EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000011876 (Gene tree)
Gene ID: 111842841
Gene Symbol: skiv2l
Alias: -
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 15976 bases
Position: chrPGUA01000096.1:1892972-1908947
Accession: 111842841
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000031496	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.7e-27	1	1
ENSPKIP00000031453	rRNA_proc-arch	PF13234.6	1.7e-27	1	1
ENSPKIP00000031586	rRNA_proc-arch	PF13234.6	2.9e-22	1	1
ENSPKIP00000031586	DEAD	PF00270.29	8.4e-17	1	1
ENSPKIP00000031496	DEAD	PF00270.29	9.5e-17	1	1
ENSPKIP00000031453	DEAD	PF00270.29	9.5e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000012298	-	4554	-	ENSPKIP00000031453	1259 (aa)	-	-
ENSPKIT00000012342	-	3847	XM_023809880	ENSPKIP00000031496	1257 (aa)	XP_023665648	UPI000CD5E55C
ENSPKIT00000012434	-	3480	-	ENSPKIP00000031586	1159 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000011876's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03018	RNA degradation	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000011876's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000011876	skiv2l	82	36.694	ENSPKIG00000020833	mtrex	94	36.089

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.350	ENSG00000204351	SKIV2L	99	60.205	Homo_sapiens
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.441	ENSAPOG00000008257	skiv2l	100	78.441	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.637	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	99	60.568	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	76.948	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	77.189	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.759	ENSAOCG00000017352	skiv2l	100	78.759	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.759	ENSAPEG00000001055	skiv2l	100	78.759	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.316	ENSATEG00000007601	skiv2l	100	79.316	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	96	67.490	ENSACAG00000011746	SKIV2L	100	61.765	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.349	ENSANAG00000037992	SKIV2L	99	60.204	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.077	ENSACLG00000006886	skiv2l	100	79.077	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.520	ENSAMXG00000011517	skiv2l	100	78.520	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.367	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	99	59.717	Bos_taurus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	89	42.071	WBGene00008502	skih-2	93	42.342	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.190	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	99	60.047	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.526	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	99	60.362	Canis_familiaris
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.447	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	99	60.284	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.398	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	99	60.252	Capra_hircus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.857	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	99	59.906	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.432	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	99	60.364	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.623	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	99	60.410	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.190	ENSCATG00000036901	SKIV2L	99	60.126	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.984	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	99	59.811	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.270	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	99	60.126	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	86	63.158	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	97	63.158	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000011876	skiv2l	93	50.382	ENSCING00000005576	-	99	50.467	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.190	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	59.608	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.506	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	99	60.281	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	78.309	ENSCSEG00000011326	skiv2l	99	78.424	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.441	ENSCVAG00000003072	skiv2l	100	78.441	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.206	ENSDARG00000062206	skiv2l	100	79.206	Danio_rerio
ENSPKIG00000011876	skiv2l	92	63.384	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	99	57.332	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	92	49.645	FBgn0039117	tst	96	46.387	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000011876	skiv2l	73	77.778	ENSETEG00000009522	SKIV2L	68	77.778	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000011876	skiv2l	87	61.741	ENSEBUG00000013680	-	99	55.292	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	60.451	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	61.460	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	93	60.438	ENSECAG00000021823	SKIV2L	95	60.399	Equus_caballus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	55	75.494	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	75.494	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.048	ENSELUG00000000181	skiv2l	98	82.046	Esox_lucius
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.734	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	99	60.664	Felis_catus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	58.917	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	99	59.289	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.839	ENSFHEG00000008853	skiv2l	100	78.839	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	75.561	ENSGMOG00000005926	skiv2l	99	75.561	Gadus_morhua
ENSPKIG00000011876	skiv2l	82	56.830	ENSGALG00000035499	SKIV2L	98	56.818	Gallus_gallus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.520	ENSGAFG00000002382	skiv2l	100	78.759	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	77.496	ENSGACG00000002927	skiv2l	99	77.681	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.512	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	99	60.364	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.918	ENSHBUG00000000726	skiv2l	100	78.918	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.494	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	99	60.095	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	65.073	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	99	58.675	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000011876	skiv2l	98	73.917	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	74.087	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.759	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	78.981	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.908	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	99	60.348	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	57	60.544	ENSLACG00000002986	-	60	60.544	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.016	ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.031	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.190	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	99	60.126	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.190	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	99	60.047	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.190	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	99	60.126	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.805	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	99	59.890	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.077	ENSMAMG00000002927	skiv2l	100	79.077	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.918	ENSMZEG00005026415	skiv2l	100	78.918	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000011876	skiv2l	68	50.214	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	95	50.214	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.286	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	99	60.016	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.828	ENSMICG00000046331	SKIV2L	99	60.757	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.091	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	99	58.991	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	75.738	ENSMMOG00000014547	skiv2l	99	75.738	Mola_mola
ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	67.218	ENSMODG00000015052	SKIV2L	99	60.835	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	75.060	ENSMALG00000010535	skiv2l	99	75.060	Monopterus_albus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.286	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	99	60.063	Mus_caroli
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.321	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	99	60.063	Mus_musculus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.589	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	99	60.456	Mus_pahari
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.321	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	99	60.063	Mus_spretus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.572	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	99	60.711	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.984	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	99	59.843	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	76.330	ENSNBRG00000018650	skiv2l	99	76.635	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.696	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	100	59.477	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000011876	skiv2l	78	61.947	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	61.947	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.392	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	99	59.828	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.289	ENSODEG00000017516	SKIV2L	99	59.953	Octodon_degus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.157	ENSONIG00000013500	skiv2l	100	79.157	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.270	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	99	60.204	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	77.963	ENSORLG00000002021	skiv2l	100	77.963	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	77.804	ENSORLG00020009462	skiv2l	100	77.804	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	77.645	ENSORLG00015016750	skiv2l	100	77.645	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.441	ENSOMEG00000008531	skiv2l	100	78.441	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.447	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	99	60.300	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	57.422	ENSOARG00000002411	-	99	57.309	Ovis_aries
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.032	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	100	59.890	Pan_paniscus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.717	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	99	60.726	Panthera_pardus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.398	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	99	60.331	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.447	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	99	60.300	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	66.081	ENSPANG00000011501	SKIV2L	100	59.062	Papio_anubis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	76.935	ENSPMGG00000019707	skiv2l	99	77.255	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.349	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	99	60.204	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	66.494	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	99	60.394	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.361	ENSPFOG00000002424	skiv2l	100	78.600	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.679	ENSPLAG00000018304	skiv2l	100	78.679	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.600	ENSPMEG00000006997	skiv2l	100	78.839	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	74.896	ENSPREG00000002277	skiv2l	99	74.979	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	59.984	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	99	59.842	Pongo_abelii
ENSPKIG00000011876	skiv2l	76	74.074	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	72	74.074	Procavia_capensis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	61.116	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	99	60.361	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.478	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	99	60.236	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	80.142	ENSPNYG00000017853	skiv2l	99	80.142	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.428	ENSPNAG00000011823	skiv2l	100	79.428	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.445	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	99	60.220	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	58.976	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	58.924	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	67.011	ENSRROG00000036429	SKIV2L	99	60.126	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000011876	skiv2l	90	39.485	YLR398C	-	90	39.485	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.577	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	99	60.428	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	66.494	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	99	59.245	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	84.022	ENSSFOG00015016930	skiv2l	100	84.022	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	78.600	ENSSMAG00000020185	skiv2l	100	78.600	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	79.236	ENSSDUG00000019977	skiv2l	100	79.236	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	74.498	ENSSLDG00000024382	skiv2l	99	74.498	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	63.269	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	99	58.243	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	95	78.841	ENSSPAG00000012904	skiv2l	99	78.956	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.489	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	99	60.331	Sus_scrofa
ENSPKIG00000011876	skiv2l	87	65.226	ENSTRUG00000000966	skiv2l	99	66.506	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	74.762	ENSTNIG00000004382	skiv2l	99	75.099	Tetraodon_nigroviridis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	87	80.519	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	62.469	Tupaia_belangeri
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	56.574	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	99	56.457	Tursiops_truncatus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.797	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	99	60.726	Ursus_americanus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	94	60.519	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	61.715	Ursus_maritimus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.319	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	60.252	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	57.998	ENSXETG00000010932	skiv2l	99	57.998	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	77.494	ENSXCOG00000019517	skiv2l	97	77.733	Xiphophorus_couchianus
ENSPKIG00000011876	skiv2l	100	77.963	ENSXMAG00000014079	skiv2l	100	78.202	Xiphophorus_maculatus