904	PRPF3	100	76.480	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000010501	prpf3	93	74.387	ENSDORG00000008664	Prpf3	100	74.233	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000010501	prpf3	91	52.013	FBgn0036915	Prp3	99	54.281	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.180	ENSETEG00000019124	PRPF3	100	74.037	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	63.293	ENSEBUG00000011680	prpf3	100	62.735	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.322	ENSEASG00005001566	PRPF3	100	74.180	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSECAG00000019840	PRPF3	100	74.322	Equus_caballus
ENSPKIG00000010501	prpf3	84	75.057	ENSEEUG00000007338	PRPF3	85	75.057	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	75.319	ENSELUG00000013624	prpf3	100	75.035	Esox_lucius
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSFCAG00000013940	PRPF3	100	74.322	Felis_catus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSFDAG00000010365	PRPF3	100	74.322	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	81.714	ENSFHEG00000021746	prpf3	100	82.143	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	81.303	ENSGMOG00000008535	prpf3	100	81.303	Gadus_morhua
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	75.606	ENSGALG00000028205	PRPF3	100	74.893	Gallus_gallus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.824	ENSGAFG00000012671	prpf3	100	81.250	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	90.217	ENSGACG00000011792	prpf3	100	82.695	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.750	ENSGAGG00000013765	PRPF3	100	77.362	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000010501	prpf3	86	81.711	ENSGGOG00000013174	PRPF3	100	81.818	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.824	ENSHBUG00000003493	prpf3	100	81.250	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.322	ENSHGLG00000016569	PRPF3	100	74.180	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	55.932	ENSHGLG00000016033	-	100	55.932	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.322	ENSHGLG00100007590	PRPF3	100	74.180	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	55.796	ENSHGLG00100008951	-	100	55.796	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	76.945	ENSHCOG00000014058	prpf3	100	77.369	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	82.286	ENSIPUG00000000902	PRPF3	100	82.286	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSSTOG00000001889	PRPF3	100	74.322	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	84.127	ENSKMAG00000001390	prpf3	100	84.127	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	85.397	ENSLBEG00000026310	prpf3	100	85.714	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000010501	prpf3	93	71.363	ENSLACG00000010541	PRPF3	100	71.363	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSLAFG00000004713	PRPF3	100	74.322	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSMFAG00000039791	PRPF3	100	74.322	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000010501	prpf3	90	73.144	ENSMMUG00000016301	PRPF3	98	72.986	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSMNEG00000038161	PRPF3	100	74.322	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000010501	prpf3	98	50.504	ENSMLEG00000041065	-	97	50.791	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000010501	prpf3	86	81.711	ENSMLEG00000040609	PRPF3	100	81.818	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	90.217	ENSMAMG00000014968	prpf3	100	82.737	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	84.751	ENSMZEG00005015970	prpf3	100	84.751	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	75.606	ENSMGAG00000000707	PRPF3	100	74.893	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSMAUG00000017112	Prpf3	100	74.322	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.322	ENSMICG00000015386	PRPF3	100	77.184	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSMOCG00000000242	Prpf3	100	74.322	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	76.056	ENSMMOG00000016131	prpf3	100	76.479	Mola_mola
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSMODG00000018774	PRPF3	100	74.322	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.198	ENSMALG00000007257	prpf3	100	80.198	Monopterus_albus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	MGP_CAROLIEiJ_G0025354	Prpf3	100	74.322	Mus_caroli
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSMUSG00000015748	Prpf3	100	74.322	Mus_musculus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.429	MGP_PahariEiJ_G0026798	Prpf3	100	74.286	Mus_pahari
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	MGP_SPRETEiJ_G0026298	Prpf3	100	74.322	Mus_spretus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	72.896	ENSMPUG00000005080	PRPF3	100	72.753	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.217	ENSMLUG00000004646	-	100	74.074	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSNGAG00000000910	Prpf3	100	74.322	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.028	ENSNBRG00000003462	prpf3	100	81.232	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000010501	prpf3	90	73.101	ENSNLEG00000009841	PRPF3	100	72.943	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000010501	prpf3	83	67.552	ENSMEUG00000008733	PRPF3	89	67.742	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.322	ENSOPRG00000010139	PRPF3	100	74.180	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.750	ENSODEG00000011363	-	100	74.608	Octodon_degus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	56.073	ENSODEG00000014412	-	100	55.791	Octodon_degus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	81.870	ENSONIG00000006394	prpf3	100	82.295	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	57.872	ENSOANG00000015441	PRPF3	100	57.872	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSOCUG00000011760	PRPF3	100	74.322	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.966	ENSORLG00000010330	prpf3	100	80.966	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.966	ENSORLG00020009054	prpf3	100	80.966	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	80.682	ENSORLG00015015016	prpf3	100	80.682	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000010501	prpf3	100	82.104	ENSOMEG00000000940	prpf3	100	82.418	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	70.513	ENSOGAG00000005352	PRPF3	100	70.370	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSOARG00000020798	PRPF3	100	74.322	Ovis_aries
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.322	ENSPPAG00000030983	PRPF3	100	74.180	Pan_paniscus
ENSPKIG00000010501	prpf3	98	57.826	ENSPPAG00000043769	-	99	57.391	Pan_paniscus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSPPRG00000000731	PRPF3	100	74.322	Panthera_pardus
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSPTIG00000005516	PRPF3	100	74.322	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000010501	prpf3	98	56.957	ENSPTRG00000047819	-	99	56.522	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.465	ENSPTRG00000001254	PRPF3	100	74.322	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.608	ENSPANG00000000499	PRPF3	100	74.465	Papio_anubis
ENSPKIG00000010501	prpf3	99	74.714	ENSPSIG00000014877	PRPF3	100	74.571	Pelodiscus_sinensis
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