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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000019795 (Gene tree)
Gene ID: 111849884
Gene Symbol: tnpo1
Alias: -
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 36567 bases
Position: chrPGUA01000003.1:2965495-3002061
Accession: ZDB-GENE-080819-1
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000001583	IBN_N	PF03810.19	2.1e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000025505	-	2604	-	ENSPKIP00000001583	867 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000019795	tnpo1	97	80.920	ENSPKIG00000002899	-	99	81.227
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	82.658	ENSPKIG00000004824	tnpo2	99	82.658

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSG00000083312	TNPO1	100	95.337	Homo_sapiens
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.685	ENSAPOG00000003453	tnpo1	100	91.685	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.644	ENSAMEG00000007147	TNPO1	99	89.755	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000019795	tnpo1	87	89.664	ENSACIG00000003711	tnpo1	99	89.664	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.798	ENSAOCG00000008154	tnpo1	100	91.798	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.798	ENSAPEG00000001112	tnpo1	100	91.798	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.348	ENSATEG00000010408	tnpo1	100	91.348	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	86.246	ENSAPLG00000009619	-	97	87.041	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.112	ENSACAG00000009599	TNPO1	100	90.112	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	81.348	ENSANAG00000025351	-	99	81.348	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.337	ENSANAG00000022453	-	99	90.337	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	88.989	ENSACLG00000027223	tnpo1	100	88.989	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.143	ENSAMXG00000009842	tnpo1	100	90.471	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	ENSBTAG00000007979	TNPO1	99	90.449	Bos_taurus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	ENSCJAG00000016409	TNPO1	99	90.449	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	90.548	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	90.548	Canis_familiaris
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	87.978	ENSCAFG00020017397	TNPO1	100	87.978	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.337	ENSCHIG00000023462	TNPO1	99	90.337	Capra_hircus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	88.826	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	91.145	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.337	ENSCCAG00000026472	TNPO1	100	90.337	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSCATG00000043792	TNPO1	100	90.562	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.112	ENSCLAG00000016191	TNPO1	100	90.112	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSCSAG00000015616	TNPO1	99	90.562	Chlorocebus_sabaeus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	94	77.830	ENSCHOG00000001746	TNPO1	99	77.830	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.899	ENSCPBG00000000260	TNPO1	94	90.899	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	72.727	ENSCSAVG00000010981	-	99	72.615	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSCANG00000004353	TNPO1	99	90.562	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	99	90.562	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	90.760	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	90.760	Cricetulus_griseus_crigri
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.112	ENSCSEG00000012674	tnpo1	100	90.112	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSCVAG00000001010	tnpo1	100	90.562	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.246	ENSDARG00000035390	tnpo1	100	90.909	Danio_rerio
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	84.770	ENSDNOG00000006647	TNPO1	99	84.770	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	93	90.361	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	90.350	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	56.059	FBgn0035693	CG8219	99	55.832	Drosophila_melanogaster
ENSPKIG00000019795	tnpo1	86	95.131	ENSETEG00000017805	TNPO1	89	95.131	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000019795	tnpo1	94	81.429	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	81.429	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSEASG00005018055	TNPO1	100	90.562	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.787	ENSECAG00000024424	TNPO1	99	90.787	Equus_caballus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	84.641	ENSELUG00000002821	tnpo1	100	83.948	Esox_lucius
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSFCAG00000013181	TNPO1	100	90.562	Felis_catus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSFALG00000010292	TNPO1	100	90.562	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.225	ENSFDAG00000013345	TNPO1	99	90.225	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.797	ENSFHEG00000019234	tnpo1	100	90.797	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	88.354	ENSGMOG00000000347	tnpo1	99	88.354	Gadus_morhua
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.663	ENSGALG00000015014	TNPO1	100	89.663	Gallus_gallus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.359	ENSGAFG00000000943	tnpo1	100	89.910	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.124	ENSGACG00000015841	tnpo1	99	91.124	Gasterosteus_aculeatus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.787	ENSGAGG00000013419	TNPO1	100	90.787	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSGGOG00000026800	TNPO1	100	90.562	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	75.224	ENSGGOG00000022535	-	98	74.888	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.674	ENSHBUG00000008068	tnpo1	100	90.674	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.888	ENSHGLG00000000970	-	99	89.888	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000019795	tnpo1	97	71.260	ENSHGLG00100000963	-	99	70.789	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	89.953	ENSHGLG00100017090	-	99	89.953	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.674	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	97	90.674	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.236	ENSKMAG00000018195	tnpo1	100	91.236	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	90	88.039	ENSLBEG00000009521	tnpo1	96	87.423	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	84.535	ENSLACG00000012199	TNPO1	100	84.535	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	92.472	ENSLOCG00000011092	tnpo1	97	92.472	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	97	89.954	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	89.954	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSMFAG00000003636	TNPO1	99	90.562	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	ENSMMUG00000020923	TNPO1	99	90.519	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSMNEG00000044581	TNPO1	99	90.562	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSMLEG00000030740	TNPO1	99	90.562	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.573	ENSMAMG00000001357	tnpo1	100	91.573	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.337	ENSMZEG00005004913	tnpo1	100	90.337	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	99	90.562	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	88.431	ENSMICG00000008468	TNPO1	99	88.431	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	99	90.562	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000019795	tnpo1	87	90.206	ENSMMOG00000005551	tnpo1	99	89.691	Mola_mola
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	95.319	ENSMODG00000001721	TNPO1	80	95.319	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.001	ENSMALG00000009782	tnpo1	100	91.001	Monopterus_albus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.337	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	100	90.337	Mus_caroli
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	100	90.562	Mus_musculus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	100	89.963	Mus_pahari
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	100	90.087	Mus_spretus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	ENSMPUG00000014387	TNPO1	99	90.449	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	90.105	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	90.105	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	99	90.562	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000019795	tnpo1	87	89.793	ENSNBRG00000009998	tnpo1	99	89.793	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSNLEG00000004572	TNPO1	100	90.562	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000019795	tnpo1	90	88.957	ENSOPRG00000012390	TNPO1	89	88.934	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.888	ENSODEG00000001771	TNPO1	99	89.888	Octodon_degus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	89.955	ENSONIG00000011151	tnpo1	99	89.955	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	92	90.610	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	90.610	Ornithorhynchus_anatinus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	84.463	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	84.463	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	86	90.013	ENSORLG00000003182	tnpo1	99	90.013	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	90.868	ENSORLG00020011559	tnpo1	99	90.868	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	91.094	ENSORLG00015019113	tnpo1	99	91.094	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000019795	tnpo1	99	90.755	ENSOMEG00000014567	tnpo1	99	90.755	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSOGAG00000000808	TNPO1	99	90.562	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	ENSOARG00000005038	TNPO1	84	90.449	Ovis_aries
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSPPAG00000042518	TNPO1	99	90.562	Pan_paniscus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSPPRG00000022336	TNPO1	100	90.562	Panthera_pardus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSPTIG00000018839	TNPO1	100	90.562	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSPTRG00000016972	TNPO1	99	90.562	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000019795	tnpo1	94	78.039	ENSPTRG00000047731	-	100	77.624	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.562	ENSPANG00000006074	TNPO1	99	90.562	Papio_anubis
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.011	ENSPSIG00000014366	TNPO1	99	91.011	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	87.654	ENSPMGG00000017014	tnpo1	100	87.654	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	90.760	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	90.760	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	91.124	ENSPCIG00000026080	TNPO1	100	91.124	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.705	ENSPFOG00000011447	tnpo1	100	90.705	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.705	ENSPLAG00000018696	tnpo1	100	90.705	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.899	ENSPMEG00000024121	tnpo1	100	90.899	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.695	ENSPREG00000020705	tnpo1	100	90.135	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000019795	tnpo1	100	90.449	ENSPPYG00000015545	TNPO1	99	90.449	Pongo_abelii
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