EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000016429 (Gene tree)
Gene ID: 111857475
Gene Symbol: dus4l
Alias: -
Full Name: dihydrouridine synthase 4-like (S. cerevisiae)
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6019 bases
Position: chrPGUA01000110.1:1095605-1101623
Accession: ZDB-GENE-040801-233
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000038805	Dus	PF01207.17	1.2e-69	1	1
ENSPKIP00000038799	Dus	PF01207.17	1.4e-67	1	1
ENSPKIP00000038823	Dus	PF01207.17	2.9e-64	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000019800	-	1162	-	ENSPKIP00000038805	349 (aa)	-	-
ENSPKIT00000019794	-	957	-	ENSPKIP00000038799	318 (aa)	-	-
ENSPKIT00000019819	-	1975	-	ENSPKIP00000038823	338 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000016429's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000016429's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000016429	dus4l	89	30.592	ENSPKIG00000009901	dus1l	67	35.329
ENSPKIG00000016429	dus4l	72	33.191	ENSPKIG00000021221	dus2	53	31.273

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSG00000105865	DUS4L	88	72.760	Homo_sapiens
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	83.214	ENSAPOG00000015063	dus4l	89	83.214	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSAMEG00000013535	DUS4L	87	72.760	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.500	ENSACIG00000017392	dus4l	89	82.500	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	83.571	ENSAOCG00000007191	dus4l	89	83.571	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	83.571	ENSAPEG00000015296	dus4l	89	83.571	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.429	ENSATEG00000009040	dus4l	89	81.429	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.665	ENSAPLG00000007641	DUS4L	92	73.665	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	74.733	ENSACAG00000015202	DUS4L	86	74.733	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSANAG00000037839	DUS4L	91	72.760	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.786	ENSACLG00000021844	dus4l	93	81.655	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	78.495	ENSAMXG00000032924	dus4l	93	78.495	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSBTAG00000021849	DUS4L	92	71.560	Bos_taurus
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	50.725	WBGene00016674	C45G9.2	97	50.725	Caenorhabditis_elegans
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSCJAG00000016323	DUS4L	88	72.401	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.043	ENSCAFG00000003919	DUS4L	88	72.043	Canis_familiaris
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.043	ENSCAFG00020023124	DUS4L	88	72.043	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000016429	dus4l	94	66.026	ENSCHIG00000010888	DUS4L	97	66.026	Capra_hircus
ENSPKIG00000016429	dus4l	94	66.026	ENSTSYG00000010065	DUS4L	98	66.026	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000016429	dus4l	94	49.686	ENSCAPG00000007215	DUS4L	99	56.679	Cavia_aperea
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSCPOG00000002384	DUS4L	88	72.760	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSCCAG00000027960	DUS4L	88	72.760	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSCATG00000031611	DUS4L	88	72.760	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	71.326	ENSCLAG00000012135	DUS4L	88	71.326	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.118	ENSCSAG00000011370	DUS4L	88	73.118	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000016429	dus4l	59	72.683	ENSCHOG00000006848	DUS4L	88	72.683	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	75.269	ENSCPBG00000000863	DUS4L	89	75.269	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000016429	dus4l	96	48.148	ENSCING00000001869	-	90	56.115	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000016429	dus4l	95	48.125	ENSCSAVG00000005308	-	90	55.839	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSCANG00000024456	DUS4L	88	72.760	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSCGRG00001014181	Dus4l	88	72.401	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSCGRG00000000384	Dus4l	88	72.401	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.500	ENSCSEG00000018179	dus4l	88	82.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.143	ENSCVAG00000010487	dus4l	88	82.143	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	79.643	ENSDARG00000006567	dus4l	91	79.643	Danio_rerio
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSDNOG00000030725	DUS4L	88	72.401	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.118	ENSDORG00000010587	Dus4l	88	73.118	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000016429	dus4l	96	38.209	FBgn0032750	CG10495	73	44.291	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000016429	dus4l	59	53.171	ENSETEG00000004577	-	90	53.171	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	59.857	ENSEBUG00000008924	dus4l	89	59.857	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000016429	dus4l	94	67.949	ENSEASG00005017480	DUS4L	98	67.949	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000016429	dus4l	94	67.308	ENSECAG00000014852	DUS4L	98	67.308	Equus_caballus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	80.645	ENSELUG00000017740	dus4l	87	80.645	Esox_lucius
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.043	ENSFCAG00000041439	DUS4L	88	72.043	Felis_catus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.665	ENSFALG00000010246	DUS4L	88	73.665	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.118	ENSFDAG00000010206	DUS4L	88	73.118	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.429	ENSFHEG00000020124	dus4l	89	81.429	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	79.211	ENSGMOG00000001452	dus4l	90	79.211	Gadus_morhua
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.835	ENSGALG00000023661	DUS4L	88	73.835	Gallus_gallus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	80.714	ENSGAFG00000010054	dus4l	89	80.714	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.071	ENSGACG00000008772	dus4l	88	81.071	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSGGOG00000003821	DUS4L	88	72.760	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.143	ENSHBUG00000015255	dus4l	89	82.143	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	70.609	ENSHGLG00000018976	DUS4L	88	70.609	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	70.609	ENSHGLG00100002604	DUS4L	88	70.609	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	78.571	ENSHCOG00000015919	dus4l	89	78.571	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	77.143	ENSIPUG00000014454	dus4l	93	77.143	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.835	ENSSTOG00000000212	DUS4L	88	73.835	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	71.326	ENSJJAG00000013626	Dus4l	91	71.326	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	81.655	ENSKMAG00000013719	dus4l	88	81.655	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.857	ENSLBEG00000018142	dus4l	89	82.857	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000016429	dus4l	63	75.879	ENSLACG00000000451	DUS4L	93	76.606	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.690	ENSLOCG00000015815	dus4l	87	81.690	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.043	ENSLAFG00000000968	DUS4L	88	72.043	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSMFAG00000003759	DUS4L	88	72.401	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSMNEG00000040594	DUS4L	88	72.760	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSMLEG00000037658	DUS4L	88	72.760	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.437	ENSMAMG00000007717	dus4l	80	82.437	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.362	ENSMZEG00005014697	dus4l	94	81.362	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000016429	dus4l	75	73.109	ENSMGAG00000009714	DUS4L	97	73.109	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSMAUG00000016651	Dus4l	88	72.760	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSMICG00000042944	-	88	72.760	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000016429	dus4l	78	70.213	ENSMICG00000027213	-	85	70.213	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	74.910	ENSMOCG00000019344	Dus4l	88	74.910	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	77.500	ENSMMOG00000011517	dus4l	89	77.500	Mola_mola
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	71.583	ENSMODG00000016361	DUS4L	88	71.583	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.429	ENSMALG00000002457	dus4l	88	81.429	Monopterus_albus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	MGP_CAROLIEiJ_G0017680	Dus4l	86	72.401	Mus_caroli
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSMUSG00000020648	Dus4l	86	72.401	Mus_musculus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	MGP_PahariEiJ_G0029438	Dus4l	86	72.760	Mus_pahari
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	MGP_SPRETEiJ_G0018522	Dus4l	86	72.760	Mus_spretus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.118	ENSMPUG00000018247	DUS4L	91	73.118	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000016429	dus4l	63	70.854	ENSMLUG00000002731	DUS4L	92	69.266	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.477	ENSNGAG00000022335	Dus4l	88	73.477	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.786	ENSNBRG00000013582	dus4l	89	81.786	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.118	ENSNLEG00000008716	DUS4L	88	73.118	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000016429	dus4l	59	56.915	ENSMEUG00000000187	-	96	56.915	Notamacropus_eugenii
ENSPKIG00000016429	dus4l	62	72.727	ENSOPRG00000005394	DUS4L	92	70.968	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	71.685	ENSODEG00000001582	DUS4L	88	71.685	Octodon_degus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.143	ENSONIG00000004993	dus4l	89	82.143	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	74.194	ENSOANG00000003179	DUS4L	91	74.194	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	73.741	ENSOCUG00000012784	DUS4L	88	73.741	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	83.571	ENSORLG00000008306	dus4l	88	83.571	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	83.571	ENSORLG00020020542	dus4l	88	83.571	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	83.571	ENSORLG00015001648	dus4l	88	83.571	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.857	ENSOMEG00000017582	dus4l	89	82.857	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSOGAG00000013113	DUS4L	87	72.401	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000016429	dus4l	94	66.346	ENSOARG00000005713	DUS4L	97	66.346	Ovis_aries
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSPPAG00000031482	DUS4L	88	72.760	Pan_paniscus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSPPRG00000010523	DUS4L	88	72.401	Panthera_pardus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSPTIG00000005318	DUS4L	88	72.401	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSPTRG00000019579	DUS4L	88	72.760	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSPANG00000007111	DUS4L	88	72.760	Papio_anubis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.477	ENSPSIG00000013488	DUS4L	89	73.477	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	80.000	ENSPMGG00000012731	dus4l	89	80.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.118	ENSPEMG00000022807	Dus4l	88	73.118	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	73.381	ENSPCIG00000005163	DUS4L	99	72.481	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.071	ENSPFOG00000004246	dus4l	88	81.071	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.071	ENSPLAG00000021398	dus4l	88	81.071	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.071	ENSPMEG00000010911	dus4l	88	81.071	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	80.714	ENSPREG00000021419	dus4l	89	80.714	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	70.968	ENSPPYG00000017901	DUS4L	88	70.968	Pongo_abelii
ENSPKIG00000016429	dus4l	50	88.235	ENSPCAG00000012668	-	55	88.235	Procavia_capensis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.401	ENSPCOG00000015747	DUS4L	88	72.401	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000016429	dus4l	96	48.923	ENSPVAG00000014548	DUS4L	76	70.813	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	81.655	ENSPNYG00000015730	dus4l	93	81.655	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000016429	dus4l	92	77.320	ENSPNAG00000021961	dus4l	92	80.287	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.118	ENSRNOG00000008155	Dus4l	87	73.118	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSRBIG00000025544	DUS4L	88	72.760	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSRROG00000000241	DUS4L	88	72.760	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000016429	dus4l	96	35.952	YLR405W	-	77	41.754	Saccharomyces_cerevisiae
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSSBOG00000025576	DUS4L	91	72.760	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	73.022	ENSSHAG00000012813	DUS4L	86	73.022	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	86.786	ENSSFOG00015005943	dus4l	92	86.786	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.786	ENSSMAG00000018502	dus4l	88	81.786	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000016429	dus4l	74	82.128	ENSSDUG00000002389	dus4l	50	82.101	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	82.857	ENSSLDG00000008740	dus4l	90	82.857	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.835	ENSSPUG00000019140	DUS4L	88	73.835	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	83.929	ENSSPAG00000020826	dus4l	89	83.929	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.760	ENSSSCG00000028433	DUS4L	91	73.047	Sus_scrofa
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	73.835	ENSTGUG00000003124	DUS4L	89	73.835	Taeniopygia_guttata
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	81.004	ENSTRUG00000016285	dus4l	91	81.004	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	51.351	ENSTBEG00000001401	DUS4L	80	59.216	Tupaia_belangeri
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	63.538	ENSTTRG00000006833	DUS4L	86	80.000	Tursiops_truncatus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.857	ENSUMAG00000018230	DUS4L	88	72.857	Ursus_maritimus
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	72.043	ENSVPAG00000008640	DUS4L	88	72.043	Vicugna_pacos
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	71.685	ENSVVUG00000021846	DUS4L	88	71.685	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000016429	dus4l	87	73.929	ENSXETG00000005925	dus4l	99	73.929	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000016429	dus4l	88	80.714	ENSXMAG00000008454	dus4l	90	80.714	Xiphophorus_maculatus