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Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000011439 (Gene tree)
Gene ID: 111834954
Gene Symbol: prpf38a
Alias: -
Full Name: pre-mRNA processing factor 38A
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 3973 bases
Position: chrPGUA01000006.1:3867906-3871878
Accession: 111834954
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000030658	PRP38	PF03371.15	2.6e-63	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000011482	-	2624	-	ENSPKIP00000030658	308 (aa)	XP_023650585	UPI000CD66946

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSG00000134748	PRPF38A	100	78.846	Homo_sapiens
ENSPKIG00000011439	prpf38a	95	93.197	ENSAPOG00000011652	prpf38a	100	92.880	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSAMEG00000009319	PRPF38A	100	78.846	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	91.441	ENSACIG00000012292	prpf38a	100	85.714	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	95	93.197	ENSAOCG00000018004	prpf38a	100	92.880	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000011439	prpf38a	95	93.197	ENSAPEG00000021414	prpf38a	100	92.880	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	91.855	ENSATEG00000004608	prpf38a	100	92.233	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	79	75.304	ENSAPLG00000005827	PRPF38A	99	73.684	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	79.808	ENSACAG00000008249	PRPF38A	100	80.128	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSANAG00000027839	PRPF38A	100	78.846	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	58.599	ENSANAG00000029204	-	100	55.449	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	92.308	ENSACLG00000021595	prpf38a	100	93.204	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	84.026	ENSAMXG00000029274	prpf38a	100	85.942	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSBTAG00000002720	PRPF38A	100	78.846	Bos_taurus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	63	63.590	WBGene00008380	prp-38	59	65.426	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSCJAG00000021594	PRPF38A	100	78.846	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSCAFG00000003740	PRPF38A	100	78.846	Canis_familiaris
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSCAFG00020010939	PRPF38A	100	78.846	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSCHIG00000024730	PRPF38A	100	78.846	Capra_hircus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	86	76.208	ENSTSYG00000031994	-	95	74.721	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSTSYG00000009868	-	100	78.846	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	81.935	ENSCPOG00000005079	PRPF38A	100	82.903	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	77.814	ENSCCAG00000026502	PRPF38A	100	77.885	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSCATG00000032296	PRPF38A	100	78.846	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	54.516	ENSCATG00000044190	-	57	54.255	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSCLAG00000005816	PRPF38A	100	78.846	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.449	ENSCPBG00000014791	PRPF38A	100	79.167	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000011439	prpf38a	75	69.697	ENSCSAVG00000009580	-	62	77.128	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000011439	prpf38a	75	86.147	ENSCANG00000032608	PRPF38A	74	86.878	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSCGRG00001018502	-	100	78.846	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000011439	prpf38a	85	70.498	ENSCGRG00001002557	-	74	73.756	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSCGRG00000014868	Prpf38a	100	78.846	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	91.403	ENSCSEG00000001269	prpf38a	76	91.403	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	93.213	ENSCVAG00000012305	prpf38a	100	93.528	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	83.067	ENSDARG00000039213	prpf38a	100	84.984	Danio_rerio
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSDNOG00000042326	PRPF38A	100	78.846	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	85	74.905	ENSDORG00000023691	-	67	87.234	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	68.590	ENSDORG00000023857	-	100	67.308	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000011439	prpf38a	85	74.905	ENSDORG00000025371	-	67	87.234	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000011439	prpf38a	68	68.720	FBgn0050342	Prp38	57	72.872	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000011439	prpf38a	77	79.498	ENSEBUG00000012588	prpf38a	71	79.372	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSEASG00005014427	PRPF38A	100	78.846	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSECAG00000022628	PRPF38A	100	78.846	Equus_caballus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	93.213	ENSELUG00000021094	prpf38a	100	94.175	Esox_lucius
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSFCAG00000002518	PRPF38A	100	78.846	Felis_catus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	99	75.081	ENSFALG00000003612	-	63	86.170	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000011439	prpf38a	87	77.122	ENSFALG00000005598	-	100	75.646	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	82.258	ENSFDAG00000011287	PRPF38A	100	79.612	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000011439	prpf38a	91	80.645	ENSFHEG00000014317	prpf38a	75	91.855	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	54	94.578	ENSGMOG00000011384	prpf38a	54	94.578	Gadus_morhua
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSGALG00000010627	PRPF38A	100	78.846	Gallus_gallus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	92.308	ENSGAFG00000012422	prpf38a	100	93.204	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	90.135	ENSGACG00000005423	prpf38a	100	91.961	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	50	88.387	ENSGACG00000000182	-	100	88.824	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.449	ENSGAGG00000020547	PRPF38A	100	79.167	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSGGOG00000003940	PRPF38A	100	78.846	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000011439	prpf38a	61	94.180	ENSHBUG00000020572	prpf38a	80	94.149	Haplochromis_burtoni
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ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSHGLG00000000475	PRPF38A	100	78.846	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSHGLG00100008935	PRPF38A	100	78.846	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	73.226	ENSHGLG00100003928	-	100	70.130	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000011439	prpf38a	84	73.134	ENSHCOG00000020781	prpf38a	59	92.021	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000011439	prpf38a	91	79.298	ENSIPUG00000005757	prpf38a	71	92.342	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSSTOG00000015610	PRPF38A	100	78.846	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSJJAG00000015811	Prpf38a	100	78.846	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	93.213	ENSKMAG00000006588	prpf38a	100	93.528	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	95	92.857	ENSLBEG00000020585	prpf38a	100	92.557	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	81.410	ENSLACG00000011495	PRPF38A	100	79.808	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	94.498	ENSLOCG00000006262	prpf38a	100	94.175	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSLAFG00000025862	PRPF38A	100	78.846	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSMFAG00000039449	PRPF38A	100	78.846	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000011439	prpf38a	87	77.122	ENSMMUG00000014333	PRPF38A	98	75.368	Macaca_mulatta
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ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSMNEG00000031221	PRPF38A	100	78.846	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSMLEG00000041105	PRPF38A	100	78.846	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	94.118	ENSMAMG00000015431	prpf38a	100	94.175	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	92.308	ENSMZEG00005017838	prpf38a	100	93.204	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000011439	prpf38a	75	86.147	ENSMGAG00000011176	PRPF38A	74	86.878	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000011439	prpf38a	85	82.197	ENSMAUG00000018029	-	84	82.805	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSMICG00000014193	PRPF38A	100	78.846	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSMOCG00000013080	Prpf38a	100	78.846	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	88.065	ENSMMOG00000016972	prpf38a	100	86.774	Mola_mola
ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	77.955	ENSMODG00000000644	PRPF38A	100	77.955	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000011439	prpf38a	72	94.118	ENSMALG00000019363	prpf38a	97	94.498	Monopterus_albus
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ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	76.923	ENSMEUG00000003860	PRPF38A	100	75.641	Notamacropus_eugenii
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ENSPKIG00000011439	prpf38a	100	80.128	ENSOCUG00000000963	PRPF38A	100	78.846	Oryctolagus_cuniculus
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ENSPKIG00000011439	prpf38a	95	92.517	ENSOMEG00000016333	prpf38a	100	92.557	Oryzias_melastigma
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