EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSPKIG00000022550 (Gene tree)
Gene ID: 111836866
Gene Symbol: xpo6
Alias: -
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Paramormyrops_kingsleyae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 22511 bases
Position: chrPGUA01000059.1:1467183-1489693
Accession: 111836866
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSPKIP00000006264	Xpo1	PF08389.12	2e-21	1	1
ENSPKIP00000006221	Xpo1	PF08389.12	6.7e-21	1	1
ENSPKIP00000006264	IBN_N	PF03810.19	4.7e-09	1	1
ENSPKIP00000006221	IBN_N	PF03810.19	4.9e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSPKIT00000030242	-	5548	-	ENSPKIP00000006221	1147 (aa)	XP_023654269	UPI000CD65F6F
ENSPKIT00000030286	-	3363	-	ENSPKIP00000006264	1120 (aa)	-	-

Gene Model

Click here to download ENSPKIG00000022550's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSPKIG00000022550's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSG00000169180	XPO6	100	95.238	Homo_sapiens
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.427	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	81.889	Acanthochromis_polyacanthus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.715	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	79.715	Ailuropoda_melanoleuca
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.004	ENSACIG00000008055	xpo6	99	82.004	Amphilophus_citrinellus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	83.497	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	83.497	Amphiprion_ocellaris
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	83.408	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	83.408	Amphiprion_percula
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	82.261	ENSATEG00000002273	xpo6	100	82.535	Anabas_testudineus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	81.317	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	81.317	Anas_platyrhynchos
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	71.150	ENSACAG00000016883	XPO6	100	71.150	Anolis_carolinensis
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.000	ENSANAG00000031761	XPO6	100	80.000	Aotus_nancymaae
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.500	ENSACLG00000007048	xpo6	99	82.500	Astatotilapia_calliptera
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	76.108	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	76.228	Astyanax_mexicanus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.378	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	79.378	Bos_taurus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	80.178	Callithrix_jacchus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.982	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	79.982	Canis_familiaris
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.911	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	79.911	Canis_lupus_dingo
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.644	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	79.644	Capra_hircus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	76.271	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	76.271	Carlito_syrichta
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.911	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	79.911	Cavia_porcellus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	80.089	Cebus_capucinus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSCATG00000034030	XPO6	100	80.178	Cercocebus_atys
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.804	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	79.804	Chinchilla_lanigera
ENSPKIG00000022550	xpo6	91	78.941	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	78.941	Choloepus_hoffmanni
ENSPKIG00000022550	xpo6	82	91.176	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	91.176	Chrysemys_picta_bellii
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	46.444	ENSCING00000006884	-	99	46.444	Ciona_intestinalis
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	44.675	ENSCSAVG00000000850	-	99	44.675	Ciona_savignyi
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSCANG00000041578	XPO6	100	80.089	Colobus_angolensis_palliatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.733	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	79.733	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.159	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	82.159	Cynoglossus_semilaevis
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.729	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	81.802	Cyprinodon_variegatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	97	74.639	ENSDARG00000041217	xpo6	99	74.639	Danio_rerio
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.911	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	79.911	Dasypus_novemcinctus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.733	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	79.733	Dipodomys_ordii
ENSPKIG00000022550	xpo6	83	79.923	ENSETEG00000018768	XPO6	85	79.923	Echinops_telfairi
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	61.586	ENSEBUG00000015560	xpo6	100	61.586	Eptatretus_burgeri
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.000	ENSEASG00005017296	XPO6	100	80.000	Equus_asinus_asinus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSECAG00000008601	XPO6	100	80.178	Equus_caballus
ENSPKIG00000022550	xpo6	97	74.152	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	74.152	Erinaceus_europaeus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	83.160	ENSELUG00000009159	xpo6	100	83.073	Esox_lucius
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.911	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	79.911	Felis_catus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.475	ENSFALG00000004441	XPO6	98	80.759	Ficedula_albicollis
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.160	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	80.160	Fukomys_damarensis
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	79.948	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	80.762	Fundulus_heteroclitus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	81.067	ENSGALG00000035360	XPO6	100	81.067	Gallus_gallus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	79.913	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	79.861	Gambusia_affinis
ENSPKIG00000022550	xpo6	94	80.300	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	80.300	Gopherus_agassizii
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	80.089	Gorilla_gorilla
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.590	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	81.353	Haplochromis_burtoni
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.267	ENSHGLG00000009679	-	100	80.267	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000022550	xpo6	86	74.772	ENSHGLG00000003865	-	96	74.772	Heterocephalus_glaber_female
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.142	ENSHGLG00100003673	-	100	80.142	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000022550	xpo6	94	67.035	ENSHGLG00100001081	-	99	67.675	Heterocephalus_glaber_male
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.829	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	80.729	Hippocampus_comes
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	75.347	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	76.253	Ictalurus_punctatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.448	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	79.378	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.218	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	79.218	Jaculus_jaculus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.163	ENSKMAG00000010403	xpo6	100	81.163	Kryptolebias_marmoratus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.417	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	82.417	Labrus_bergylta
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.822	ENSLACG00000017930	XPO6	100	79.822	Latimeria_chalumnae
ENSPKIG00000022550	xpo6	94	86.586	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	86.555	Lepisosteus_oculatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.359	ENSLAFG00000011960	XPO6	100	79.359	Loxodonta_africana
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	80.178	Macaca_fascicularis
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	80.178	Macaca_mulatta
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	80.178	Macaca_nemestrina
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	80.178	Mandrillus_leucophaeus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.153	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	81.300	Mastacembelus_armatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.589	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	82.589	Maylandia_zebra
ENSPKIG00000022550	xpo6	97	80.219	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	80.219	Meleagris_gallopavo
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	70.945	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	70.677	Mesocricetus_auratus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.822	ENSMICG00000001923	XPO6	100	79.822	Microcebus_murinus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.556	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	79.556	Microtus_ochrogaster
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.977	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	82.977	Mola_mola
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.356	ENSMODG00000015516	XPO6	100	80.356	Monodelphis_domestica
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	74.468	ENSMALG00000020612	xpo6	99	74.515	Monopterus_albus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.733	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	80.822	Mus_caroli
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.644	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	79.644	Mus_musculus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.733	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	79.733	Mus_pahari
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.733	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	79.733	Mus_spretus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.071	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	80.071	Mustela_putorius_furo
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	78.826	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	78.826	Myotis_lucifugus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.644	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	79.644	Nannospalax_galili
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.677	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	81.440	Neolamprologus_brichardi
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	80.089	Nomascus_leucogenys
ENSPKIG00000022550	xpo6	87	78.102	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	78.102	Ochotona_princeps
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.822	ENSODEG00000012917	XPO6	100	79.822	Octodon_degus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.590	ENSONIG00000019366	xpo6	100	81.353	Oreochromis_niloticus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.982	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	79.982	Oryctolagus_cuniculus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	79.394	ENSORLG00000011231	xpo6	100	79.307	Oryzias_latipes
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.804	ENSORLG00020000386	xpo6	99	80.804	Oryzias_latipes_hni
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	79.740	ENSORLG00015003636	xpo6	100	79.654	Oryzias_latipes_hsok
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.035	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	79.654	Oryzias_melastigma
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.982	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	79.982	Otolemur_garnettii
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.626	ENSOARG00000000960	XPO6	100	79.626	Ovis_aries
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	80.089	Pan_paniscus
ENSPKIG00000022550	xpo6	98	79.658	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	79.658	Panthera_pardus
ENSPKIG00000022550	xpo6	96	78.637	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	78.637	Panthera_tigris_altaica
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	80.089	Pan_troglodytes
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSPANG00000017103	XPO6	100	80.178	Papio_anubis
ENSPKIG00000022550	xpo6	98	79.676	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	79.676	Pelodiscus_sinensis
ENSPKIG00000022550	xpo6	98	81.998	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	81.998	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.644	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	79.644	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	70.775	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	70.775	Petromyzon_marinus
ENSPKIG00000022550	xpo6	97	79.670	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	79.437	Phascolarctos_cinereus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.104	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	80.052	Poecilia_formosa
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.087	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	80.035	Poecilia_latipinna
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.000	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	79.948	Poecilia_mexicana
ENSPKIG00000022550	xpo6	97	79.982	ENSPREG00000016421	xpo6	96	79.929	Poecilia_reticulata
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.000	ENSPPYG00000007218	XPO6	100	80.000	Pongo_abelii
ENSPKIG00000022550	xpo6	90	81.395	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	81.395	Procavia_capensis
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.911	ENSPCOG00000017886	XPO6	100	79.911	Propithecus_coquereli
ENSPKIG00000022550	xpo6	80	94.203	ENSPVAG00000012234	XPO6	80	94.203	Pteropus_vampyrus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	82.562	ENSPNYG00000008375	xpo6	100	82.562	Pundamilia_nyererei
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	75.847	ENSPNAG00000008284	xpo6	100	75.986	Pygocentrus_nattereri
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.378	ENSRNOG00000016722	Xpo6	100	79.378	Rattus_norvegicus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.178	ENSRBIG00000031469	XPO6	100	80.178	Rhinopithecus_bieti
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSRROG00000044864	XPO6	100	80.089	Rhinopithecus_roxellana
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSSBOG00000027650	XPO6	100	80.089	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.444	ENSSHAG00000013864	XPO6	100	80.444	Sarcophilus_harrisii
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	85.307	ENSSFOG00015009347	xpo6	100	85.307	Scleropages_formosus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.520	ENSSMAG00000010566	xpo6	99	82.191	Scophthalmus_maximus
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	82.109	ENSSDUG00000017294	xpo6	99	82.543	Seriola_dumerili
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	81.936	ENSSLDG00000006580	xpo6	99	82.453	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSPKIG00000022550	xpo6	93	80.220	ENSSARG00000013120	XPO6	93	80.220	Sorex_araneus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.356	ENSSPUG00000009217	XPO6	100	80.356	Sphenodon_punctatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	83.679	ENSSPAG00000009469	xpo6	99	83.679	Stegastes_partitus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	80.089	ENSSSCG00000007812	XPO6	100	80.089	Sus_scrofa
ENSPKIG00000022550	xpo6	87	80.754	ENSTGUG00000003781	XPO6	100	80.754	Taeniopygia_guttata
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.640	ENSTRUG00000004696	xpo6	100	80.382	Takifugu_rubripes
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	81.126	ENSTNIG00000018949	xpo6	99	80.465	Tetraodon_nigroviridis
ENSPKIG00000022550	xpo6	93	91.852	ENSTBEG00000009945	XPO6	93	91.852	Tupaia_belangeri
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.715	ENSTTRG00000009558	XPO6	100	79.715	Tursiops_truncatus
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	78.136	ENSUMAG00000007086	XPO6	99	78.136	Ursus_maritimus
ENSPKIG00000022550	xpo6	91	94.118	ENSVPAG00000008493	XPO6	94	94.118	Vicugna_pacos
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.911	ENSVVUG00000024150	XPO6	100	79.911	Vulpes_vulpes
ENSPKIG00000022550	xpo6	99	77.176	ENSXETG00000010326	xpo6	99	77.176	Xenopus_tropicalis
ENSPKIG00000022550	xpo6	100	80.346	ENSXMAG00000011630	xpo6	100	80.295	Xiphophorus_maculatus