EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000011234 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ctif
Alias: -
Full Name: CBP80/20-dependent translation initiation factor
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 49272 bases
Position: chrPGUA01000451.1:211150-260421
Accession: ZDB-GENE-130530-1003
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000030352	MIF4G	PF02854.19	5.3e-26	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000011168	-	1395	-	ENSPKIP00000030352	464 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.510	ENSG00000134030	CTIF	85	64.062	Homo_sapiens
ENSPKIG00000011234	ctif	99	64.476	ENSAPOG00000020192	ctif	83	64.887	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000011234	ctif	96	64.634	ENSAMEG00000006759	CTIF	77	64.228	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000011234	ctif	73	69.617	ENSAOCG00000014275	ctif	78	57.925	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000011234	ctif	93	67.867	ENSAPEG00000016975	ctif	80	58.835	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000011234	ctif	100	59.701	ENSATEG00000016752	ctif	80	59.065	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000011234	ctif	56	71.161	ENSAPLG00000014486	-	99	71.161	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.990	ENSACAG00000018006	CTIF	78	64.990	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.522	ENSANAG00000024925	CTIF	84	63.992	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000011234	ctif	91	65.928	ENSACLG00000005956	ctif	80	58.240	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000011234	ctif	92	68.750	ENSAMXG00000015964	ctif	80	57.331	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.314	ENSBTAG00000018901	CTIF	88	63.230	Bos_taurus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.078	ENSCJAG00000004729	CTIF	85	63.548	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.591	ENSCAFG00000019076	CTIF	85	63.566	Canis_familiaris
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.591	ENSCAFG00020026482	CTIF	85	63.566	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000011234	ctif	100	62.282	ENSCHIG00000014455	CTIF	85	62.282	Capra_hircus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	59.533	ENSTSYG00000030461	CTIF	94	59.763	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000011234	ctif	97	61.100	ENSCAPG00000011865	CTIF	86	58.027	Cavia_aperea
ENSPKIG00000011234	ctif	100	61.524	ENSCPOG00000001049	CTIF	85	61.524	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.078	ENSCCAG00000022758	CTIF	85	63.548	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.510	ENSCATG00000038134	CTIF	84	63.922	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.384	ENSCLAG00000008174	CTIF	84	62.941	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.510	ENSCSAG00000018021	CTIF	82	63.922	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000011234	ctif	50	54.789	ENSCHOG00000009041	-	66	53.184	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000011234	ctif	100	65.932	ENSCPBG00000025654	CTIF	88	65.932	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.706	ENSCANG00000030916	CTIF	100	64.118	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.173	ENSCGRG00001020158	Ctif	84	63.780	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000011234	ctif	100	58.601	ENSCGRG00000000052	Ctif	85	58.223	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000011234	ctif	91	68.539	ENSCSEG00000019857	ctif	80	57.248	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000011234	ctif	99	62.105	ENSCVAG00000017158	ctif	80	58.071	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000011234	ctif	95	71.901	ENSDARG00000090617	ctif	80	61.029	Danio_rerio
ENSPKIG00000011234	ctif	86	65.826	ENSDNOG00000037310	CTIF	100	64.908	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.258	ENSDORG00000003221	Ctif	85	64.453	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.453	ENSEASG00005016094	CTIF	84	63.230	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.453	ENSECAG00000020473	CTIF	84	63.230	Equus_caballus
ENSPKIG00000011234	ctif	97	62.628	ENSEEUG00000012451	CTIF	91	62.628	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000011234	ctif	97	66.337	ENSELUG00000008733	ctif	84	63.619	Esox_lucius
ENSPKIG00000011234	ctif	100	65.039	ENSFCAG00000000664	CTIF	88	63.760	Felis_catus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	66.200	ENSFALG00000008943	CTIF	84	65.996	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000011234	ctif	100	62.524	ENSFDAG00000017379	CTIF	85	62.141	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000011234	ctif	98	62.887	ENSFHEG00000004334	ctif	88	57.480	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000011234	ctif	56	79.693	ENSGMOG00000003452	ctif	99	79.693	Gadus_morhua
ENSPKIG00000011234	ctif	100	65.606	ENSGALG00000035912	-	87	65.606	Gallus_gallus
ENSPKIG00000011234	ctif	99	60.271	ENSGAFG00000011896	ctif	88	60.659	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000011234	ctif	56	78.626	ENSGACG00000016514	ctif	98	78.626	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000011234	ctif	80	65.803	ENSGAGG00000020663	CTIF	95	65.803	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.258	ENSGGOG00000015204	CTIF	85	64.062	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000011234	ctif	91	65.928	ENSHBUG00000018092	ctif	80	58.240	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.062	ENSHGLG00000005663	CTIF	84	62.257	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.062	ENSHGLG00100006976	CTIF	84	62.257	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000011234	ctif	99	57.938	ENSHCOG00000011784	ctif	82	58.763	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000011234	ctif	100	67.632	ENSIPUG00000014050	ctif	76	61.377	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.867	ENSSTOG00000001967	CTIF	85	63.548	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	65.606	ENSJJAG00000013706	Ctif	84	64.892	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000011234	ctif	93	66.575	ENSKMAG00000014651	ctif	79	58.349	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000011234	ctif	99	60.852	ENSLBEG00000018277	ctif	87	61.010	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000011234	ctif	98	74.400	ENSLOCG00000011697	ctif	79	67.892	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000011234	ctif	90	60.797	ENSLAFG00000016335	CTIF	99	84.411	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.510	ENSMFAG00000037903	CTIF	85	63.672	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.510	ENSMMUG00000020898	CTIF	84	63.922	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.510	ENSMNEG00000039395	CTIF	84	63.922	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.258	ENSMLEG00000041132	CTIF	85	63.672	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000011234	ctif	91	67.956	ENSMAMG00000014741	ctif	80	59.475	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000011234	ctif	76	63.158	ENSMZEG00005019767	ctif	61	64.646	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000011234	ctif	83	41.568	ENSMGAG00000001378	CTIF	81	41.109	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.281	ENSMAUG00000000656	Ctif	85	62.573	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.510	ENSMICG00000010167	CTIF	85	63.178	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.938	ENSMOCG00000020507	Ctif	85	62.984	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000011234	ctif	100	59.281	ENSMODG00000003464	CTIF	83	59.798	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000011234	ctif	99	58.111	ENSMALG00000020553	ctif	99	58.727	Monopterus_albus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	61.163	MGP_CAROLIEiJ_G0022408	Ctif	85	60.861	Mus_caroli
ENSPKIG00000011234	ctif	100	61.121	ENSMUSG00000052928	Ctif	85	60.821	Mus_musculus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.992	MGP_PahariEiJ_G0019137	Ctif	84	63.495	Mus_pahari
ENSPKIG00000011234	ctif	100	61.308	MGP_SPRETEiJ_G0023321	Ctif	63	83.660	Mus_spretus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.648	ENSMPUG00000000844	CTIF	85	62.984	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.529	ENSMLUG00000003025	CTIF	84	62.257	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.244	ENSNGAG00000011452	Ctif	85	63.725	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000011234	ctif	91	66.205	ENSNBRG00000008679	ctif	80	58.427	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.202	ENSNLEG00000011503	CTIF	85	63.372	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000011234	ctif	100	58.300	ENSMEUG00000000218	CTIF	84	57.426	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.690	ENSOPRG00000003558	CTIF	84	61.197	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000011234	ctif	100	60.788	ENSODEG00000018390	CTIF	85	60.338	Octodon_degus
ENSPKIG00000011234	ctif	99	60.388	ENSONIG00000007750	ctif	84	61.736	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	52.878	ENSOANG00000001337	CTIF	100	51.957	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.484	ENSOCUG00000024842	CTIF	84	63.889	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000011234	ctif	99	57.677	ENSORLG00000005786	ctif	84	57.760	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000011234	ctif	94	63.003	ENSORLG00020005385	ctif	84	57.782	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000011234	ctif	99	59.091	ENSORLG00015011872	ctif	84	58.893	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000011234	ctif	96	64.230	ENSOMEG00000007917	ctif	80	57.196	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.261	ENSOGAG00000013927	CTIF	84	62.573	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.867	ENSOARG00000003754	CTIF	85	63.178	Ovis_aries
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.258	ENSPPAG00000023554	CTIF	85	64.062	Pan_paniscus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.786	ENSPPRG00000002265	CTIF	85	63.760	Panthera_pardus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.981	ENSPTIG00000013761	CTIF	85	64.062	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.648	ENSPTRG00000010009	CTIF	85	64.062	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.510	ENSPANG00000017087	CTIF	85	63.672	Papio_anubis
ENSPKIG00000011234	ctif	100	65.731	ENSPSIG00000006508	CTIF	88	65.731	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000011234	ctif	100	53.875	ENSPMGG00000022958	ctif	80	55.166	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.281	ENSPEMG00000022746	Ctif	84	63.477	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000011234	ctif	90	62.723	ENSPCIG00000026247	CTIF	78	78.707	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000011234	ctif	98	63.636	ENSPFOG00000009243	ctif	84	60.742	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000011234	ctif	98	63.889	ENSPLAG00000019171	ctif	85	59.542	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000011234	ctif	98	63.889	ENSPMEG00000020089	ctif	80	57.248	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000011234	ctif	93	63.757	ENSPREG00000017326	ctif	81	53.779	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.706	ENSPPYG00000009147	CTIF	100	64.314	Pongo_abelii
ENSPKIG00000011234	ctif	100	61.961	ENSPCOG00000013391	CTIF	84	60.618	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.258	ENSPVAG00000001965	CTIF	85	63.743	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000011234	ctif	99	61.100	ENSPNYG00000007879	ctif	84	61.224	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000011234	ctif	91	74.118	ENSPNAG00000029174	ctif	79	60.861	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.137	ENSRNOG00000018342	Ctif	75	79.848	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.902	ENSRBIG00000043937	CTIF	85	64.062	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.706	ENSRROG00000006039	CTIF	85	63.867	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000011234	ctif	100	63.743	ENSSBOG00000028468	CTIF	88	63.209	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000011234	ctif	100	59.635	ENSSHAG00000016321	CTIF	83	59.229	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000011234	ctif	98	81.233	ENSSFOG00015022594	ctif	84	69.815	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000011234	ctif	91	68.245	ENSSMAG00000005707	ctif	84	59.880	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000011234	ctif	91	71.387	ENSSDUG00000016033	ctif	73	67.102	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000011234	ctif	100	65.731	ENSSPUG00000014734	CTIF	86	65.663	Sphenodon_punctatus
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ENSPKIG00000011234	ctif	99	59.800	ENSTNIG00000018763	ctif	85	59.000	Tetraodon_nigroviridis
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ENSPKIG00000011234	ctif	81	60.613	ENSUAMG00000007299	CTIF	72	59.670	Ursus_americanus
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ENSPKIG00000011234	ctif	100	64.648	ENSVVUG00000014347	CTIF	88	63.372	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000011234	ctif	100	49.903	ENSXETG00000026836	ctif	59	75.494	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000011234	ctif	73	62.881	ENSXCOG00000002477	ctif	86	59.033	Xiphophorus_couchianus
ENSPKIG00000011234	ctif	98	64.211	ENSXMAG00000004236	ctif	86	57.707	Xiphophorus_maculatus