EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000020548 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8913 bases
Position: chrPGUA01000490.1:79250-88162
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000002792	RVT_1	PF00078.27	4.8e-42	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000026744	-	1131	-	ENSPKIP00000002792	376 (aa)	-	-

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSPKIG00000020548	-	87	100.000	ENSPKIG00000019910	-	75	100.000
ENSPKIG00000020548	-	62	34.025	ENSPKIG00000025243	-	51	34.025
ENSPKIG00000020548	-	77	86.207	ENSPKIG00000025410	-	74	86.207
ENSPKIG00000020548	-	52	88.776	ENSPKIG00000017464	-	58	88.776
ENSPKIG00000020548	-	59	86.937	ENSPKIG00000006601	-	51	86.937
ENSPKIG00000020548	-	52	37.000	ENSPKIG00000003654	-	55	32.463
ENSPKIG00000020548	-	67	85.433	ENSPKIG00000018399	-	63	85.433
ENSPKIG00000020548	-	78	33.444	ENSPKIG00000016626	-	68	33.444
ENSPKIG00000020548	-	78	33.444	ENSPKIG00000003826	-	50	33.444
ENSPKIG00000020548	-	52	84.184	ENSPKIG00000011487	-	87	84.184
ENSPKIG00000020548	-	67	87.795	ENSPKIG00000005006	-	73	87.795
ENSPKIG00000020548	-	79	32.680	ENSPKIG00000024981	-	53	32.680

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000020548	-	74	35.088	ENSAPEG00000014494	-	62	35.088	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000020548	-	67	37.209	ENSACLG00000026307	-	69	37.209	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	90	31.304	ENSACLG00000006988	-	50	31.304	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	85	33.033	ENSACLG00000027577	-	54	33.033	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	76	34.028	ENSACLG00000016956	-	51	34.028	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	72	33.700	ENSACLG00000015445	-	72	33.700	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	85	33.033	ENSACLG00000020849	-	50	33.033	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	68	34.766	ENSACLG00000021422	-	64	34.766	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	75	34.589	ENSACLG00000005509	-	65	34.589	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	83	36.145	ENSACLG00000009848	-	74	36.145	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	84	33.742	ENSACLG00000000579	-	52	33.333	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	80	33.333	ENSACLG00000020009	-	52	33.333	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	71	35.424	ENSACLG00000026433	-	61	35.424	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	90	31.594	ENSACLG00000004613	-	82	31.594	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	90	31.884	ENSACLG00000016231	-	58	31.884	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	76	38.255	ENSACLG00000000505	-	84	38.255	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	74	34.752	ENSACLG00000023788	-	55	34.752	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	67	39.453	ENSACLG00000023590	-	51	39.453	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	63	35.000	ENSACLG00000019219	-	53	35.000	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	85	35.030	ENSACLG00000008558	-	70	35.030	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	74	37.500	ENSACLG00000008551	-	51	37.500	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	84	36.527	ENSACLG00000017241	-	54	36.527	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	64	35.102	ENSACLG00000016290	-	78	35.102	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000020548	-	72	34.559	ENSAMXG00000035582	-	53	34.559	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000020548	-	79	48.148	ENSCPBG00000025030	-	57	48.148	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	62	51.931	ENSCPBG00000010221	-	78	51.931	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	95	44.722	ENSCPBG00000004450	-	99	44.722	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	86	46.319	ENSCPBG00000002764	-	59	46.319	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	77	50.694	ENSCPBG00000019838	-	81	50.694	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	89	47.368	ENSCPBG00000013338	-	91	47.368	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	84	47.352	ENSCPBG00000022715	-	70	47.352	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	94	45.251	ENSCPBG00000002205	-	99	45.251	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	65	50.407	ENSCPBG00000022391	-	86	50.407	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	92	43.429	ENSCPBG00000006651	-	92	43.429	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	84	47.785	ENSCPBG00000003209	-	100	47.785	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	81	44.625	ENSCPBG00000001898	-	99	44.625	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	86	45.231	ENSCPBG00000022940	-	52	45.231	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	88	44.611	ENSCPBG00000015885	-	99	44.611	Chrysemys_picta_bellii
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ENSPKIG00000020548	-	84	45.912	ENSCPBG00000024353	-	63	45.912	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	85	44.892	ENSCPBG00000010408	-	65	44.892	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	84	47.040	ENSCPBG00000001408	-	73	47.040	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	78	44.444	ENSCPBG00000007311	-	98	44.444	Chrysemys_picta_bellii
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ENSPKIG00000020548	-	84	47.468	ENSCPBG00000005177	-	84	47.468	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000020548	-	51	34.010	ENSEBUG00000005769	-	66	34.010	Eptatretus_burgeri
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ENSPKIG00000020548	-	82	36.688	ENSEBUG00000006081	-	82	36.688	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000020548	-	70	33.210	ENSFHEG00000011635	-	64	33.210	Fundulus_heteroclitus
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ENSPKIG00000020548	-	87	34.118	ENSKMAG00000020993	-	80	34.118	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000020548	-	86	32.635	ENSLBEG00000007558	-	87	32.635	Labrus_bergylta
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ENSPKIG00000020548	-	75	34.965	ENSLBEG00000007826	-	73	34.965	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000020548	-	68	33.463	ENSLBEG00000003172	-	53	33.463	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000020548	-	86	32.635	ENSLBEG00000018374	-	50	32.635	Labrus_bergylta
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