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Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000015190 (Gene tree)
Gene ID: 111833110
Gene Symbol: pelo
Alias: -
Full Name: pelota mRNA surveillance and ribosome rescue factor
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 11422 bases
Position: chrPGUA01000434.1:417711-429132
Accession: 111833110
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000036798	eRF1_2	PF03464.15	1.5e-32	1	1
ENSPKIP00000036826	eRF1_2	PF03464.15	1.5e-32	1	1
ENSPKIP00000036764	eRF1_2	PF03464.15	1.7e-32	1	1
ENSPKIP00000036798	eRF1_3	PF03465.15	2.1e-24	1	1
ENSPKIP00000036764	eRF1_3	PF03465.15	2.6e-24	1	1
ENSPKIP00000036826	eRF1_3	PF03465.15	1e-12	1	1
ENSPKIP00000036798	eRF1_1	PF03463.15	1.4e-51	1	1
ENSPKIP00000036826	eRF1_1	PF03463.15	2e-31	1	1
ENSPKIP00000036764	eRF1_1	PF03463.15	2.1e-31	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000017717	-	1946	-	ENSPKIP00000036764	406 (aa)	-	-
ENSPKIT00000017751	-	1728	-	ENSPKIP00000036798	385 (aa)	XP_023646816	UPI000CD5EC31
ENSPKIT00000017779	-	1227	-	ENSPKIP00000036826	381 (aa)	-	-

Gene Model

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Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
pki03015	mRNA surveillance pathway	KEGG

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSG00000152684	PELO	100	82.078	Homo_sapiens
ENSPKIG00000015190	pelo	64	91.903	ENSAPOG00000000616	pelo	90	91.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000015190	pelo	64	91.903	ENSAPOG00000023700	-	90	91.903	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	ENSAPOG00000023072	pelo	100	89.091	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.597	ENSAMEG00000007734	PELO	100	82.597	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000015190	pelo	97	84.450	ENSACIG00000014386	pelo	97	89.941	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.351	ENSAOCG00000023717	pelo	100	89.351	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.351	ENSAPEG00000011235	pelo	100	89.351	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.870	ENSATEG00000019550	pelo	100	89.870	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000015190	pelo	77	74.497	ENSAPLG00000013265	PELO	100	74.497	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.933	ENSACAG00000004352	PELO	100	82.078	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.597	ENSANAG00000014096	PELO	100	82.597	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.312	ENSACLG00000010305	pelo	100	88.312	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000015190	pelo	97	93.566	ENSAMXG00000020299	pelo	100	93.264	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSBTAG00000003268	PELO	99	82.338	Bos_taurus
ENSPKIG00000015190	pelo	99	59.580	WBGene00011280	pelo-1	100	59.580	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSCJAG00000035190	PELO	100	82.338	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	ENSCAFG00020023234	PELO	100	82.857	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSCHIG00000016410	PELO	99	82.078	Capra_hircus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.597	ENSTSYG00000005203	PELO	100	82.597	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.117	ENSCPOG00000027406	PELO	100	83.117	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSCCAG00000035600	PELO	100	82.338	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSCATG00000011829	PELO	100	82.078	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.597	ENSCLAG00000005043	PELO	100	82.597	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSCSAG00000016692	PELO	100	82.078	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSCHOG00000000523	PELO	100	82.338	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.667	ENSCPBG00000007544	PELO	100	81.818	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000015190	pelo	97	66.488	ENSCING00000001979	-	100	65.885	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000015190	pelo	100	68.312	ENSCSAVG00000006158	-	99	68.312	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSCANG00000023382	PELO	100	82.078	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000015190	pelo	97	83.110	ENSCGRG00001024665	Pelo	100	82.857	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000015190	pelo	97	83.646	ENSCGRG00000004570	Pelo	100	83.377	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	ENSCSEG00000008807	pelo	100	89.091	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.831	ENSCVAG00000016082	pelo	100	88.831	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	92.208	ENSDARG00000055477	pelo	100	92.208	Danio_rerio
ENSPKIG00000015190	pelo	96	81.622	ENSDNOG00000036721	PELO	96	81.622	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.597	ENSDORG00000016689	Pelo	100	82.597	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000015190	pelo	96	67.568	FBgn0011207	pelo	97	66.319	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000015190	pelo	74	74.731	ENSEBUG00000004955	pelo	99	74.731	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	ENSEASG00005013348	PELO	100	82.857	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	91.948	ENSELUG00000023229	pelo	100	91.948	Esox_lucius
ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.377	ENSFCAG00000032341	PELO	100	83.377	Felis_catus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.636	ENSFALG00000004559	PELO	100	83.636	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000015190	pelo	74	82.746	ENSFDAG00000002076	PELO	88	82.746	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000015190	pelo	100	87.792	ENSFHEG00000009769	pelo	100	87.792	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000015190	pelo	98	89.920	ENSGMOG00000005849	pelo	100	89.610	Gadus_morhua
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.052	ENSGAFG00000019350	pelo	100	88.052	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000015190	pelo	100	90.390	ENSGACG00000007245	pelo	100	90.390	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.933	ENSGAGG00000004018	PELO	100	82.078	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSGGOG00000012635	PELO	100	82.078	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.312	ENSHBUG00000005866	pelo	100	88.312	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	ENSHGLG00000005932	PELO	100	82.857	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000015190	pelo	100	80.519	ENSHGLG00100017627	PELO	100	80.519	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000015190	pelo	100	86.753	ENSHCOG00000016782	pelo	100	86.753	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000015190	pelo	100	90.909	ENSIPUG00000020627	pelo	100	90.909	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	ENSSTOG00000027378	PELO	100	82.857	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	81.039	ENSJJAG00000015032	Pelo	100	81.039	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	90.130	ENSKMAG00000021305	pelo	100	90.130	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.870	ENSLBEG00000022399	pelo	100	89.870	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSLAFG00000020551	PELO	100	82.078	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSMFAG00000000651	PELO	100	82.078	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSMMUG00000039101	PELO	100	82.078	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSMNEG00000035538	PELO	100	82.078	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSMLEG00000039113	PELO	100	82.078	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000015190	pelo	97	91.957	ENSMAMG00000013260	pelo	100	91.169	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.312	ENSMZEG00005014258	pelo	100	88.312	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.597	ENSMAUG00000009770	Pelo	100	82.597	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSMICG00000044040	PELO	100	82.338	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSMOCG00000017554	Pelo	100	82.338	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	ENSMMOG00000001324	pelo	100	89.091	Mola_mola
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.610	ENSMALG00000008194	pelo	100	89.610	Monopterus_albus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	MGP_CAROLIEiJ_G0018915	Pelo	100	82.078	Mus_caroli
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSMUSG00000042275	Pelo	100	82.078	Mus_musculus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	MGP_PahariEiJ_G0015985	Pelo	100	82.338	Mus_pahari
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	MGP_SPRETEiJ_G0019793	Pelo	100	82.078	Mus_spretus
ENSPKIG00000015190	pelo	99	81.250	ENSMLUG00000024132	PELO	100	81.250	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	ENSNGAG00000019331	Pelo	100	82.857	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.312	ENSNBRG00000011799	pelo	100	88.312	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSNLEG00000035970	PELO	100	82.078	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000015190	pelo	100	81.299	ENSMEUG00000005468	PELO	100	81.299	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000015190	pelo	98	81.794	ENSOPRG00000018793	PELO	100	81.794	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.117	ENSODEG00000017579	PELO	100	83.117	Octodon_degus
ENSPKIG00000015190	pelo	96	88.410	ENSONIG00000011511	pelo	100	88.052	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	ENSOCUG00000023902	PELO	100	82.857	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.831	ENSORLG00000005827	pelo	100	88.831	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	ENSORLG00020016456	pelo	100	89.091	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000015190	pelo	100	89.091	ENSORLG00015014447	pelo	100	89.167	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000015190	pelo	100	90.649	ENSOMEG00000021567	pelo	100	90.649	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSOGAG00000027940	PELO	100	82.338	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSOARG00000008324	PELO	99	82.338	Ovis_aries
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSPPAG00000038951	PELO	100	82.078	Pan_paniscus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.377	ENSPPRG00000018800	PELO	100	83.377	Panthera_pardus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	83.377	ENSPTIG00000019988	PELO	100	83.377	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000015190	pelo	100	81.818	ENSPTRG00000034409	PELO	100	81.818	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.078	ENSPANG00000010902	PELO	100	82.078	Papio_anubis
ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.400	ENSPSIG00000004971	PELO	100	81.558	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000015190	pelo	66	90.157	ENSPMGG00000014561	pelo	94	90.157	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.857	ENSPEMG00000015584	Pelo	100	82.857	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000015190	pelo	99	82.507	ENSPCIG00000004880	PELO	99	82.507	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.571	ENSPFOG00000007277	pelo	100	88.571	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.831	ENSPLAG00000020787	pelo	100	88.831	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.571	ENSPMEG00000016964	pelo	100	88.571	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.831	ENSPREG00000023071	pelo	100	88.831	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000015190	pelo	97	82.574	ENSPPYG00000015451	PELO	96	82.078	Pongo_abelii
ENSPKIG00000015190	pelo	100	82.338	ENSPCOG00000021178	PELO	100	82.338	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000015190	pelo	100	88.312	ENSPNYG00000017325	pelo	100	88.312	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000015190	pelo	97	94.102	ENSPNAG00000012458	pelo	100	93.264	Pygocentrus_nattereri
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